TMT标记定量蛋白组学客户案例

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期刊:Amb Express;影响因子:4.2452

原文:DOI: 10.1186/s13568-021-01187-8

研究对象:肺炎支原体

研究目的:探究肺炎支原体的大环内酯耐药决定因素

研究手段:定量蛋白质组学等

研究内容及结论:肺炎支原体是导致儿童和青少年群体感染获得性肺炎的主要原因之一。由于大环内酯类药物在临床治疗中的广泛应用,耐大环内酯类肺炎支原体菌株在世界范围内越来越普遍。然而,肺炎支原体耐药性的分子机制知之甚少。在本研究中,作者使用串联质量标签定量蛋白质组学技术分析了肺炎支原体的大环内酯类敏感株和大环内酯类耐药株的全部蛋白质组,数据可通过 ProteomeXchange 获得,标识符为 PXD022220。总共鉴定出165个差异表达的蛋白质,其中80个在耐药株中上调,85个下调。功能分析表明,这些蛋白主要影响蛋白质和多肽的生物合成过程、核糖体和跨膜转运蛋白的活性,这表明它们与肺炎支原体对大环内酯类抗生素耐药的机制有关。

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利用TMT标记定量蛋白质组学分析肺炎支原体的大环内酯类敏感株耐药株差异表达蛋白,对肺炎支原体C267和M129菌株进行了TMT标记的定量蛋白质组检测,共检测到与531个蛋白质相对应的7263个多肽。在倍数变化≥ 1.2(上调)或≤ 1/1.2(上调)和 p 值≤截止值 0.05 时进行严格比较,以确定 DEP。当比较大环内酯类抗性菌株(C267)与大环内酯类敏感菌株(M129)时,观察到165个DEP,其中80个上调,85个下调。

参考文献:Li S, Xue G, Zhao H, et al. Quantitative proteomics analysis of Mycoplasma pneumoniae identifies potential macrolide resistance determinants[J]. AMB Express, 2021, 11: 1-11.