论文链接：doi.org/[10.1080/07…]
研究介绍
做了什么？
将SARS-Cov-2主蛋白酶（SCM）与五种常见的新冠抑制剂的相互作用模式进行了探究和分析，揭示不同抑制剂的动态结合模式
提供了什么insight？ 发现共价抑制剂和非共价抑制剂与SCM结合存在显著差异
研究总结
静态研究(分子对接) 原始晶体抑制剂N3表现出最强的结合亲和力，NMV、ESV、RTV和LPV也具有较强的结合能力
动态研究(分子动力学模拟、结合自由能计算和QM/MM方法) 探索SCM与抑制剂相互作用的动态过程。研究结果表明，ESV的构象变化最小，而NMV则依靠水桥来稳定结合。此外，NMV的共价加成能力较N3较低，但其结合亲和力可能优于或与N3相当。考虑到其较小的分子量，NMV和ESV可以作为SCM抑制剂的模板或分子优化的起点。、
