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慢性肾脏病是全球高发的慢性疾病，以肾功能渐进性减退为特征，不仅影响泌尿系统，更会引发全身免疫紊乱与代谢异常，显著增加多种并发症风险 。而口腔鳞状细胞癌作为口腔癌中最常见的类...

单细胞测序技术近年来在生命科学研究中迅速崛起，成为揭示生物复杂性的重要工具。与传统测序方法不同，单细胞测序能够在单个细胞水平上解析基因表达、遗传变异和细胞状态的异质性，从而...

在单细胞研究中，如何准确地将癌细胞从复杂的细胞群体中注释出来，是一个重大挑战。批量测序在面对高度异质性的肿瘤样本时，对此无能为力。解决问题的关键，往往在于癌细胞独特的基因组...

圆锥角膜（KC）是一种常见的角膜扩张性疾病，也是全球角膜移植的主要原因，而其发病机制目前尚不完全清楚。为揭示其发病机理，上海第九人民医院眼科团队联合纽科生物团队对这一难题展...

角膜是眼屈光面的重要组成部分，它为视网膜成像提供了最重要的屈光能力，也保护了眼内组织免受外部损伤。当角膜受伤之后，人体会启动复杂的角膜基质再生过程，而在基质再生的过程中，很...

胃癌一直是全球范围内致死率极高的恶性肿瘤之一，尽管近年来治疗手段不断进步，但对于中晚期胃癌患者来说，整体预后仍不理想。...

乳腺癌是全球女性健康的主要威胁，而现如今乳腺癌的治疗方式已经显著进步。对于接受化疗的乳腺癌患者，她们往往会遇上新的困境，面临来自心血管疾病的并发症的威胁。化疗药物可诱导各种...

还在为代谢组数据存储和共享发愁？本文为你带来最全上传指南——从注册账号、填写元数据，到数据上传、审核反馈，一步步教你获得专属DOI号，让数据可追溯、可引用！...

《Cell Metabolism》文章fig 2E的多组配对连线散点图展示了iWAT中5个感兴趣基因（Ucp1、Cidea、Fasn、Acacb、Adrb3）的相对表达水平...

基因排序点图是基因表达分析的可视化利器。它按基因倍数变化从大到小排序，清晰呈现表达差异显著的基因。结合颜色编码 p 值，可直观判断基因表达变化的统计学意义，助力高效筛选关键...

生信入门第十三课：为了确保论文的可重复性和正确性，需要上传fastq文件，本文介绍了RNA-seq原始数据上传到GEO数据库详细步骤。...

将上调和下调pathway富集结果以双向条形图的形式在一张图中展示，不仅优化了绘图空间，还通过对称布局增强了图片的美观性。...

生信入门第十二课：简要介绍了用Cytoscape绘制PPI网络图并使用cytohubba识别hub基因。...

火山图通常使用三种颜色分别表示显著上调，显著下调和不显著。通过为特定的数据点添加另一种颜色，可以创建双色或四色火山图，从而更直观地突出感兴趣的数据点。...

下方X轴展示富集结果p值，上方X轴以不同的颜色展示基因数。这种双X轴的展示方法不仅避免了图表的单一性，还使得富集结果的展示更为精确和直观。...

最近在进行ac4C-seq数据分析时，从GEO上下载了Cell文章的原始数据，发现GSM2724031这个原始文件的Q30竟然是100%。于是总结下，供大家参考。...

分子相互作用网络图揭示了细胞内部分子间的复杂相互作用。通过识别网络中密集连接的节点所形成的社区，可以揭示它们之间以前未知的功能联系。这些社区可能代表了具有共同功能的功能模块...

CRediT是一种为论文署名诚信问题提供解决方案的分类体系。它通过将研究者在论文发表过程中扮演的不同角色进行明确分类，使得每位参与者的具体贡献得以清晰展现。...

介绍了基因集富集分析的原理，官网GSEA软件的使用和ClusterProfiler R包进行GSEA分析的具体代码。...

大脑是人体最为复杂的器官之一，由多个功能特化的脑区构成。每个脑区承担着特定的生理和认知功能。通过应用定量数据映射技术，将数值以色彩编码的形式呈现于各个脑区，可以显著增强对不...