SciPy 1.12 中文文档（七十八）

原文：docs.scipy.org/doc/scipy-1.12.0/index.html

SciPy 0.17.1 发布说明

原文链接：docs.scipy.org/doc/scipy-1.12.0/release/0.17.1-notes.html

SciPy 0.17.1 是一个仅修复 bug 的版本，与 0.17.0 没有新功能。

0.17.1 中已关闭的问题

• #5817: BUG: skew, kurtosis 返回 np.nan 而非“propagate”

• #5850: 使用 sgelsy 失败的测试

• #5898: 使用 float128 时，interpolate.interp1d 崩溃

• #5953: cKDTree.query 在 L_inf 距离下性能严重退化…

• #6062: mannwhitneyu 在 0.17.0 中破坏了向后兼容性

• #6134: T 检验不能处理 NaN 值

0.17.1 的拉取请求

• #5902: BUG: interpolate: 修复 interp1d 处理 np.float128 的问题

• #5957: BUG: 在 0.17 版本中，cKDTree.query 在 p=np.inf 时变慢

• #5970: 实际通过 nan_policy="propagate" 在统计函数中传播 NaN 值

• #5971: BUG: linalg: 修复 *gelsy 中 lwork 检查

• #6074: BUG: special: 修复严格别名规则的违反

• #6083: BUG: 修复线性操作符求和的 dtype

• #6100: BUG: 修复 mannwhitneyu 以保持向后兼容性

• #6135: 即使在工作空间查询期间，也不要向 LAPACK 传递空指针。

• #6148: stats: 修复 T 检验和 kendalltau 中 NaN 值的处理

SciPy 0.17.0 发布说明

原文链接：docs.scipy.org/doc/scipy-1.12.0/release/0.17.0-notes.html

内容

• SciPy 0.17.0 发布说明

  • 新特性

    • scipy.cluster 的改进

    • scipy.io 的改进

    • scipy.optimize 的改进

      • 线性分配问题求解器

      • 最小二乘优化

    • scipy.signal 的改进

    • scipy.stats 的改进

    • scipy.sparse 的改进

    • scipy.spatial 的改进

    • scipy.interpolate 的改进

    • scipy.linalg 的改进

  • 已弃用的特性

  • 不兼容的后向变更

  • 其他变更

  • 作者

    • 0.17.0 版本关闭的问题

    • 0.17.0 的拉取请求

SciPy 0.17.0 是 6 个月努力的结果。它包含许多新特性、大量 bug 修复、改进的测试覆盖率和更好的文档。本次发布中有一些被弃用的内容和 API 变更，这些变更在下文有详细记录。建议所有用户升级到此版本，因为它包含大量的 bug 修复和优化。此外，我们的开发关注点现在将转向 0.17.x 分支的 bug 修复发布，以及在主分支上增加新特性。

本次发布需要 Python 2.6、2.7 或 3.2-3.5，以及 NumPy 1.6.2 或更高版本。

发布亮点：

• 新增带约束的线性和非线性最小二乘优化函数：scipy.optimize.lsq_linear 和 scipy.optimize.least_squares
• 在scipy.optimize.curve_fit中支持带边界的拟合。
• 在scipy.stats中进行了显著改进，提供了对具有 NaN 或为空的输入更好的处理功能，改进了文档，同时确保了scipy.stats和scipy.stats.mstats之间的一致行为。
• 在scipy.spatial.cKDTree中进行了显著的性能改进和新功能添加。

新特性

scipy.cluster有所改进

新增了一个函数scipy.cluster.hierarchy.cut_tree，用于从链接矩阵中确定切分树。

scipy.io有所改进

scipy.io.mmwrite支持对称稀疏矩阵。

scipy.io.netcdf支持基于数据属性进行数据屏蔽和缩放。

scipy.optimize有所改进

线性分配问题求解器

scipy.optimize.linear_sum_assignment是解决线性求和分配问题的新函数。它使用匈牙利算法（Kuhn-Munkres）。

最小二乘优化

新增了一个带有约束的非线性最小二乘优化函数：scipy.optimize.least_squares。它提供了几种方法：Levenberg-Marquardt 用于无约束问题，以及两种用于约束问题的信任域方法。此外，它还提供了不同的损失函数。新的信任域方法还处理稀疏雅可比矩阵。

新增了一个带有约束的线性最小二乘优化函数：scipy.optimize.lsq_linear。它提供了一个信任域方法以及有界变量最小二乘（BVLS）算法的实现。

scipy.optimize.curve_fit现在支持带有边界的拟合。

scipy.signal有所改进

scipy.signal.spectrogram添加了mode关键字，允许返回除功率谱密度之外的其他谱图。

scipy.stats改进

许多scipy.stats中的函数增加了nan_policy关键字，允许指定如何处理带有 NaN 值的输入：传播 NaN、引发错误或省略 NaN。

许多scipy.stats中的函数已经改进，以正确处理空数组或包含 inf/nan 的输入。

scipy.stats和scipy.stats.mstats中具有相同名称的多个函数现已更改为具有匹配的签名和行为。详细信息请参见gh-5474。

scipy.stats.binom_test和scipy.stats.mannwhitneyu增加了关键字alternative，允许指定要测试的假设。最终所有假设检验函数将获得此关键字。

对许多连续分布的方法现在接受复杂输入。

矩阵正态分布已实现为scipy.stats.matrix_normal。

scipy.sparse改进

稀疏范数中添加了axis关键字，scipy.sparse.linalg.norm。

scipy.spatial改进

scipy.spatial.cKDTree部分重写以提高性能，并为其添加了几个新功能：

• query_ball_point方法变得显著更快

• query和query_ball_point增加了n_jobs关键字以进行并行执行

• 构建和查询方法现在释放 GIL

• 完全支持 pickling

• 支持周期空间

• sparse_distance_matrix方法现在可以返回稀疏矩阵类型

scipy.interpolate改进

scipy.interpolate.interp1d 的越界行为已经改进。使用一个两个元素的元组作为 fill_value 参数，指定插值范围下限和上限的分开填充值。scipy.interpolate.interp1d 的线性和最近邻插值方式支持通过关键字 fill_value="extrapolate" 进行外推。

fill_value 也可以设置为类数组（或两个元素的元组，分别用于下限和上限值），只要它可以正确广播到数组的非插值维度。这在之前的 scipy 版本中是隐式支持的，但现在已经正式支持并在使用前进行兼容性检查。例如，形状为 (2, 3, 5) 的 y 值进行插值，沿最后一个轴（2）可以接受形状为 ()（单例）、(1,)、(2, 1)、(1, 3)、(3,) 或 (2, 3) 的 fill_value 数组；或者可以是一个包含两个元素的元组，用于指定分开的上下界，其中每个元组元素都遵循适当的广播规则。

scipy.linalg 改进

scipy.linalg.leastsq 的默认算法已更改为使用 LAPACK 的函数 *gelsd。希望恢复到之前行为的用户可以使用一个新关键字 lapack_driver="gelss"（允许的值为 “gelss”、“gelsd” 和 “gelsy”）。

当可用时（Python 3.5+），scipy.sparse 矩阵和线性操作符现在支持 matmul（@） 操作符。详见 PEP 465。

添加了一个新函数 scipy.linalg.ordqz，用于具有重新排序的 QZ 分解。

已弃用的功能

scipy.stats.histogram 已被弃用，推荐使用更快且功能相同的 np.histogram。

scipy.stats.threshold 和 scipy.mstats.threshold 已被弃用，推荐使用 np.clip。详见问题 #617。

scipy.stats.ss 已被弃用。这是一个支持函数，不打算暴露给用户。此外，名称不太清晰。详见问题 #663。

scipy.stats.square_of_sums 已被弃用。这也是一个不打算暴露给用户的支持函数。详见问题 #665 和 #663。

scipy.stats.f_value、scipy.stats.f_value_multivariate、scipy.stats.f_value_wilks_lambda 和 scipy.mstats.f_value_wilks_lambda 已被弃用。这些函数与方差分析相关，在 scipy.stats 中的功能有限，这些函数单独使用并不太有用。详见问题 #660 和 #650。

scipy.stats.chisqprob已弃用。这是一个别名。应改用stats.chi2.sf。

scipy.stats.betai已弃用。这是special.betainc的别名，应改用它。

不兼容的后向变更

函数stats.trim1和stats.trimboth现在确保修剪的元素是最低和/或最高的，具体取决于情况。之前对未排序输入进行切片修剪是行不通的。

当variable_names设置为空列表时，scipy.io.loadmat现在会正确返回 MAT 文件的空值，而不是所有内容。

稀疏矩阵的逐元素乘法现在在所有情况下返回稀疏结果。以前，将稀疏矩阵与密集矩阵或数组相乘会返回密集矩阵。

函数misc.lena由于许可证不兼容已被移除。

sparse.coo_matrix的构造函数不再接受(None, (m,n))来构建形状为(m,n)的全零矩阵。此功能至少自 2007 年起已弃用，并在之前的 SciPy 版本中已经失效。请改用coo_matrix((m,n))。

linalg.cython_lapack中的 Cython 包装器用于 LAPACK 例程*gegs、*gegv、*gelsx、*geqpf、*ggsvd、*ggsvp、*lahrd、*latzm、*tzrqf已被移除，因为这些例程不再包含在新的 LAPACK 3.6.0 版本中。除了*ggsvd和*ggsvp例程外，这些例程已全部弃用，而我们当前的 Cython LAPACK 包装器中提供的例程被视为优选。

因为 LAPACK 3.6.0 中移除了*gegv例程。对应的 Python 包装器在scipy.linalg.lapack中已被弃用，并将在未来的版本中移除。这些例程的源文件已作为scipy.linalg的一部分暂时包含，以便 SciPy 可以构建在不提供这些弃用例程的 LAPACK 版本上。

其他变更

Scipy 开发版本的 HTML 和 PDF 文档现在在每次合并的拉取请求后会自动重建。

scipy.constants已更新为 CODATA 2014 推荐值。

Scipy 内部使用scipy.fftpack函数的方式已更改，以便PyFFTW可以轻松替换scipy.fftpack函数（性能得到改善）。详细信息请参见gh-5295。

scipy.misc和scipy.ndimage中的imread函数已统一，scipy.misc.imread增加了一个mode参数。此外，修复了 1 位和索引 RGB 图像格式的错误。

runtests.py，用于构建和测试 Scipy 的开发脚本，现在支持使用 --parallel 并行构建。

作者

• @cel4 +

• @chemelnucfin +

• @endolith

• @mamrehn +

• @tosh1ki +

• Joshua L. Adelman +

• Anne Archibald

• Hervé Audren +

• Vincent Barrielle +

• Bruno Beltran +

• Sumit Binnani +

• Joseph Jon Booker

• Olga Botvinnik +

• Michael Boyle +

• Matthew Brett

• Zaz Brown +

• Lars Buitinck

• Pete Bunch +

• Evgeni Burovski

• CJ Carey

• Ien Cheng +

• Cody +

• Jaime Fernandez del Rio

• Ales Erjavec +

• Abraham Escalante

• Yves-Rémi Van Eycke +

• Yu Feng +

• Eric Firing

• Francis T. O’Donovan +

• André Gaul

• Christoph Gohlke

• Ralf Gommers

• Alex Griffing

• Alexander Grigorievskiy

• Charles Harris

• Jörn Hees +

• Ian Henriksen

• Derek Homeier +

• David Menéndez Hurtado

• Gert-Ludwig Ingold

• Aakash Jain +

• Rohit Jamuar +

• Jan Schlüter

• Johannes Ballé

• Luke Zoltan Kelley +

• Jason King +

• Andreas Kopecky +

• Eric Larson

• Denis Laxalde

• Antony Lee

• Gregory R. Lee

• Josh Levy-Kramer +

• Sam Lewis +

• François Magimel +

• Martín Gaitán +

• Sam Mason +

• Andreas Mayer

• Nikolay Mayorov

• Damon McDougall +

• Robert McGibbon

• Sturla Molden

• Will Monroe +

• Eric Moore

• Maniteja Nandana

• Vikram Natarajan +

• Andrew Nelson

• Marti Nito +

• Behzad Nouri +

• Daisuke Oyama +

• Giorgio Patrini +

• Fabian Paul +

• Christoph Paulik +

• Mad Physicist +

• Irvin Probst

• Sebastian Pucilowski +

• Ted Pudlik +

• Eric Quintero

• Yoav Ram +

• Joscha Reimer +

• Juha Remes

• Frederik Rietdijk +

• Rémy Léone +

• Christian Sachs +

• Skipper Seabold

• Sebastian Skoupý +

• Alex Seewald +

• Andreas Sorge +

• Bernardo Sulzbach +

• Julian Taylor

• Louis Tiao +

• Utkarsh Upadhyay +

• Jacob Vanderplas

• Gael Varoquaux +

• Pauli Virtanen

• Fredrik Wallner +

• Stefan van der Walt

• James Webber +

• Warren Weckesser

• Raphael Wettinger +

• Josh Wilson +

• Nat Wilson +

• Peter Yin +

一共有 101 位贡献者参与了这次发布。在其名字后带有“+”的人员首次贡献了补丁。此名单自动生成，可能不完全。

0.17.0 关闭的问题

• #1923: 在 stats.poisson.rvs 中的 numpy 0 存在问题 (Trac #1398)

• #2138: scipy.misc.imread 在 1 位 PNG 上段错误 (Trac #1613)

• #2237: 分布不接受复数参数 (Trac #1718)

• #2282: scipy.special.hyp1f1(0.5, 1.5, -1000) 失败 (Trac #1763)

• #2618: 当 mu 为 0 时，poisson.pmf 返回 NaN

• #2957: hyp1f1 精度问题

• #2997: FAIL: test_qhull.TestUtilities.test_more_barycentric_transforms

• #3129: 在 Optimize 函数中设置拟合参数的范围无效

• #3191: interp1d 应包含 fill_value_below 和 fill_value_above…

• #3453: PchipInterpolator 在边缘处设置斜率与 Matlab 的不同…

• #4106: ndimage._ni_support._normalize_sequence() 与 numpy.int64 失败

• #4118: scipy.integrate.ode.set_solout 在 scipy.integrate.ode.set_initial_value 之后静默失败

• #4233: 1D scipy.interpolate.griddata 使用 method=nearest 产生 NaNs…

• #4375: 所有测试因文件权限错误而失败

• #4580: scipy.ndimage.filters.convolve 文档错误

• #4627: 带有符号指示器的 logsumexp - 允许负数计算…

• #4702: 带有零缩放因子的 logsumexp

• #4834: 对于无限 x，gammainc 应返回 1.0 而不是 NaN

• #4838: enh: exprel 特殊函数

• #4862: scipy.special.boxcox 函数对非正常值不准确…

• #4887: 球谐函数不一致

• #4895: 一些 scipy ufuncs 输出数据类型不一致？

• #4923: logm 不主动将复杂输出转换为浮点数

• #4932: BUG: stats: distributions 的 fit 方法悄悄忽略…

• #4956: scipy.special.bi_zeros 中的文档错误

• #4957: pbvv_seq 的文档字符串错误

• #4967: block_diag 应查看所有参数的 dtypes，而不仅仅是…

• #5037: scipy.optimize.minimize 错误消息打印到 stdout…

• #5039: 三次插值：进入 DGESDD 的第 12 个参数出现问题…

• #5163: 层次聚类的基本案例示例（提供）

• #5181: BUG: stats.genextreme.entropy 应使用显式公式

• #5184: 某些 wheels 未表达 numpy 依赖关系

• #5197: mstats: test_kurtosis 失败（ULP max 为 2）

• #5260: splrep 中的拼写错误导致错误

• #5263: rbf.py 中默认的 epsilon 对共线点失败

• #5276: 读取空（无数据）arff 文件失败

• #5280: 1d scipy.signal.convolve 比 numpy.convolve 慢得多

• #5326: scipy.interpolate.PchipInterpolator 实现中的错误

• #5370: test_quadpack 和 libm.so 作为链接器脚本的测试问题

• #5426: ERROR: test_stats.test_chisquare_masked_arrays

• #5427: 在 numpy-vendor 映像中自动安装正确的 numpy 版本

• #5430: Python3 中，Numpy 标量类型“不可迭代”；特定实例...

• #5450: 当输入 nans 时，spatial.ConvexHull 触发 seg. fault

• #5478: 澄清矩阵正态分布与 multivariate_normal 的关系

• #5539: numpy-vendor 的 Windows 二进制文件中与 lstsq 相关的测试失败

• #5560: 文档：scipy.stats.burr pdf 问题

• #5571: lapack_driver 更改后，lstsq 测试失败

• #5577: 在 Python 3.4 中，Wine 上的 ordqz 引发 segfault

• #5578: scipy.linalg 在 Wine 中的 Python 3 上的测试失败

• #5607: 使用 clang++ 编译时，重载的 isnan(double&) 不明确

• #5629: lstsq 随机失败的测试

• #5630: scipy 0.16 spatial cKDEtree 存在内存泄漏

• #5689: 编译 scipy/special/Faddeeva.cc 时出现 isnan 错误

• #5694: test_import 中的 fftpack 测试失败

• #5719: curve_fit(method!=”lm”) 忽略初始猜测

0.17.0 的拉取请求

• #3022: hyp1f1：对大负数参数的更好处理

• #3107: 增强：添加有序 QZ 分解

• #4390: 增强：允许 axis 和 keepdims 参数传递给 scipy.linalg.norm。

• #4671: 增强：sparse norms 添加 axis

• #4796: 增强：在 scipy.cluster.hierarchy 中添加 cut tree 函数

• #4809: cauchy moments 未定义的维护

• #4821: ENH：stats：使分布实例可被 pickle 序列化。

• #4839: ENH：添加 scipy.special.exprel 相对误差指数函数。

• #4859: Logsumexp 修复 - 允许符号标志和 b==0。

• #4865: BUG：scipy.io.mmio.write：处理大索引和低精度时出错。

• #4869: 在 _lib._util._asarray_validated 中添加 as_inexact 选项。

• #4884: ENH：有限差分逼近雅可比矩阵。

• #4890: ENH：将 cKDTree 查询方法移植到 C++，允许 Python 中 pickling…

• #4892: doctesting 过多了吗？

• #4896: MAINT：解决可能的 numpy ufunc 循环选择 bug。

• #4898: MAINT：根据 pyflakes 进行一些清理。

• #4899: ENH：在 stats 中为假设检验添加'alternative'关键字。

• #4903: BENCH：interpolate 模块的基准测试。

• #4905: MAINT：为 mask_to_limits 添加下划线前缀；删除 masked_var。

• #4906: MAINT：optimize.leastsq 的基准测试。

• #4910: WIP：修剪统计函数具有不一致的 API。

• #4912: MAINT：修正 stats 教程中的拼写错误。关闭 gh-4911。

• #4914: DEP：弃用scipy.stats.ss和scipy.stats.square_of_sums。

• #4924: MAINT：如果实部矩阵的 logm 的虚部很小，…

• #4930: BENCH：signal 模块的基准测试。

• #4941: ENH：更新find_repeats。

• #4942: MAINT：在 cKDTree 中使用 np.float64_t 而不是 np.float_t。

• #4944: BUG：correlate_nd 中的整数溢出。

• #4951: 不要忽略分布 fit 方法中的无效 kwargs。

• #4958: 为特殊函数的 docstrings 添加一些细节。

• #4961: ENH：stats.describe：添加 bias 关键字和空数组处理。

• #4963: ENH：scipy.sparse.coo.coo_matrix.init：需要更少的内存。

• #4968: DEP：弃用stats.f_value*和mstats.f_value*函数。

• #4969: ENH：审查stats.relfreq和stats.cumfreq；修复stats.histogram。

• #4971: Extend github source links to line ranges

• #4972: MAINT: impove the error message in validate_runtests_log

• #4976: DEP: deprecate scipy.stats.threshold

• #4977: MAINT: more careful dtype treatment in block diagonal matrix…

• #4979: ENH: distributions, complex arguments

• #4984: clarify dirichlet distribution error handling

• #4992: ENH: stats.fligner and stats.bartlett empty input handling.

• #4996: DOC: fix stats.spearmanr docs

• #4997: Fix up boxcox for underflow / loss of precision

• #4998: DOC: improved documentation for stats.ppcc_max

• #5000: ENH: added empty input handling scipy.moment; doc enhancements

• #5003: ENH: improves rankdata algorithm

• #5005: scipy.stats: numerical stability improvement

• #5007: ENH: nan handling in functions that use stats._chk_asarray

• #5009: remove coveralls.io

• #5010: Hypergeometric distribution log survival function

• #5014: Patch to compute the volume and area of convex hulls

• #5015: DOC: Fix mistaken variable name in sawtooth

• #5016: DOC: resample example

• #5017: DEP: deprecate stats.betai and stats.chisqprob

• #5018: ENH: Add test on random inpu to volume computations

• #5026: BUG: Fix return dtype of lil_matrix.getnnz(axis=0)

• #5030: DOC: resample slow for prime output too

• #5033: MAINT: integrate, special: remove unused R1MACH and Makefile

• #5034: MAINT: signal: lift max_len_seq validation out of Cython

• #5035: DOC/MAINT: refguide / doctest drudgery

• #5041: BUG: fixing some small memory leaks detected by cppcheck

• #5044: [GSoC] ENH: New least-squares algorithms

• #5050: MAINT: C fixes, trimmed a lot of dead code from Cephes

• #5057: ENH: sparse: avoid densifying on sparse/dense elementwise mult

• #5058: 测试：stats：在测试循环中添加一个样本分布

• #5061: 增强：空间：更快的 2D Voronoi 和 Convex Hull 绘图

• #5065: 测试：改进 stats.mvsdist 和 stats.bayes_mvs 的测试覆盖率

• #5066: 维护：fitpack：移除一个空操作

• #5067: 增强：stats.kstat 和 stats.kstatvar 的空和 nan 输入处理

• #5071: 文档：优化库：修正文献引用，添加 DOI

• #5072: 维护：scipy.sparse 清理

• #5073: 文档：特殊函数库：添加一个示例，展示 diric 函数与…

• #5075: 文档：澄清 stats.lognorm 的参数化

• #5076: 使用 int, float, bool 而不是 np.int, np.float, np.bool

• #5078: 文档：将 fftpack 文档重命名为 README

• #5081: BUG：在 lsmr 和 lsqr 中正确处理标量 'b'

• #5082: loadmat 变量名：避免混淆 [] 和 None。

• #5083: 修复 integrate.fixed_quad 文档字符串以指示 None 返回值

• #5086: 使用 solve() 替代 gaussian_kde 的 inv()

• #5090: 维护：统计库：显式添加 _sf, _isf 到 gengamma 分布

• #5094: 增强：scipy.interpolate.NearestNDInterpolator：cKDTree 可配置

• #5098: 文档：特殊函数库：修复 *_roots 和积分函数的排版

• #5099: 文档：使 stats.moment 的文档字符串原始

• #5104: 文档/增强：修复和微小优化 scipy.linalg

• #5105: 增强：为最大线搜索次数添加 l-bfgs-b 参数…

• #5106: 测试：为 stats.f_oneway 添加 NIST 测试用例

• #5110: [GSoC]：有界线性最小二乘

• #5111: 维护：特殊函数库：Cephes 清理

• #5118: BUG：在 lfilter 中如果 len(x) < len(b) 则 FIR 路径失败。

• #5124: 增强：将 filliben 近似移到一个公开可见的函数

• #5126: 统计清理：stats.kruskal 回顾

• #5130: 文档：更新 PyPi trove 分类。Beta -> Stable。添加许可证。

• #5131: DOC: differential_evolution，改进 mutation 和… 的文档字符串

• #5132: MAINT: differential_evolution 改进 init_population_lhs 的注释…

• #5133: MRG: 重基础化的 mmio 重构

• #5135: MAINT: stats.mstats 与 stats.stats 的一致性

• #5139: TST: linalg：为 gh-5039 添加一个烟雾测试

• #5140: EHN: 将 constants.codata 更新到 CODATA 2014

• #5145: 在文档字符串中添加 ValueError 作为可能引发的错误

• #5146: MAINT: 改进 stats.shapiro 的实现细节和文档

• #5147: [GSoC] ENH: 对 curve_fit 的升级

• #5150: 修正误导的小波 / 连续小波变换示例

• #5152: BUG: cluster.hierarchy.dendrogram：缺少字体大小…

• #5153: 添加关键字以控制离散分布中的求和…

• #5156: DOC: 添加在勒让德函数中使用的算法的注释

• #5158: ENH: 优化：添加匈牙利算法

• #5162: FIX: 移除 lena

• #5164: MAINT: 修复 cluster.hierarchy.dendrogram 的问题和文档

• #5166: MAINT: 将 stats.pointbiserialr 修改为委托给 stats.pearsonr

• #5167: ENH: 在 stats.kendalltau 中添加 nan_policy 选项。

• #5168: TST: 在 stats.linregress 中添加 nist 测试用例（Norris）。

• #5169: 更新 lpmv 文档字符串

• #5171: 在 linkage 文档字符串中澄清度量参数

• #5172: ENH: 添加 mode 关键字到 signal.spectrogram

• #5177: DOC: KDTree.query_ball_point 的图形示例

• #5179: MAINT: stats：调整 ncx2.pdf 的公式

• #5188: MAINT: linalg：一些清理。

• #5189: BUG: stats：在 stats.genextreme.entropy 中使用显式公式

• #5193: BUG: 修复 lartg 中未初始化的使用

• #5194: BUG: 从 ode_jacobian_function 向 Fortran 适当返回错误

• #5198: TST: 修复 Python 3.5 下 Windows 的 TestCtypesQuad 失败

• #5201: 允许 interp1d 中的外推

• #5209: 维护：在 Y_() 中将复杂参数更改为布尔值

• #5213: BUG：稀疏：修复逻辑比较 dtype 冲突

• #5216: BUG：稀疏：修复未绑定的本地错误

• #5218: 文档和 BUG：贝塞尔函数文档字符串改进，修复 array_like，……

• #5222: 维护：稀疏：修复 COO 构造函数

• #5224: 文档：优化：OptimizeResult.hess_inv 的类型变化

• #5228: 增强：为 netcdf 添加 maskandscale 支持；基于 pupynere 和……

• #5229: 文档：sparse.linalg.svds 文档中的拼写错误修正

• #5234: 维护：稀疏：简化 COO 构造函数

• #5235: 维护：稀疏：对具有多个对角线的 todia() 进行警告

• #5236: 维护：ndimage：简化线程处理/递归 + constness

• #5239: BUG：集成：修复问题 4118

• #5241: qr_insert 修复，关闭 #5149

• #5246: Doctest 教程文件

• #5247: 文档：优化：linear_sum_assignment 中的拼写错误/导入修复

• #5248: 移除 inspect.getargspec 并在 Travis CI 上测试 Python 3.5

• #5250: BUG：修复稀疏矩阵乘以单个元素零

• #5261: 修复导致 splrep 中 TypeError 的 bug

• #5262: 对 4489 的后续（在 linalg.lstsq 中添加 LAPACK 例程）

• #5264: 默认 epsilon 忽略零长度边缘

• #5269: 文档：拼写错误和拼写检查

• #5272: 维护：信号：将数组语法转换为内存视图

• #5273: 文档：带有数学公式的文档字符串的原始字符串

• #5274: 维护：稀疏：为 MST 更新 Cython 代码

• #5278: BUG：io：停止猜测 ARFF 文件中的数据分隔符。

• #5289: BUG：杂项：修复 1 位图像的 Pillow 工作区绕过。

• #5291: 增强：在 scipy.signal.correlate 中为 1d 调用 np.correlate

• #5294: 文档：特殊：从……中删除一个潜在误导的示例

• #5295: 简化替换 fftpack 为 pyfftw

• #5296: 增强：将矩阵正态分布添加到 stats

• #5297: 修复 Python 3 中的 leaf_rotation 和 leaf_font_size

• #5303: MAINT: stats: 重写 find_repeats

• #5307: MAINT: stats: 删除未使用的 Fortran 例程

• #5313: BUG: sparse: 修复非方阵矩阵的 diags

• #5315: MAINT: special: Cephes 清理

• #5316: 修复 sparse.linalg.svds 的输入检查

• #5319: MAINT: Cython 代码维护

• #5328: BUG: 修复 place_poles 的返回值

• #5329: 避免在 Student t 统计量中出现虚假的除以零

• #5334: MAINT: integrate: 杂项清理

• #5340: MAINT: 将错误消息打印到 STDERR 并删除 iterate.dat

• #5347: ENH: 添加 Py3.5 风格的 matmul 操作符（例如 A @ B）到稀疏线性…

• #5350: 修复读取 32 位浮点 wav 文件时出错

• #5351: 重构 PCHIP 插值器的算法

• #5354: MAINT: 从整数列表构造 csr 和 csc 矩阵

• #5359: 添加 interp1d 的快速路径

• #5364: 在 interp1d 中添加两个 fill_values。

• #5365: ABCD 文档字符串

• #5366: 修复 scipy.signal.cwt() 文档中的拼写错误，按 #5290。

• #5367: DOC 更新 scipy.spatial.Delaunay 示例

• #5368: ENH: 不再在每次函数调用时创建一次性类

• #5372: DOC: spectral: 修复参考格式

• #5375: PEP8 修正 ffpack_basic.py

• #5377: BUG: integrate: 内置名称不再被遮蔽

• #5381: 将 fftpack_pseudo_diffs.py PEP8 化

• #5385: BLD: 修复 Bento 构建以适应对 optimize 和 spatial 的更改

• #5386: STY: PEP8 修正 interpolate.py

• #5387: DEP: 废弃 stats.histogram

• #5388: REL: 向 doc/Makefile 添加 “make upload” 命令。

• #5389: DOC: 更新 scipy.ndimage.filters.convolve 的 origin 参数

• #5395: BUG: special: 修复与 x = np.inf 相关的多个边界情况

• #5398: 维护：stats：避免在 lognorm.pdf(0, s) 中出现虚假警告

• #5407: 增强：stats：在 stats.poisson 中处理 mu=0

• #5409: 修复离散分布在右端行为的问题...

• #5412: 测试：stats：跳过测试以避免虚假 log(0) 警告

• #5413: 错误修复：linalg：解决 LAPACK 单精度 lwork 计算的问题...

• #5414: 维护：stats：将命名元组的创建移到函数外部...

• #5415: 文档：修复 pdf 参考指南中目录中的部分问题

• #5416: 测试：在 Fedora 上修复 integrate 上 ctypes 测试的问题。

• #5418: 文档：修复 signal.TransferFunction 文档字符串中的错误。关闭 gh-5287。

• #5419: 维护：sparse：修复 NotImplementedError 的使用

• #5420: 如果 maxiter < 1，则引发适当的错误

• #5422: 文档：修改 brent 的文档以保持与 bracket 一致

• #5444: 错误修复：gaussian_filter, BPoly.from_derivatives 在 numpy int 上失败...

• #5445: 维护：stats：修复不正确的弃用警告和测试噪音

• #5446: 文档：在 fftpack 教程中添加关于 PyFFTW 的注释。

• #5459: 文档：整合：改进常微分方程的一些部分...

• #5465: 错误修复：通过几个 ulp 放宽 mstats 峰度测试的容差

• #5471: ConvexHull 对 NaN 应该引发 ValueError。

• #5473: 维护：更新 decorators.py 模块至版本 4.0.5

• #5476: 错误修复：imsave 在图像有 3 个或... 时搜索错误的通道轴

• #5477: 构建：为 OS X wheels 添加 numpy 到 setup/install_requires

• #5479: 增强：从 BasinHopping 返回 Jacobian/Hessian

• #5484: 错误修复：修复 ttest 零除处理

• #5486: 修复 kmeans2 的崩溃问题

• #5491: 维护：向 runtests.py 暴露并行构建选项

• #5494: 按键对 OptimizeResult.repr 进行排序

• #5496: 文档：更新作者姓名映射

• #5497: binned_statistic 的增强：返回的选项解开...

• #5498: BUG: sparse: 修复 sparsetools 输入数据类型解析中的错误

• #5500: DOC: 检测文档字符串中的不可打印字符

• #5505: BUG: misc: 确保 fromimage 将模式 ‘P’ 转换为 ‘RGB’ 或 ‘RGBA’。

• #5514: DOC: 进一步更新发布说明

• #5515: ENH: 可选择禁用固定点加速

• #5517: DOC: 改进和添加矩阵正态文档

• #5518: 移除 LAPACK 废弃例程的包装器

• #5521: TST: 在 32 位平台上跳过 linalg.orth 内存测试。

• #5523: DOC: 在文档字符串示例中将一些浮点数改为整数

• #5524: DOC: 更新至 0.17.0 版本发布说明

• #5525: 修复 scipy.integrate.ode 文档中的小错误

• #5527: TST: 提高 arccosh 容差，以允许不精确的 numpy 或…

• #5535: DOC: signal: 对 TransferFunction 的文档字符串进行小修正。

• #5538: DOC: 修正 find_peaks_cwt 文档

• #5545: MAINT: 修复 linalg/basic.py 中的拼写错误

• #5547: TST: 在主分支中将 TestEig.test_singular 标记为已知失败。

• #5550: MAINT: 解决 lstsq 驱动程序选择问题

• #5556: BUG: 修复了损坏的 dogbox 信任域半径更新

• #5561: BUG: 消除测试中的警告和异常（在 Windows 上）；…

• #5567: TST: 在测试套件中进行了一些清理；运行模块套件和更清晰的…

• #5568: MAINT: 简化泊松分布的 _argcheck

• #5569: TST: 提高 GMean 测试的容差，以在 Wine 上通过测试

• #5572: TST: lstsq: 提高 TravisCI 的测试容差

• #5573: TST: 移除 cluster.vq 测试中的 np.fromfile 使用

• #5576: Lapack 废弃

• #5579: TST: 在 numpy <= 1.7.x 上跳过对 linalg.norm 轴关键字的测试

• #5582: 澄清生存函数文档的语言

• #5583: MAINT: stats/tests: 进行一些清理。

• #5588: DOC: stats: 添加一条说明，说明 stats.burr 是第三类 Burr 分布。

• #5595: TST：修复 Python 3 上的 test_lamch 失败

• #5600: MAINT：忽略 spatial/ckdtree.cxx 和 .h

• #5602: 为了可维护性显式编号替换字段

• #5605: MAINT：对测试套件的一系列小修复

• #5614: 文档微小更改

• #5624: FIX：修复 interpolate

• #5625: BUG：msvc9 二进制文件在索引大小为 0 的 std::vector 时崩溃

• #5635: BUG：在 cKDTree 中拼写错误的 dealloc

• #5642: STY：修复 0.17.0 发布说明的格式

• #5643: BLD：修复 special/Faddeeva.cc 中与 isnan 相关的构建问题

• #5661: TST：linalg 测试使用 stdlib 的随机而不是 numpy.random

• #5682: 0.17.0 的后移

• #5696: least_squares 的文档字符串微小改进

• #5697: BLD：修复 special/Faddeeva.cc 中 isnan/isinf 的问题

• #5720: TST：修复 fftpack test_import.py 中的文件打开错误

• #5722: BUG：使 curve_fit 在有界初始猜测时能够得到尊重

• #5726: v0.17.0rc2 的后移

• #5727: API：对 least_squares API 进行更改

SciPy 0.16.1 Release Notes

Original text：docs.scipy.org/doc/scipy-1.12.0/release/0.16.1-notes.html

SciPy 0.16.1 is a bug-fix release with no new features compared to 0.16.0.

Issues closed for 0.16.1

• #5077: cKDTree not indexing properly for arrays with too many elements

• #5127: Regression in 0.16.0: solve_banded errors out in patsy test suite

• #5149: linalg tests apparently cause python to crash with numpy 1.10.0b1

• #5154: 0.16.0 fails to build on OS X; can’t find Python.h

• #5173: failing stats.histogram test with numpy 1.10

• #5191: Scipy 0.16.x - TypeError: _asarray_validated() got an unexpected…

• #5195: tarballs missing documentation source

• #5363: FAIL: test_orthogonal.test_j_roots, test_orthogonal.test_js_roots

Pull requests for 0.16.1

• #5088: BUG: fix logic error in cKDTree.sparse_distance_matrix

• #5089: BUG: Don’t overwrite b in lfilter’s FIR path

• #5128: BUG: solve_banded failed when solving 1x1 systems

• #5155: BLD: fix missing Python include for Homebrew builds.

• #5192: BUG: backport as_inexact kwarg to _asarray_validated

• #5203: BUG: fix uninitialized use in lartg 0.16 backport

• #5204: BUG: properly return error to fortran from ode_jacobian_function…

• #5207: TST: Fix TestCtypesQuad failure on Python 3.5 for Windows

• #5352: TST: sparse: silence warnings about boolean indexing

• #5355: MAINT: backports for 0.16.1 release

• #5356: REL: update Paver file to ensure sdist contents are OK for releases.

• #5382: 0.16.x backport: MAINT: work around a possible numpy ufunc loop…

• #5393: TST:special: bump tolerance levels for test_j_roots and test_js_roots

• #5417: MAINT: stats: move namedtuple creating outside function calls.

SciPy 0.16.0 发布说明

原文链接：docs.scipy.org/doc/scipy-1.12.0/release/0.16.0-notes.html

目录

• SciPy 0.16.0 发布说明

  • 新功能

    • 基准套件

    • scipy.linalg 改进

    • scipy.signal 改进

    • scipy.sparse 改进

    • scipy.spatial 改进

    • scipy.stats 改进

    • scipy.optimize 改进

  • 已弃用功能

  • 向后不兼容的更改

  • 其他变更

  • 作者

    • 0.16.0 关闭的问题

    • 0.16.0 的拉取请求

SciPy 0.16.0 是 7 个月努力的成果。它包含许多新功能、大量错误修复、改进的测试覆盖率和更好的文档。此版本有一些已弃用的功能和 API 更改，以下有详细文档。建议所有用户升级到此版本，因为有大量的错误修复和优化。此外，我们的开发注意力现在将转移到 0.16.x 分支的错误修复发布，并在主分支上添加新功能。

此版本需要 Python 2.6、2.7 或 3.2-3.4 和 NumPy 1.6.2 或更高版本。

本次发布的亮点包括：

• 在 scipy.linalg 中的 BLAS/LAPACK 的 Cython API

• 一个新的基准套件。现在可以轻松添加新的基准测试，并且它们常规地随性能增强的 PRs 一起包含。

• 在 scipy.signal 中支持二阶段（SOS）格式。

新功能

基准套件

基准套件现在使用 Airspeed Velocity 进行基准测试。您可以通过 python runtests.py --bench 在本地运行套件。有关更多详细信息，请参阅 benchmarks/README.rst。

scipy.linalg 改进

在模块 scipy.linalg.cython_blas 和 scipy.linalg.cython_lapack 中添加了 BLAS 和 LAPACK 的完整 Cython 包装器。在 Cython 中，这些包装器现在可以从其相应的模块中 cimport 并且可以在不直接链接到 BLAS 或 LAPACK 的情况下使用。

函数scipy.linalg.qr_delete、scipy.linalg.qr_insert 和 scipy.linalg.qr_update 用于更新 QR 分解。

函数scipy.linalg.solve_circulant 可解决具有循环系数矩阵的线性系统。

函数scipy.linalg.invpascal 计算 Pascal 矩阵的逆。

函数scipy.linalg.solve_toeplitz，一个 Levinson-Durbin Toeplitz 求解器，已添加。

添加了对可能有用的 LAPACK 函数*lasd4的包装器。它计算正对称秩一修正的正对角矩阵的第 i 个更新特征值的平方根。详见其 LAPACK 文档和单元测试以获取更多信息。

添加了两个额外的 LAPACK 最小二乘解算器的包装器。它们分别是*gelsd 和 *gelsy。

添加了计算各种矩阵范数的 LAPACK *lange函数的包装器。

添加了解决三对角矩阵A*X = B的 LAPACK *gtsv 和 *ptsv的包装器。

scipy.signal 改进

添加了对二阶段（SOS）作为 IIR 滤波器格式的支持。新的函数包括：

• scipy.signal.sosfilt

• scipy.signal.sosfilt_zi,

• scipy.signal.sos2tf

• scipy.signal.sos2zpk

• scipy.signal.tf2sos

• scipy.signal.zpk2sos。

此外，滤波器设计函数iirdesign、iirfilter、butter、cheby1、cheby2、ellip和bessel可以以 SOS 格式返回滤波器。

函数scipy.signal.place_poles，提供了两种方法来为线性系统放置极点，已添加。

在 scipy.signal.filtfilt 中添加了使用 Gustafsson 方法选择正向和反向传递的初始条件的选项。

新增了 TransferFunction、StateSpace 和 ZerosPolesGain 类。在实例化 scipy.signal.lti 时，现在返回这些类。现在可以显式地在这些类之间进行转换。

添加了指数（泊松）窗口作为 scipy.signal.exponential，添加了 Tukey 窗口作为 scipy.signal.tukey。

添加了计算数字滤波器组延迟的函数 scipy.signal.group_delay。

光谱分析和谱密度估计功能显著改进：scipy.signal.welch 的速度提高了约 8 倍，新增了函数 scipy.signal.spectrogram、scipy.signal.coherence 和 scipy.signal.csd（交叉谱密度）。

scipy.signal.lsim 已重写 - 解决了所有已知问题，因此现在可以使用此函数代替 lsim2；在大多数情况下，lsim 比 lsim2 快几个数量级。

scipy.sparse 改进

函数 scipy.sparse.norm，用于计算稀疏矩阵范数，已添加。

添加了允许从任意分布中绘制随机变量的函数 scipy.sparse.random。

scipy.spatial 改进

scipy.spatial.cKDTree 经历了一次重大重写，显著提高了query方法的性能，增加了对并行查询、pickling 和影响树布局的选项的支持。详细信息请参见 pull request 4374。

添加了用于 Procrustes 分析（统计形状分析）的函数 scipy.spatial.procrustes。

scipy.stats 改进

已添加了 Wishart 分布及其逆，分别为 scipy.stats.wishart 和 scipy.stats.invwishart。

已添加指数修正正态分布作为 scipy.stats.exponnorm。

已添加广义正态分布作为 scipy.stats.gennorm。

所有分布现在都包含一个 random_state 属性，并允许在生成随机变量时指定特定的 numpy.random.RandomState 随机数生成器。

许多统计测试和其他多返回值的 scipy.stats 函数现在返回 namedtuples。详见拉取请求 4709。

改进的 scipy.optimize

已向非线性方程系统求解函数 scipy.optimize.root 添加了新的无导数方法 DF-SANE。

已弃用的功能

scipy.stats.pdf_fromgamma 已被弃用。这个函数未记录、未经测试且使用稀少。Statsmodels 提供了与 statsmodels.distributions.ExpandedNormal 等效的功能。

scipy.stats.fastsort 已被弃用。这个函数是不必要的，可以使用 numpy.argsort 替代。

scipy.stats.signaltonoise 和 scipy.stats.mstats.signaltonoise 已弃用。这些函数不应存在于 scipy.stats 中，且使用极少。详见问题 #609。

scipy.stats.histogram2 已被弃用。这个函数是不必要的，可以使用 numpy.histogram2d 替代。

不兼容的变更

已移除了不推荐使用的全局优化器 scipy.optimize.anneal。

已移除以下弃用模块：scipy.lib.blas、scipy.lib.lapack、scipy.linalg.cblas、scipy.linalg.fblas、scipy.linalg.clapack、scipy.linalg.flapack。这些模块自 Scipy 0.12.0 弃用，其功能应作为 scipy.linalg.blas 和 scipy.linalg.lapack 访问。

已移除了不推荐使用的函数 scipy.special.all_mat。

已移除了不推荐使用的函数 fprob、ksprob、zprob、randwcdf 和 randwppf，它们来自 scipy.stats。

其他变更

开发版本的版本编号已更新以符合 PEP 440 规范。

现在支持使用 python setup.py develop 进行构建。

作者

• @axiru +

• @endolith

• Elliott Sales de Andrade +

• Anne Archibald

• Yoshiki Vázquez Baeza +

• Sylvain Bellemare

• Felix Berkenkamp +

• Raoul Bourquin +

• Matthew Brett

• Per Brodtkorb

• Christian Brueffer

• Lars Buitinck

• Evgeni Burovski

• Steven Byrnes

• CJ Carey

• George Castillo +

• Alex Conley +

• Liam Damewood +

• Rupak Das +

• Abraham Escalante +

• Matthias Feurer +

• Eric Firing +

• Clark Fitzgerald

• Chad Fulton

• André Gaul

• Andreea Georgescu +

• Christoph Gohlke

• Andrey Golovizin +

• Ralf Gommers

• J.J. Green +

• Alex Griffing

• Alexander Grigorievskiy +

• Hans Moritz Gunther +

• Jonas Hahnfeld +

• Charles Harris

• Ian Henriksen

• Andreas Hilboll

• Åsmund Hjulstad +

• Jan Schlüter +

• Janko Slavič +

• Daniel Jensen +

• Johannes Ballé +

• Terry Jones +

• Amato Kasahara +

• Eric Larson

• Denis Laxalde

• Antony Lee

• Gregory R. Lee

• Perry Lee +

• Loïc Estève

• Martin Manns +

• Eric Martin +

• Matěj Kocián +

• Andreas Mayer +

• Nikolay Mayorov +

• Robert McGibbon +

• Sturla Molden

• Nicola Montecchio +

• Eric Moore

• Jamie Morton +

• Nikolas Moya +

• Maniteja Nandana +

• Andrew Nelson

• Joel Nothman

• Aldrian Obaja

• Regina Ongowarsito +

• Paul Ortyl +

• Pedro López-Adeva Fernández-Layos +

• Stefan Peterson +

• Irvin Probst +

• Eric Quintero +

• John David Reaver +

• Juha Remes +

• Thomas Robitaille

• Clancy Rowley +

• Tobias Schmidt +

• Skipper Seabold

• Aman Singh +

• Eric Soroos

• Valentine Svensson +

• Julian Taylor

• Aman Thakral +

• Helmut Toplitzer +

• Fukumu Tsutsumi +

• Anastasiia Tsyplia +

• Jacob Vanderplas

• Pauli Virtanen

• Matteo Visconti +

• Warren Weckesser

• Florian Wilhelm +

• Nathan Woods

• Haochen Wu +

• Daan Wynen +

本次发布共有 93 人参与贡献。以“+”标记的人是首次贡献补丁。这个名单是自动生成的，可能并非完全完整。

0.16.0 的已关闭问题

• #1063: 实现 Wishart 分布 (Trac #536)

• #1885: Rbf: 浮点警告 - 可能的 bug (Trac #1360)

• #2020: Rbf 默认的 epsilon 太大 (Trac #1495)

• #2325: 扩展分布，例如超几何到退化案例 (Trac…

• #3502: [增强] linalg.hessenberg 应使用 ORGHR 用于 calc_q=True

• #3603: 将数组作为窗口传递给 signal.resample() 失败

• #3675: 在 Windows 上 signal.slepian 出现间歇性故障

• #3742: Pchipinterpolator 不便于 ppoly

• #3786: 是否添加 procrustes？

• #3798: 空字典导致 scipy.io.savemat 失败

• #3975: 在 scipy.stats 中使用 RandomState

• #4022: savemat 错误地保存逻辑数组

• #4028: scipy.stats.geom.logpmf(1,1) 返回 nan。正确的值是…

• #4030: 简化 scipy.stats.betaprime.cdf 的文档

• #4031: 提升 scipy.stats.gompertz 分布在小…时的准确性

• #4033: 提升 scipy.stats.lomax 分布在小…时的准确性

• #4034: 提升 scipy.stats.rayleigh 分布在大…时的准确性

• #4035: 提升 scipy.stats.truncexpon 分布在小…时的准确性

• #4081: 读取 MATLAB 文件时出错：缓冲区对请求…太小

• #4100: 为什么 qr(a, lwork=0) 没有失败？

• #4134: scipy.stats: rv_frozen 没有 expect() 方法

• #4204: 请为 scipy.optimize.RootResults 添加文档字符串

• #4206: 包装 LAPACK 三对角求解例程 gtsv

• #4208: 写入 MAT 文件的空稀疏矩阵无法被 MATLAB 读取

• #4217: 使用配置 TravisCI 构建带有 NPY_RELAXED_STRIDES_CHECKING=1 的 numpy

• #4282: integrate.odeint 在 full_output=1 和…时引发异常

• #4301: scipy 和 numpy 版本名称不符合 PEP 440

• #4355: PPoly.antiderivative() 产生错误输出

• #4391: 大型 b 矩阵使 spsolve 变得极慢

• #4393: sparse.linalg.spilu 中的文档问题

• #4408: minimize() 等中的向量约束

• #4412: scipy.signal.cwt 的文档错误

• #4428: dok.__setitem__ 对负索引的问题

• #4434: sparse.linalg.spsolve 的不完整文档

• #4438: linprog() 的文档示例有误

• #4445: scipy.special.expit 文档中的拼写错误

• #4467: scipy.optimize 中 TNC 选项的文档错误

• #4492: solve_toeplitz 的基准测试已经陈旧

• #4506: lobpcg/sparse 性能回退 Jun 2014?

• #4520: Linux 上需要 g77_abi_wrappers 来支持 MKL

• #4521: uses_mkl中针对新版本库的断开检查。

• #4523: 带有高斯核的rbf似乎比原始的产生更多噪音...

• #4526: poisson.pmf()方法的站点文档中存在错误。

• #4527: KDTree示例在 Python 3 中无法运行。

• #4550: scipy.stats.mode - 在空序列上出现UnboundLocalError。

• #4554: 在优化测试中滤除收敛警告。

• #4565: odeint消息。

• #4569: remez：“ValueError：经过 25 次迭代后未能收敛...

• #4582: 文档：优化：_minimize_scalar_brent没有disp选项。

• #4585: 文档：教程中存在错误的 latex 相关字符。

• #4590: sparse.linalg.svds如果which不在...应该抛出异常。

• #4594: 当提供回调时，scipy.optimize.linprog出现IndexError。

• #4596: scipy.linalg.block_diag在空数组输入时行为异常（v0.13.3）。

• #4599: scipy.integrate.nquad应该在仅有...时调用_OptFunc。

• #4612: 在输入为nd的情况下，signal.lfilter中的崩溃与错误形状的zi有关。

• #4613: 在读取sav文件时，scipy.io.readsav出现错误。

• #4673: scipy.interpolate.RectBivariateSpline构造在读取PyQt时锁定...

• #4681: signal.lfilter中的广播仍然不太正确。

• #4705: kmeans中k_or_guess参数的错误，如果猜测不是方形数组。

• #4719: 在 14.04.2 上构建失败。

• #4724: GenGamma _munp函数因溢出而失败。

• #4726: 失败：test_cobyla.test_vector_constraints。

• #4734: 在stats中与numpy master版本相关的失败测试。

• #4736: qr_update与numpy 1.10的 bug 或不兼容性？

• #4746: linprog返回违反平等约束的解决方案。

• #4757: optimize.leastsq文档字符串不匹配。

• #4774: 更新 v0.16 的贡献者列表。

• #4779: circmean 等未出现在文档中

• #4788: 复数时，scipy 稀疏 linalg isolve iterative.py 存在问题

• #4791: BUG：scipy.spatial：增量 Voronoi 不增加大小...

0.16.0 的拉取请求

• #3116: 稀疏：DIA 格式的增强

• #3157: 增强：线性代数：添加解决环形矩阵的函数 'solve_circulant'

• #3442: 增强：信号：添加 Gustafsson 方法作为 filtfilt 的选项...

• #3679: WIP：修复间歇性的 slepian 失败

• #3680: 统计模块中的一些清理

• #3717: 增强：添加二阶段分段滤波

• #3741: Dltisys 更改

• #3956: 在 scipy.signal.resample 中添加关于质数样本数的注释

• #3980: 添加 check_finite 标志到 UnivariateSpline

• #3996: 维护：更严格的线性代数参数检查

• #4001: 修复：狄利克雷分布的数值精度

• #4012: 增强：线性代数：添加计算 Pascal... 的逆函数

• #4021: 增强：lapack 和 blas 的 Cython api

• #4089: 修复各种 PEP8 问题。

• #4116: 维护：fitpack：修剪编译器警告（未使用标签、变量）

• #4129: 增强：统计：向分布添加 random_state 属性

• #4135: 增强：添加 Wishart 和逆 Wishart 分布

• #4195: 改进插值文档

• #4200: 增强：从描述统计函数添加 t-检验。

• #4202: 树状图阈值颜色

• #4205: 修复一些 Bento 构建警告。

• #4211: 添加反 Box-Cox 转换的 ufunc

• #4212: MRG: 修复 gh-4208

• #4213: 增强：如果 Matlab 文件为空，添加特定警告

• #4215: 问题 #4209：更新 splprep 文档以反映维度...

• #4219: 文档：在构建文档时消除几个 Sphinx 警告

• #4223: 维护：删除两行多余代码

• #4226: 尝试通过放宽步幅来强制 numpy 重建

• #4228: BLD：对 Bento 配置文件和文档进行了一些更新。关闭 gh-3978。

• #4232: 文档中的错误引用

• #4242: DOC：更改示例样本间距

• #4245: Arff 修复

• #4246: MAINT：C 修复

• #4247: MAINT：移除一些未使用的代码

• #4249: 添加更新 QR 分解的例程

• #4250: MAINT：linalg 和稀疏中的一些 pyflakes 驱动的清理

• #4252: MAINT：修剪超过 10 kLOC 的生成 C 代码

• #4253: TST：停止遮蔽 ellip*测试与 boost 数据的对比

• #4254: MAINT：special：使用 NPY_PI，而不是 M_PI

• #4255: DOC：INSTALL：使用 Py3 兼容的打印语法，并且不提及……

• #4256: ENH：spatial：使用 np.dot 重新实现 cdist_cosine

• #4258: BUG：io.arff #4429 #2088

• #4261: MAINT：signal：PEP8 和相关的样式清理。

• #4262: BUG：newton_krylov()忽略了 norm_tol 参数，关闭#4259

• #4263: MAINT：清理测试噪音并优化文档字符串的测试……

• #4266: MAINT：io：在尝试读取时给出信息丰富的错误提示……

• #4268: MAINT：fftpack 基准整数除法与真除法对比

• #4269: MAINT：避免遮蔽 eigvals 函数

• #4272: BUG：稀疏：修复 bench_sparse.py

• #4276: DOC：删除与编写有关的文档中令人困惑的部分……

• #4281: 稀疏矩阵乘法：仅在需要时转换数组（与……

• #4284: BUG：integrate：当集成时间为……时，odeint 崩溃

• #4286: MRG：修复逻辑数组的 matlab 输出类型

• #4287: DEP：弃用 stats.pdf_fromgamma。关闭 gh-699。

• #4291: DOC：linalg：修正 cholesky_banded 文档字符串中的布局

• #4292: BUG：允许空字典作为空结构的代理

• #4293: MAINT：！= -> not_equal 在汉明距离实现中

• #4295: 极点配置

• #4296: 维护：对多个模块的测试进行清理

• #4302: 增强：解决 toeplitz 线性系统

• #4306: 添加共轭梯度解算器的基准测试。

• #4307: 构建：PEP 440

• #4310: 错误修复：使 stats.geom.logpmf(1,1)返回 0.0 而不是 nan

• #4311: 测试：恢复使用 slogdet 的测试，因为我们已经放弃...

• #4313: 为 stats.wishart 增加一些小修复。

• #4315: 维护：删除稀疏矩阵测试中的 numpy 1.5 兼容代码

• #4318: 增强：向多变量分布添加 random_state

• #4319: 维护：修复用于稀有数组的汉明距离回归问题，以及…

• #4320: 测试：一些变更，例如 self.assertTrue(x == y, message) -> assert_equal(x,...

• #4321: 测试：更多变更，例如 self.assertTrue(x == y, message) -> assert_equal(x,...

• #4322: 测试：在 test_signaltools 中，变更如 self.assertTrue(x == y,...

• #4323: 维护：清理基准测试，使它们可以作为单个文件运行。

• #4324: 添加更详细的提交者指南，更新 MAINTAINERS.txt

• #4326: 测试：在 test_hierarchy.py 中使用 numpy.testing

• #4329: 维护：stats 模块重命名 check_random_state 测试函数

• #4330: 更新距离测试

• #4333: 维护：从 scipy.special 导入 comb 和 factorial，而不是 scipy.misc

• #4338: 测试：从 nose 转换为 numpy.testing 的更多转换

• #4339: 维护：从 special_matrices.py 中删除已弃用的 all_mat 函数

• #4340: 向冻结分布添加多个特性

• #4344: 错误修复：修复/测试 qr 中无效的 lwork 参数

• #4345: 修复：修复 Python 3.x 下可见的测试噪音

• #4347: 移除已弃用的 blas/lapack 导入，将 lib 重命名为 _lib

• #4349: 文档：为 stats.binned_statistic 添加一个非平凡的例子。

• #4350: 维护：移除 0.16.0 版本中的 optimize.anneal（在 0.14.0 版本中已弃用）。

• #4351: 维护：修复在 optimize 中使用过时的 Numpy C API…

• #4352: MAINT: 修复若干特殊测试失败。

• #4353: 实现 betaprime 分布的累积分布函数。

• #4357: BUG: 修复分段多项式的反导数计算问题。

• #4358: BUG: 在 odeint 中修复对带状雅可比矩阵的处理，以及…

• #4359: MAINT: 移除对 Python 版本 < 2.5 的代码路径。

• #4360: MAINT: stats.mstats: 移除一些未使用的变量（感谢 pyflakes）。

• #4362: 移除错误引用的平滑参数 #4072。

• #4363: MAINT: interpolate: 清理 fitpack.py 中的代码。

• #4364: MAINT: lib: 不从 decorator 导出 “partial”。

• #4365: svdvals 现在返回长度为 0 的奇异值序列。

• #4367: DOC: 稍微改善 wishart/invwishart 文档的 TeX 渲染。

• #4373: ENH: 为 solve_banded 和 solveh_banded 添加 gtsv 和 ptsv 封装。

• #4374: ENH: 对 spatial.cKDTree 进行增强。

• #4376: BF: 修复读取非标准 Matlab 逻辑稀疏矩阵的问题。

• #4377: MAINT: integrate: 清理一些 Fortran 测试代码。

• #4378: MAINT: 修复 signal 中使用的已弃用 Numpy C API。

• #4380: MAINT: scipy.optimize，进一步移除模拟退火相关内容。

• #4381: ENH: 使 DCT 和 DST 接受 int 和复数类型，类似于 fft。

• #4392: ENH: optimize: 添加 DF-SANE 非线性无导数求解器。

• #4394: 使重新排序算法在 64 位环境下正常运行。

• #4396: BUG: 在 Accelerate ABI 包装器中捆绑 cblas.h 以便进行编译…

• #4398: FIX: 修复 pdist 中 wminkowski 函数的错误，其中 w.dtype != double。

• #4402: BUG: 修复 stat.hypergeom 的参数检查。

• #4404: MAINT: 在 C 循环中填充完整的对称 squareform。

• #4405: BUG: 避免 X += X.T 的操作（参见 #4401）。

• #4407: 提高小 x 下 gompertz 分布的精度。

• #4414: DOC: 修复 scipy.signal.cwt 文档中的错误。

• #4415: ENH: 提高 lomax 分布在小 x 下的精度。

• #4416: DOC: 在 SuperLU.solve… 的 docstring 中更正一个参数名…

• #4419: 在主分支中还原 scipy.linalg.calc_lwork

• #4420: 修复稀疏求解器的性能问题

• #4423: ENH: 提高大 x 的 rayleigh 精度。

• #4424: BUG: optimize.minimize：修复整数 x0 输入的溢出问题。

• #4425: ENH: 改进 truncexpon 对小 x 的精度

• #4426: ENH: 提高大 x 的 rayleigh 精度。

• #4427: MAINT: optimize：清理 TNC 代码

• #4429: BLD: 修复与 numpy 1.7.x 和 1.8.x 的构建失败。

• #4430: BUG: 修复 sparse.dok_matrix set/get 复制粘贴错误

• #4433: 更新 _minimize.py

• #4435: ENH: 在批量距离计算周围释放 GIL

• #4436: 修复 spsolve 的不完整文档

• #4439: MAINT: integrate：测试中进行一些清理。

• #4440: 快速排列 t 检验

• #4442: DOC: 优化：修复文档字符串中的错误结果

• #4447: DOC: 信号：补充一些文档以配合…

• #4448: DOC: 调整 lapack.linalg 模块的文档字符串

• #4449: 修正 expit 文档字符串中的拼写错误

• #4451: ENH: 使用 gcc 向量化距离循环

• #4456: MAINT: 在 MemoryError 上不要失败大数据测试

• #4461: CI: 使用 travis_retry 处理网络超时

• #4462: DOC: 统一 minimize() 等函数的文档

• #4470: MAINT: 稀疏：继承自 spmatrix 的 dok_matrix.toarray

• #4473: BUG: signal：修复 sosfilt 中 zi 形状的验证。

• #4475: BLD: setup.py：更新最小 numpy 版本并支持 “setup.py…

• #4481: ENH: 添加新的线性代数特殊矩阵：Helmert 矩阵

• #4485: MRG: 一些更改以允许读取错误的 mat 文件

• #4490: [ENH] linalg.hessenberg：使用 orghr - 重整

• #4491: ENH: 线性代数：为潜在有用的 LAPACK 函数添加包装器…

• #4493: BENCH: solve_toeplitz 基准使用过时语法和…

• #4494: MAINT: stats: 删除重复代码

• #4496: 为 watershed_ift 算法添加了参考文献

• #4499: DOC: 重新排列 stats 分布文档

• #4501: 用 airspeed velocity 替换基准套件

• #4502: SLSQP 应严格满足边界约束

• #4503: DOC: 向前移植 0.15.x 发布说明并更新作者姓名…

• #4504: ENH: 选项避免计算可能未使用的 svd 矩阵

• #4505: PR 3303（稀疏矩阵范数）的重基

• #4507: MAINT: 修复 lobpcg 性能退化

• #4509: DOC: sparse: 替换失效链接

• #4511: 修复差分进化 bug

• #4512: 完全符合 PEP440 的 dev 版本号更改（始终…

• #4525: 进行微小样式修正（pep8）

• #4533: 添加指数修正高斯分布（scipy.stats.expongauss）

• #4534: MAINT: benchmarks: 使基准套件在所有 scipy 上可导入…

• #4535: BUG: 将 zip() 更改为 list(zip()) 以便在 Python 中正常工作…

• #4536: 追踪 pr 4348（指数窗口）的后续

• #4540: ENH: 空间: 添加 Procrustes 分析

• #4541: 修复基准问题

• #4542: TST: NumpyVersion dev -> dev0

• #4543: BUG: savgol_coeffs 中的溢出

• #4544: 对 stats 进行 pep8 修正

• #4546: MAINT: 在一范数估计中使用减少轴参数

• #4549: ENH: 在 scipy.signal 中添加了 group_delay

• #4553: ENH: 显著加快时刻函数

• #4556: DOC: 文档了 sparse.linalg.svds 的更改（可选…

• #4559: DOC: stats: 描述文档字符串中的 loc 和 scale 参数…

• #4563: ENH: 重写 stats.ppcc_plot

• #4564: 更宽容（或更不宽容）地接受用户传递的 +-inf 而不是…

• #4566: 弃用：从 scipy.stats 中删除一些已弃用的函数，…

• #4570: 维护：在 scipy.optimize 测试中抑制 LineSearchWarning

• #4572: 增强：从 L-BFGS-B 中提取逆 Hessian 信息

• #4576: 增强：将 signal.lti 拆分为子类，属于#2912 的一部分

• #4578: 维护：调和 docstrings 和函数签名

• #4581: 在 Linux 上修复与 Intel MKL 的构建

• #4583: 文档：optimize：删除对未使用的 disp kwarg 的引用

• #4584: 增强：scipy.signal - Tukey 窗口

• #4587: Hermite 渐近

• #4593: 文档 - 向 RegularGridInterpolator 添加示例

• #4595: 文档：修正 tutorial/optimize 中错误的 latex 字符。

• #4600: 在 optimize.tnc 文档中添加返回码

• #4603: 增强：为矩阵范数包装 LAPACK 的*lange函数

• #4604: scipy.stats：广义正态分布

• #4609: 维护：插值：修复几处 docstrings 之间的不一致性…

• #4610: 维护：使 runtest.py –bench-compare 使用 asv 连续和…

• #4611: 文档：stats：解释 rice scaling；在 tutorial 中添加一个注释…

• #4614: 修复 bug：lfilter，未正确检查 zi 的大小对于 nd…

• #4617: 维护：整合：清理 odeint 背后的 C 代码。

• #4618: 修复：当窗口长度!=数据长度时引发错误

• #4619: 问题#4550：scipy.stats.mode - 空…

• #4620: 修复问题（#4590），svds 接受错误的特征值…

• #4621: 加快 special.ai_zeros/bi_zeros 的速度 10 倍

• #4623: 维护：对 spatial.procrustes 进行一些调整（私有文件，html…

• #4628: 加快 signal.lfilter 的速度，并为 FIR 滤波器添加卷积路径

• #4629: Bug：修复 integrate.nquad 中的问题；解决问题#4599

• #4631: 维护：整合：删除 Fortran 测试函数中未使用的变量。

• #4633: 维护：修复 remez 的收敛消息

• #4635: PEP8：缩进（以便 pep8 机器人不会抱怨）

• #4637: 维护：泛化符号函数以正确处理复数…

• #4639: 修正 apple_sgemv_fix.c 中的拼写错误

• #4642: 维护：使用 lapack 代替 scipy.linalg.norm

• #4643: RBF 默认 epsilon 过大 2020

• #4646: 在 invres 和 invresz 中 poly 周围添加 atleast_1d

• #4647: 修复文档 PDF 构建

• #4648: BUG：修复 #4408：minimize() 中的向量值约束…

• #4649: Vonmisesfix

• #4650: 信号示例清理在 Tukey 和 place_poles 中

• #4652: 文档：修复 convolve 中的同模式错误

• #4653: 提高 erf 性能

• #4655: DEP：弃用 scipy.stats.histogram2d，推荐使用 np.histogram2d

• #4656: DEP：弃用 scipy.stats.signaltonoise

• #4660: 避免对稀疏压缩 [:, seq] 和 [seq, :] 的额外复制…

• #4661: 清理、rebase #4478，添加 ?gelsy 和 ?gelsd 包装器

• #4662: 维护：修正 odeint 消息

• #4664: 更新 _monotone.py

• #4672: 修复 scipy.linalg.block_diag 对空输入的行为

• #4675: 修复 lsim

• #4676: 在文档字符串中的 :math: 指令中添加遗漏的冒号。

• #4679: 增强：稀疏 randn

• #4682: 增强：scipy.signal - 添加 CSD、coherence；增强…

• #4684: BUG：orthogonal.py 中权重计算的各种错误

• #4685: BUG：修复 #4594：optimize.linprog 在回调时的 IndexError…

• #4686: 维护：cluster：清理重复的异常抛出代码。

• #4688: 改进 is_distance_dm 异常消息

• #4692: 维护：简化 tukeylambda._ppf 中的计算

• #4693: 增强：添加对 stats._chk_asarray 中标量的处理功能

• #4694: 向量化 Anderson-Darling 计算。

• #4696: 修复 lfilter 中的单例展开。

• #4698: MAINT: 安静地处理 cephes 中的警告。

• #4701: 添加 Bpoly.antiderivatives / integrals

• #4703: 添加已发表论文的引用

• #4706: MAINT: special: 避免在 specfun 中越界访问

• #4707: MAINT: 修复涉及 np.matrix 作为函数输入的问题…

• #4709: ENH: scipy.stats 现在返回命名元组。

• #4710: scipy.io.idl: 使读取器对缺失变量更加健壮…

• #4711: 修复未知文件末尾块的崩溃

• #4712: 减少 onenormest 内存使用量

• #4713: MAINT: interpolate: 如果可能，无需传递 dtype…

• #4714: BENCH: 为 stats 模块添加基准测试

• #4715: MAINT: 磨光 signal.place_poles 和 signal/test_ltisys.py

• #4716: DEP: 废弃 mstats.signaltonoise …

• #4717: MAINT: basinhopping: 修复测试中的错误，消除 /0 警告，…

• #4718: ENH: stats: 可以通过名称指定要在拟合中修复的 f-shapes

• #4721: 文档说明 imresize 将输入转换为 PIL 图像

• #4722: MAINT: PyArray_BASE 不是 lvalue，除非使用了已弃用的 API…

• #4725: 修复 gengamma _nump 失败

• #4728: DOC: 将 poch 添加到 scipy 特殊函数描述列表中

• #4735: MAINT: stats: 避免 skew 中（虚假的）除零

• #4738: TST: 消除在 stats 中一些边界情况的运行时警告

• #4739: BLD: 尝试构建 numpy 而不是使用 TravisCI 上的那个

• #4740: DOC: 更新某些文档字符串，带有‘versionadded’。

• #4742: BLD: 确保在… 上放宽步幅检查生效

• #4750: DOC: special: TeX 对 rel_entr、kl_div 和 pseudo_huber 的排版

• #4751: BENCH: 添加稀疏空 null 切片基准测试

• #4753: BUG: 与最新的 Cython 版本编译修复

• #4756: BUG: 修复 #4733：optimize.brute 完成选项与…

• #4758: DOC：optimize.leastsq 默认 maxfev 澄清

• #4759: 改进的 stats mle fit

• #4760: MAINT：更仔细地计算 bfgs 更新

• #4762: BUGS：修复 #4746 和 #4594：linprog 返回违反解决方案的问题

• #4763: 修复 linprog 中的小 bug

• #4766: BENCH：添加 signal.lsim 基准测试

• #4768: 修复文档字符串示例中的 Python 语法错误

• #4769: 修复 #4726：test_cobyla.test_vector_constraints

• #4770: 将 FITPACK 函数标记为线程安全。

• #4771: 编辑 scipy/stats/stats.py 以修复 fisher_exact 的 doctest

• #4773: DOC：更新 0.16.0 发布说明。

• #4775: DOC：linalg：添加 funm_psd 作为文档字符串示例

• #4778: 使用字典表示函数名称的同义词

• #4780: 在文档中包括显然被遗忘的函数

• #4783: 将许多缺失的特殊函数添加到文档中

• #4784: 在 PPoly 和相关函数中添加 axis 属性

• #4785: 关于 Lena 图像来源的简短说明

• #4786: DOC：重新格式化 KDE 文档字符串的方法部分

• #4787: 添加 rice cdf 和 ppf。

• #4792: CI：为检测试图掩盖的测试失败添加一个权宜之计…

• #4795: 使 refguide_check 对误报更加智能化

• #4797: BUG/TST：增量 Voronoi 的 numpoints 未更新

• #4799: BUG：空间：修复 Mahalanobis 度量的几个边缘情况…

• #4801: BUG：当 disp=True 时修复 scipy.optimize._trust-region.py 中的 TypeError。

• #4803: QR 更新例程中宽松步幅的问题

• #4806: MAINT：为 cauchy fit 使用明智的初始猜测

• #4810: PEP8 化 codata.py

• #4812: BUG：decomp_update.pyx.in 中的宽松步幅清理

• #4820: BLD：更新 Bento 构建以修复 sgemv 和安装 cython blas/lapack…

• #4823: ENH：scipy.signal - 添加 spectrogram 函数

• #4827: DOC: 在 init.py 中添加 csd 和 coherence

• #4833: BLD: 修复在 g77 构建中 linalg *lange 包装器的问题

• #4841: TST: 由于 mingw32 中 scipy.special 中的测试失败修复测试失败...

• #4842: DOC: 更新 site.cfg.example。大部分来自 NumPy

• #4845: BUG: signal: 使 spectrogram 的返回值顺序匹配...

• #4849: DOC: 修复 ode 文档字符串示例中的错误

• #4856: BUG: 修复导致内存泄漏的拼写错误