期刊:Journal of Proteomics;影响因子:4.0638
原文:DOI: 10.1016/j.jprot.2021.104281
研究对象:鸭肠炎病毒(DEV)
研究目的:探索DEV病毒的感染和致病机制
研究手段:互作蛋白质组学等
研究内容及结论:鸭肠炎病毒(DEV)是鸭病毒性肠炎的病原,可在禽形目(水禽)中引起一种传染性、致死性的病毒性疾病。在病毒感染中,宿主-病毒相互作用在病毒复制和发病机制中起着至关重要的作用。在作者之前的研究中,将MRFP与DEV糖蛋白C(GC)的C末端融合,构建了荧光标记的DEV病毒rgCRFP。本研究采用荧光融合蛋白(gC-mRFP)作为蛋白质组学探针。使用商业抗RFP抗体对rgCRFP感染的鸡胚胎成纤维细胞的蛋白进行免疫共沉淀和质谱分析,共鉴定出21个与gC相互作用的宿主蛋白。在这21种蛋白质中,通过膜结合裂解泛素酵母双杂交系统(MbYTH)和双分子荧光互补(BIFC)分析证实了7种宿主蛋白(GNG2、AR1H1、PPP2CA、UBE2I、MCM5、NUBP1、HN1)与DEV GC蛋白的相互作用。本研究进一步加深了对DEV病毒感染和致病机制的认识。
利用Co-IP结合质谱技术研究DEV GC与宿主蛋白的相互作用网络,用RFP标签从rgCRFP感染的CEF裂解物中免疫沉淀GC相关宿主蛋白进行亲和纯化。随后,对共纯化的宿主因子进行LC-MS/MS分析,结果鉴定出14284个多肽和2800个蛋白质。经过三次重复分析,共有21种细胞蛋白被确认为GC相互作用蛋白。
参考文献:Chen L, Ni Z, Hua J, et al. Proteomic analysis of host cellular proteins co-immunoprecipitated with duck enteritis virus gC[J]. Journal of Proteomics, 2021, 245: 104281.