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GWAS,全基因组选择知识介绍
育种数据分析之放飞自我
创建于2021-07-18
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GWAS,全基因组选择知识介绍
暂无订阅
共6篇文章
创建于2021-07-18
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关于Linux的grep -f命令,我以为我发现了bug
事情是这个样子的: 今天,我像往常一样提取基因组的样本,我有一堆样本的ID,需要从所有的基因型的文件中提取出来。 以前我都是使用R语言,将基因型数据读进去,将所要提取的ID文件读进去,然后,我就有很多
如何高效学习GWAS分析
大家好,我是飞哥,今天随便聊聊关于高效学习一个新事物。 工作了一天,开了半天的会,敲了半天的代码,典型的周一呀! 话说前几天我的公众号关注人数超过了一万,非常感谢大家的支持。我之前分享了一篇GWAS的
使用TASSEL学习GWAS笔记(3/6):基因型数据可视化:kingship,PCA,MDS
笔记计划分为六篇: 第一篇:读取plink基因型数据和表型数据 第二篇:对基因型数据质控:缺失质控,maf质控,hwe质控,样本质控 第三篇:基因型数据可视化:kingship,LD,MDS,PCA
使用TASSEL学习GWAS笔记(2/6):对基因型数据进行质控及导出基因型
昨天,我介绍了TASSEL的安装和读取plink基因型数据,使用TASSEL学习GWAS笔记(1/6):读取plink基因型数据和表型数据 这里,我们查看一下基因型数据导入后,如何对数据进行质控。 1
使用TASSEL学习GWAS笔记(1/6):读取plink基因型数据和表型数据
今天整理一下TASSEL操作GWAS的笔记。 笔记计划分为四篇: 第一篇:读取plink基因型数据和表型数据 第二篇:对基因型数据质控:缺失质控,maf质控,hwe质控,样本质控 第三篇:基因型数据可
GWAS分析中协变量的区分(性别?PCA?初生重?)
1. 电子书领取 前几天发了一篇GWAS电子书分享,异常火爆,阅读量8000+,很多人评价比较基础。这本电子书主要特点是比较基础,GLM模型用软件和R语言进行比较,如何添加数字协变量、因子协变量、PC