生物信息与育种

涉及生物信息，动植物组装，群体遗传，比较基因组，多组学整合，数量遗传，育种数据分析，机器学习等。专注于动植物领域的生信个性化分析，感兴趣请咨询MiyuanBiotech

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5小时前

黄三文院士领衔植物星球计划（PLANeT）发表Cell

陆地植物约有45万个物种，构成了陆地生态系统的根基，也支撑着人类文明。从不足0.1Gb到超过160Gb的基因组大小，从以单倍体配子体为主到以二倍体孢子体为主的生活史，从根、...

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6小时前

两个育种项目数据一合并，基因组预测精度提升了13%

分享近期一篇发表在 Communications Biology 上比较接地气的文章：Large scale wheat data integration improves...

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3天前

“科学狂人”文特尔去世：他曾单挑六国、扮演上帝、改写生命密码，却没等到和辛顿的下一场革命

4月29日，79岁的克雷格·文特尔（J. Craig Venter）在圣地亚哥一家医院去世，离世之前他刚刚确诊癌症，治疗中出现了意外副作用。他创办的JCVI研究所发布了讣告...

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3天前

全基因组重测序及群体遗传与进化分析技术服务指南

全基因组重测序（Whole Genome Resequencing, WGRS）是对已知参考基因组序列的物种进行个体或群体测序，通过与参考图谱比对，全景式鉴定单核苷酸多态性...

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4天前

GAPIT第4版发表！新方法将GWAS整合到基因组选择（GS/GP）中

近期，张志武&王嘉博老师在Molecular Biology and Evolution上发表GAPIT Version 4。 GAPIT 第4版的核心是将全基因组关联分析...

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4天前

谢华安&韩斌院士等联合撰文：中国三系杂交水稻的五十年，产量、品质与抗性持续提升

中国是全球首个成功实现杂交水稻商业化应用的国家。自1964年袁隆平院士团队开启水稻雄性不育研究，到1970年发现野败型不育系，再到1973年三系杂交体系正式建立，这项技术在...

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6天前

JIPB | 一个表观多组学整合分析与可视化工具OmicsCanvas

近日, 福建农林大学顾连峰团队在JIPB发表了题为“OmicsCanvas: A multi-omics platform for integration and visu...

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9天前

【项目案例】超级杂交稻Y900亲本基因组组装与杂种优势分子机制解析

今日分享一个我们团队创始人数年前在Plant Physiology发表的一项研究：Genetic basis of heterosis in rice: insights ...

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11天前

生物信息学的下一步：不只是处理数据，而是发现规律

最近读到国家生物信息中心章张研究员发表在《Fundamental Research》的一篇观点文章，讨论生物信息学如何推动生物学研究范式的转变。内容扎实，视角独特，值得同行...

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12天前

看CIMMYT全球小麦项目如何将基因组工具融入常规育种中？

近期，国际玉米小麦改良中心（CIMMYT）小麦分子育种主管 Susanne Dreisigacker 博士做了一个关于在 CIMMYT 全球小麦项目中常规应用基因组工具的演...

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16天前

植物基因组遗传冗余：从功能解析到育种应用的新思路

基因重复是植物基因组的一个显著特征。大量研究表明，植物基因组中50%至90%的基因属于可能发生功能冗余的基因家族。在多倍体作物中，这一比例往往超过90%。这种冗余现象使得单...

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18天前

AIGP：自动化可解释的人工智能基因组预测

近日，中国农业大学胡晓湘/王宇哲团队在经典期刊Genome Research上发表题为“Automated interpretable artificial intelli...

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19天前

基于上万份大豆种质构建的智能育种平台SSBP

近日，南京农业大学刘金定&窦道龙等研究成果SSBP: A meta-GWAS-based pleiotropy-aware QTL atlas and smart bree...

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20天前

面试了这么多生信工程师，我主要看这几点

最近一直在忙，但之前立的这个 flag 还是要补上，毕竟金三银四也快过去了。从科研到打工，再到带团队，最后出来自己做，我在生信这一行前后十多年，面过的人不算少，也接触过各...

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23天前

融合GWAS权重与Transformer架构（GP-WAITER），作物复杂性状预测准确率提升77.5%

在作物育种中，解析基因型与表型之间的关系是实现精准分子育种的核心挑战。然而，复杂性状往往由众多微效基因控制，传统统计模型和现有深度学习方法在捕捉长程基因组依赖、处理超高维数...

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24天前

AI如何加速作物育种周期：从经验驱动转向数据驱动的范式演进

在近日《Seed World》发布的技术评述中，针对人工智能（AI）如何深度嵌入育种全流程进行了系统性探讨。当前，作物育种正经历从“经验科学”向“智能驱动”的第五次革命（B...

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25天前

当作物生长模型遇上基因组选择：1+1 > 2 的育种新范式

分享去年发表在Plant Phenomics上的一篇文章：Integrating crop models, single nucleotide polymorphism, ...

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26天前

论文即代码，大模型能否根据文献直接生成可用算法？

科学计算领域长期存在一个矛盾：论文里的方法描述越精炼，复现它的代码就越难写。依赖冲突、版本迭代、边界条件修复，这些工程开销往往远超算法本身的设计成本。然而算法的核心思想往往...

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1月前

【项目案例】7个主流基因组选择（GS）算法，直接套用你的数据发表文章

前段时间有朋友让我们帮忙复现一篇文章中的GS方法，并提供定制化代码：详见上期：【项目案例】定制7种常见基因组选择（GS）模型的核心代码。我们想反正都是主流算法，写完了不用...

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1月前

没有基因型，仅用育种值和气象数据建模也发表了一区top？

这是一篇2024年发表于《Agricultural and Forest Meteorology》（农林科学一区top）的论文：Prediction of maize cu...

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2022-09-16