1. 研究的意义
如果这个TF没有人研究，你找出了它的motif，这个意义较大；
一般这个TF已经研究过了，你找的motif大概率和数据库一样。
- 在数据库查询转录因子TF？
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比对后发现和数据库中差不多，但是权重信息稍有差异。差异可能来自于采样的误差，也有可能不是一个物种，也有可能因为有脱落酸的处理，处理导致差异。你做motif分析，就可以把你的数据分成2组，也可以做motif的差异分析，一组水杨酸处理，一组不用水杨酸处理，这两组鉴定出来的motif可能稍有差异，代表基因对应的上游的promoter区域稍有差异，也就是说，不同的时候，TF结合在不同的基因上面。
2. 搜库
- 使用：
tomtom
3. 搜基因组
- 软件：
fimo
fimo motif.txt genome.fa
作用：找出来之后，可以看这个序列下游是不是有基因，那么这个TF就可能调控这个基因
