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Sentieon
INSVAST
创建于2023-08-21
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专注基因数据分析
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Sentieon | DNAscope Hybrid长短读长混合分析流程详解及评测
Sentieon 在 120 核 456GB 内存的测试服务器上35X人类WGS数据+10X的PB数据分析仅耗时85.8分钟,35X人类WGS数据+10X的ONT数据分析仅耗时103.7分钟
Sentieon | DNAscope 核心家系(trio) WES 分析全流程详解
Sentieon DNAscope trio-WES全流程能在 12 分钟内完成 100X 的 WES 样本的家系分析,内存最大占用21.69G
Sentieon | 联合Dell、AMD开发基因组大数据分析加速方案
Dell-AMD-Sentieon 联合方案能在10分钟内完成30X WGS,10.2分钟内完成30X HIFI,17.4分钟内完成30X ONT数据
Sentieon软件发布v202503.03版本
Sentieon团队持续优化升级产品,现已发布V202503.03版本。最新版本(V202503.03)的更新主要聚焦于功能扩展和稳定性优化及其他优化。
Sentieon推出混合型短读长和长读长变异检测DNAscope Hybrid流程(下)
Sentieon DNAscope Hybrid 通过利用样本特异性的长读段单倍型信息指导短读段的重比对与精准排布,实现了对同一样本两类数据的深度集成。
Sentieon推出混合型短读长和长读长变异检测DNAscope Hybrid流程(上)
Sentieon开发了创新的混合分析流程DNAscope Hybrid,有效地整合了短读长和长读长测序技术的优势,能生成比单独使用一种技术更准确的变异检测结果,从而实现更全面和准确的基因组分析。
Sentieon | Genetic Disease-RAD51B 胚系突变与胰腺导管腺癌显著相关
该研究发现RAD51B在PDAC中具有较高的胚系突变频率,但在当前的临床遗传学检测Panel中往往未被涵盖。研究结果强烈支持将其纳入HR-DDR通路基因的胚系检测Panel中
sentieon | 泛基因组分析流程详解
泛基因组指的是一个物种所有个体中全部基因的集合。它不再依赖于单个参考基因组,而是承认没有任何一个个体能够拥有其物种的全部基因。
Sentieon项目文章 | 泛基因组揭示小麦结构变异与栖息地及育种的关联
小麦约3500-4000年前传入中国,多样化的生态类型和复杂的饮食文化需求,共同驱动了小麦遗传多样性的形成与演变。研究团队选取17个代表性品种进行基因组测序,结合现有的泛基因组资源,识别出大量结构变异
Sentieon 项目文章 | 偏远社区原住民澳大利亚人的血型基因组图谱
提维岛民由于遗传隔离形成了独特的血型抗原分布特征,与澳大利亚主要献血群体存在显著差异,在输血过程中容易引发同种免疫反应。面临着因血型抗原多态性导致的输血风险。为此对457例提维岛民进行系统性血型分析
Sentieon 项目文章 | 通过深度测序对血浆中游离线粒体 DNA 进行定量和表征
血浆中的线粒体DNA损伤相关分子模式(mtDNA DAMPs)与多种疾病的发病机制和预后密切相关。目前主流的qPCR检测方法存在诸多局限性。为此,研究团队开发了一种新型RNA靶向捕获方法。
Sentieon 项目文章 | 长读长基因组测序在神经发育障碍分子诊断中的应用
研究重点关注长读长测序相比短读长测序在检测神经发育障碍领域的应用,展示长读长在低可映射区域覆盖度、重复区域分析以及变异检测方面的优势。
Sentieon项目文章 | 社区努力识别和纠正蛋白质基因组研究中标签错误的样本
研究展示了COSMO在处理不同类型组学平台、不同生物体以及各类研究中的通用性和可靠性,证明了COSMO作为自动化解决方案的价值。也凸显了样本错误标记纠正对提高组学研究准确性的重要性。
文献解读-使用 Sentieon ctDNA 分析管道高精度、高效地处理 UMI 数据集
在大多数测试数据集中,与其他分析流程相比,Sentieon ctDNA流程表现出更优的召回率和精确度,卓越的性能主要归功于共识序列生成工具中使用的复杂统计模型,以及Sentieon TNscope提供
文献解读-Sentieon DNAscope LongRead – A highly Accurate, Fast, and Efficient Pipelin
DNAscope LongRead在处理PacBio HiFi数据的胚系变异检测中实现了在精准性方面、鲁棒性方面,效能方面三大突破
文献解读-LettuceGDB: The community database for lettuce genetics and omics
LettuceGDB旨在成为莴苣多组学数据的中心,促进知识和信息共享。数据库还收集和组织了文献和社区工具中的信息,并总结了莴苣的前沿研究。构建LettuceGDB的目的之一是推动莴苣育种进展。
文献解读-Identification of driver genes for critical forms of COVID-19 in a deeply p
研究团队通过结合多组学分析和人工智能方法,在排除年龄和基础疾病等混淆因素的年轻患者队列中,成功揭示了COVID-19重症患者的分子特征。
文献解读-CRISPR-Cas9 generated Pompe knock-in murine model exhibits early-onset hype
研究首次利用CRISPR-Cas9技术构建携带与人类致病突变同源(Gaa c.1826dupA)的庞贝病小鼠模型,更精准模拟人类IOPD的病理特征,为疾病机制研究和个性化治疗策略开发提供了重要工具。
文献解读-SARS-CoV-2 variant Delta rapidly displaced variant Alpha in the United Stat
研究首次在美国大规模人群中系统阐明了Delta变体的传播优势机制,为理解SARS-CoV-2变异株的演化规律提供了重要科学依据。这些发现不仅有助于防控策略的制定,也为后续变异株的监测和预警提供了重要参
文献解读-Identification of Key Candidate Genes for Beak Length Phenotype by Whole-Ge
研究首次揭示了鸟类喙部形态发育受神经系统和骨骼发育双重调控的分子机制。从进化角度提出水禽细长喙可能是适应水生环境的遗传调控结果,为鸟类喙部发育的分子遗传学研究提供了新思路。
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