C端氨基酸测序是确定蛋白质或多肽链 C 末端氨基酸顺序的分析技术，主要用于确定蛋白质分子链末端的氨基酸顺序。在蛋白质结构中，C端（羧基末端）是指蛋白质多肽链中含有游离羧基的末端。了解C端氨基酸的序列信息对于研究蛋白质的功能、活性、稳定性等方面具有意义。C 端氨基酸测序在新药研发里，用于剖析重组蛋白药物的 C 端完整性；在基础科研中，辅助解析蛋白折叠起始位点，众多领域都离不开它精准的分析结果。在生物制药领域，C端氨基酸测序能够帮助科学家们了解药物蛋白的结构完整性和突变情况，这对于保证药物的安全性和有效性至关重要。在疾病诊断中，C端氨基酸测序可以用于鉴定与特定疾病相关的蛋白质标记物，更精确地指导疾病的检测和治疗。此外，C端氨基酸测序在基础生命科学研究中也是不可或缺的。通过揭示蛋白质序列信息，研究人员可以更深入地了解蛋白质的功能机制以及它们在细胞内的作用。
C端氨基酸测序方法及原理解析
1、传统化学法
以羧肽酶法为典型，羧肽酶是一类可从肽链 C 端逐一水解氨基酸的酶。不同的羧肽酶，像羧肽酶 A、B 等 ，各有偏好的氨基酸水解类型。把蛋白质样本与羧肽酶一同孵育，按既定时间间隔取样，用色谱或电泳手段分离鉴定释放出的氨基酸，依照氨基酸出现先后顺序，推导 C 端序列。
（1）优势：操作相对简便，无需繁杂仪器，成本较为低廉；还能动态监测氨基酸释放过程，获取酶解动力学信息。
（2）局限：难以确定多个连续相同氨基酸的排列，一旦遇上这类情况，释放的氨基酸无法精准对应链上的位置；而且酶解速度不好掌控，太快易丢失中间数据，太慢则耗时漫长。
2、现代质谱法
常采用液相色谱 - 串联质谱（LC-MS/MS ）技术。先是蛋白样品经酶切生成肽段，经液相色谱依疏水性、电荷等特性分离，再进入质谱仪。在质谱里，肽段离子化后先测分子量，接着特定肽段选作母离子，经碰撞诱导解离产生碎片，从碎片离子质量差值推算氨基酸序列，聚焦于 C 端肽段就能解析 C 端序列。
（1）优势：灵敏度超高，微量样品也能分析，对珍贵稀少的蛋白样本极为友好；分辨率出色，能清晰区分结构相似的氨基酸；并且可同步获取修饰信息，察觉 C 端的糖基化、磷酸化修饰。
（2）局限：仪器价格高昂，运维成本高，需要专业操作人员；数据解析复杂，要借助专门软件与数据库匹配，新手入门有难度。
3、Edman 降解衍生法
Edman 试剂（异硫氰酸苯酯 ）和蛋白 C 端氨基酸反应，生成的衍生物经裂解、转化步骤，产生稳定的 PTH - 氨基酸，可通过高效液相色谱鉴定。每轮反应仅让 C 端首个氨基酸脱落，循环操作，就能逐个测定氨基酸。
（1）优势：测序结果精准，一次反应只切下一个氨基酸，定位清晰；能与自动化测序仪联用，实现高通量测序。
（2）局限：遇上修饰氨基酸，反应会受干扰，无法正常测序；随着肽链增长，后续循环的测序效率与准确性会降低。
不同的蛋白质由于其结构的复杂性和多样性，可能具有不同的C端修饰和变体，这给C端氨基酸测序带来了挑战。为此，科学家们不断优化测序技术，提高其准确性和效率。例如，通过引入新的化学试剂和改进酶切技术，研究人员能够更有效地识别和分析蛋白质的C端序列。在实际应用中，C端氨基酸测序常常与其他蛋白质分析技术结合使用，如N端氨基酸测序、全蛋白质质谱分析等，以提供更全面的蛋白质结构信息。这种组合技术的应用，为复杂蛋白质的研究提供了强有力的工具。百泰派克生物科技在C端氨基酸测序领域积累了丰富的经验。我们拥有一支由专业研究人员和技术专家组成的团队，致力于为客户提供高质量的C端序列分析服务。我们的服务涵盖从样品制备、测序分析到数据解析的全过程，确保为客户提供准确可靠的结果。通过与我们合作，客户可以获得定制化的解决方案，以满足其特定的研究需求。
