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1小时前
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毅硕HPC | NVIDIA DGX Spark 万字硬核评测:将AI超级工厂带上桌面
作为全球首款基于NVIDIA Grace Blackwell架构的个人AI超级计算机,DGX Spark将工业级的AI性能带入您的私人工作空间,让您从原型设计到大规模部署,...
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3小时前
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毅硕HPC | Lustre文件系统在HPC集群中的部署实战
Lustre作为一种开源的、分布式并行文件系统,凭借其卓越的可扩展性和极高的I/O吞吐量,成为了全球Top 500超算中心的首选。...
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12天前
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毅硕HPC | 一文详解HPC环境中的MPI并行计算
MPI主要用于分布式内存系统,适合跨多个服务器节点的大规模并行任务。MPI 不仅仅是一种编程接口,它是连接算法与硬件之间的桥梁,是实现“算得更快、看得更远”的关键技术支撑。...
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13天前
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Sentieon | Genetic Disease-RAD51B 胚系突变与胰腺导管腺癌显著相关
该研究发现RAD51B在PDAC中具有较高的胚系突变频率,但在当前的临床遗传学检测Panel中往往未被涵盖。研究结果强烈支持将其纳入HR-DDR通路基因的胚系检测Panel...
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19天前
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毅硕HPC | 在HPC集群上优雅地使用conda
通过本教程,你将掌握在HPC集群中从零开始部署并高效利用Conda的核心技能。为你的课题创建一个干净的environment.yml文件,让你的科研计算之旅更加规范、高效和...
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28天前
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Sentieon | 泛基因组相比传统变异检测的优势
泛基因组相比于传统变异检测,能够突破“单一参考”的局限,即从个体代表性到群体包容性;显著提升变异检出的能力与准确性;推动了精准医学与人群特异性的研究。...
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1月前
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毅硕HPC | 配置SLURM作业队列优先级
本文介绍在Slurm系统环境下,当出现作业提交或作业状态变化时,如何通过恰当的队列配置策略来实现尽可能多的任务调度处理,以达到最佳性能。...
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1月前
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毅硕HPC | Rocky Linux 9 SLURM软件编译安装
Slurm 是现代HPC集群不可或缺的核心中间件。通过本教程,您将学习如何在 Rocky Linux 9 系统上从源码编译并安装配置这一强大的调度系统,为构建您自己的高性能...
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1月前
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sentieon | 泛基因组分析流程详解
泛基因组指的是一个物种所有个体中全部基因的集合。它不再依赖于单个参考基因组,而是承认没有任何一个个体能够拥有其物种的全部基因。...
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2月前
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Sentieon | 小麦全基因组(WGS)分析流程
测试小麦样本平均测序深度7.55x,从FastQ到VCF全流程分析最快用时1.4个小时,大幅缩短小麦全基因组WGS分析时间,有效加快小麦的分子育种进程。...
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3月前
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Sentieon项目文章 | 泛基因组揭示小麦结构变异与栖息地及育种的关联
小麦约3500-4000年前传入中国,多样化的生态类型和复杂的饮食文化需求,共同驱动了小麦遗传多样性的形成与演变。研究团队选取17个代表性品种进行基因组测序,结合现有的泛基...
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4月前
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Sentieon 项目文章 | 一例中国男童及139例Pearson综合征患者的临床和遗传特征
皮尔逊综合征(Pearson Syndrome,PS)是一种由线粒体DNA缺失引起的罕见多系统遗传病,主要影响骨髓和胰腺功能。该病通常在婴儿早期发病,以难治性贫血为主要表现...
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4月前
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Sentieon 项目文章 | 偏远社区原住民澳大利亚人的血型基因组图谱
提维岛民由于遗传隔离形成了独特的血型抗原分布特征,与澳大利亚主要献血群体存在显著差异,在输血过程中容易引发同种免疫反应。面临着因血型抗原多态性导致的输血风险。为此对457例...
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5月前
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Sentieon 项目文章 | 通过深度测序对血浆中游离线粒体 DNA 进行定量和表征
血浆中的线粒体DNA损伤相关分子模式(mtDNA DAMPs)与多种疾病的发病机制和预后密切相关。目前主流的qPCR检测方法存在诸多局限性。为此,研究团队开发了一种新型RN...
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6月前
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Sentieon 项目文章 | 长读长基因组测序在神经发育障碍分子诊断中的应用
研究重点关注长读长测序相比短读长测序在检测神经发育障碍领域的应用,展示长读长在低可映射区域覆盖度、重复区域分析以及变异检测方面的优势。...
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6月前
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Sentieon项目文章 | 社区努力识别和纠正蛋白质基因组研究中标签错误的样本
研究展示了COSMO在处理不同类型组学平台、不同生物体以及各类研究中的通用性和可靠性,证明了COSMO作为自动化解决方案的价值。也凸显了样本错误标记纠正对提高组学研究准确性...
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7月前
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文献解读-使用 Sentieon ctDNA 分析管道高精度、高效地处理 UMI 数据集
在大多数测试数据集中,与其他分析流程相比,Sentieon ctDNA流程表现出更优的召回率和精确度,卓越的性能主要归功于共识序列生成工具中使用的复杂统计模型,以及Sent...
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7月前
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文献解读-Sentieon DNAscope LongRead – A highly Accurate, Fast, and Efficient Pipelin
DNAscope LongRead在处理PacBio HiFi数据的胚系变异检测中实现了在精准性方面、鲁棒性方面,效能方面三大突破...
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7月前
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文献解读-LettuceGDB: The community database for lettuce genetics and omics
LettuceGDB旨在成为莴苣多组学数据的中心,促进知识和信息共享。数据库还收集和组织了文献和社区工具中的信息,并总结了莴苣的前沿研究。构建LettuceGDB的目的之一...
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