生物信息与育种

涉及生物信息，动植物组装，群体遗传，比较基因组，多组学整合，数量遗传，育种数据分析，机器学习等。专注于动植物领域的生信个性化分析，感兴趣请咨询MiyuanBiotech

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6小时前

面试了这么多生信工程师，我主要看这几点

最近一直在忙，但之前立的这个 flag 还是要补上，毕竟金三银四也快过去了。从科研到打工，再到带团队，最后出来自己做，我在生信这一行前后十多年，面过的人不算少，也接触过各...

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3天前

融合GWAS权重与Transformer架构（GP-WAITER），作物复杂性状预测准确率提升77.5%

在作物育种中，解析基因型与表型之间的关系是实现精准分子育种的核心挑战。然而，复杂性状往往由众多微效基因控制，传统统计模型和现有深度学习方法在捕捉长程基因组依赖、处理超高维数...

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4天前

AI如何加速作物育种周期：从经验驱动转向数据驱动的范式演进

在近日《Seed World》发布的技术评述中，针对人工智能（AI）如何深度嵌入育种全流程进行了系统性探讨。当前，作物育种正经历从“经验科学”向“智能驱动”的第五次革命（B...

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5天前

当作物生长模型遇上基因组选择：1+1 > 2 的育种新范式

分享去年发表在Plant Phenomics上的一篇文章：Integrating crop models, single nucleotide polymorphism, ...

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6天前

论文即代码，大模型能否根据文献直接生成可用算法？

科学计算领域长期存在一个矛盾：论文里的方法描述越精炼，复现它的代码就越难写。依赖冲突、版本迭代、边界条件修复，这些工程开销往往远超算法本身的设计成本。然而算法的核心思想往往...

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9天前

【项目案例】7个主流基因组选择（GS）算法，直接套用你的数据发表文章

前段时间有朋友让我们帮忙复现一篇文章中的GS方法，并提供定制化代码：详见上期：【项目案例】定制7种常见基因组选择（GS）模型的核心代码。我们想反正都是主流算法，写完了不用...

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10天前

没有基因型，仅用育种值和气象数据建模也发表了一区top？

这是一篇2024年发表于《Agricultural and Forest Meteorology》（农林科学一区top）的论文：Prediction of maize cu...

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10天前

基因组选择/预测（GS）在DUS测试中能做什么？

分享一篇近期发表在老牌期刊Theoretical and Applied Genetics上的一篇文章：Integrating genomic prediction int...

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10天前

现代杂交玉米育种过程中基因与等位基因表达的动态变化

近期，中国农业科学院作物科学研究所联合北大荒垦丰种业在Plant Biotechnology Journal发表了题为“Dynamics of gene and allel...

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1月前

如何实现分子遗传学与植物育种学的融合？

分享一篇2025年发表于 Plant Physiology的综述：Integrating molecular genetics with plant breeding to...

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1月前

农业机理模型知多少？

农业机理模型体系分类与核心模型对比分析农业机理模型作为农业数字化的核心技术支撑，以植物生理学、土壤物理学、大气动力学等经典理论为基础，从第一性原理完成农业生产系统的数学重...

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1月前

多个基因组选择模型该如何加权集成？

近日，澳大利亚昆士兰大学Mark Cooper 教授团队在 bioRxiv 上发表了题为“Improved Ensemble Performance by Weight O...

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1月前

李家洋&钱前院士综述Rice2035：水稻研究与育种的十年愿景

近期，李家洋和钱前院士团队联合在Molecular Plant上发表题为“Rice2035: A decadal vision for rice research and ...

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2月前

李恒Nature见刊！hifiasm（ONT only）实现T2T基因组组装

前言 2025年4月17日，生信大牛李恒团队在预印本上发表成果：Efficient near telomere-to-telomere assembly of Nanopo...

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2月前

Advanced Genetics｜作物杂种优势遗传机理的定量解析

杂种优势（Heterosis）是指F₁杂交后代在形态、生理或化学性状上优于其亲本的生物学现象，在自然界中广泛存在。查尔斯·达尔文在约150年前，首次对植物的杂种优势进行了科...

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1年前

科沃斯（KWS）玉米全程种植田间管理手册

科沃斯（KWS）玉米全程种植田间管理手册；科沃斯（KWS）玉米全程种植田间管理手册；科沃斯（KWS）玉米全程种植田间管理手册...

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2年前

关于水稻SNP的填充面板（Imputation Panel）

最近在想，水稻起码已经测序了上万份材料，为什么还没有开发出一个像样的imputation panel...

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3年前

【动植物研究动态】202209-202210文献解读

很久没有更新了。感谢各位，我还在，来填坑。 Communications Biology｜浙江省农业...

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3年前

R如何输出001,002,003等序号/编号？

需求 R默认带文本的编号不是按数字来排序的，这会对数据排序造成一定影响。如paste0("sampl...

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2022-09-16