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10月前
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昇腾AI4S图机器学习:DGL消息传递接口的PyG替换
DGL 和 PyG 是两个主流的图神经网络库,它们在API设计和底层实现上有一定差异,在不同场景下,研究人员会使用不同的依赖库,因此分享一些替代经验策略...
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10月前
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基于昇腾适配电力潮流计算模型PowerFlowNet
准确高效的潮流 (PF) 分析对于现代电网的运行和规划至关重要。因此,我们需要一种可扩展的算法,能够为小型和大型电网提供准确、快速的解决方案。...
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10月前
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OpenFold2.0 基于NPU的推理适配与测试
OpenFold2.0 基于NPU的推理适配与测试 环境搭建 下载代码及安装依赖 数据集准备 推理测试 报错与解决方法...
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10月前
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昇腾AI4S图机器学习:DGL图构建接口的PyG替换
背景介绍 DGL (Deep Graph Learning) 和 PyG (Pytorch Geometric) 是两个主流的图神经网络库,它们在API设计和底层实现上有一...
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10月前
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基于昇腾适配数据驱动的全球天气预报模型Fuxi
1. 摘要 Fuxi是由复旦大学的研究人员开发的一个基于数据驱动的全球天气预报模型,主要由Cube Embedding、U-Transformer和全连接层构成。...
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10月前
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基于昇腾适配Meta AI在Science正刊发表的蛋白质结构预测模型ESMFold
1. 摘要 ESMFold是由Meta AI团队开发的一种基于深度学习的高效蛋白质结构预测模型,其核心目标是利用大规模蛋白质语言模型(ESM)直接从氨基酸序列快速推断蛋白质...
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10月前
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基于昇腾适配DeepMind团队发布的蛋白质结构预测模型OpenFold
1. 摘要 OpenFold是一种基于深度学习的蛋白质结构预测模型,广泛应用于蛋白质从头预测、功能位点解析、突变效应模拟等领域。该模型的核心目标是通过大规模预训练和多阶段优...
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10月前
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Geneformer:基于Transformer的基因表达预测深度学习模型
摘要 Geneformer被广泛应用于疾病建模、治疗靶点发掘、基因网络预测与调控分析、基因功能预测与剂量敏感性分析、单细胞转录组数据集成与标准化、遗传变异解释与GWAS靶点...
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10月前
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OpenFold2.0 基于NPU的推理适配与测试
环境搭建 下载代码及安装依赖 数据集准备 推理测试 添加图片注释,不超过 140 字(可选) 报错与解决方法 1、报错 ImportError: /usr/lib64/li...
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1年前
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ProteinMPNN:基于深度学习的蛋白质序列设计模型
ProteinMPNN:基于深度学习的蛋白质序列设计模型 ProteinMPNN介绍 ProteinMPNN(Protein Message Passing Neural ...
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1年前
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PeptideBERT:基于Transformer用于肽性质预测的语言模型
本文主要介绍PeptideBERT模型是什么、PeptideBERT算法的基本原理、以及如何在昇腾设备上进行部署。 1. PeptideBERT介绍 PeptideBERT...
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1年前
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生物医药领域-分子对接SOTA模型洞察
该洞察介绍了分子对接的作用过程、应用场景、分类,简要总结了现有分子对接软件的核心内容及评估指标。此外,调研了近两年发表的3种SOTA模型(KarmaDock、DiffBin...
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1年前
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AI4Science之分子材料成像调研洞察
分子成像在材料科学中具有重要的意义。以位形空间成像为例,通过观察材料内部分子的分布和相互作用,可以辅助科研人员揭示材料微观结构和组成,研究材料的表界面性质,探索材料的动态变...
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1年前
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DGL(0.8.x) 技术点分析
DGL是由Amazon发布的图神经网络开源库。DGL采用消息传递范式进行图计算,包括边上计算、消息函数、点上计算、聚合与更新函数等。...
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Splendid
1年前
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图机器学习调研洞察:PyG与DGL
图机器学习的调研洞察,涉及对DGL与PyG的对比分析与实验验证,DGL在大图上有优势,在AI4SCI领域PyG与DGL存在不同的应用场景...
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Splendid
1年前
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新手入门:DGL在昇腾上的安装问题
DGL(Deep Graph Library)是一个用于处理图数据的Python库,本文章旨在解决DGL安装过程中遇到的问题...
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2025-01-20