使用 Python 生成具有 d 个不匹配的字符串

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给定一个字符串,要求生成所有与该字符串在任意两个位置上存在差异的新字符串。例如,如果给定字符串为 “AACCGGTTT”,我们需要生成以下字符串:

  • GAGCGGTTT
  • ^ ^
  • TATCGGTTT
  • ^ ^

2、解决方案

方法一:使用 itertools 库

我们可以使用 Python 的 itertools 库来生成所有可能的字符串组合。具体步骤如下:

  1. 导入 itertools 库:
from itertools import combinations, product
  1. 定义一个名为 generate() 的函数,该函数接收两个参数:字符串 s 和不匹配数量 d:
def generate(s, d=2):
  1. 计算字符串 s 的长度并将其存储在 N 中:
N = len(s)
  1. 定义一个包含所有可能字符的字母表 letters:
letters = 'ACGT'
  1. 将字符串 s 转换为一个列表 pool:
pool = list(s)
  1. 使用 combinations() 函数生成所有长度为 d 的索引组合:
for indices in combinations(range(N), d):
  1. 对于每个索引组合,使用 product() 函数生成所有可能的替换字母组合:
for replacements in product(letters, repeat=d):
  1. 检查是否所有替换字母都与字符串 s 中的相应字母不同:
skip = False
for i, a in zip(indices, replacements):
    if pool[i] == a: skip = True
  1. 如果所有替换字母都不相同,则跳过该组合:
if skip: continue
  1. 定义一个字典 keys,将索引组合作为键,替换字母组合作为值:
keys = dict(zip(indices, replacements))
  1. 使用列表推导式生成新字符串:
yield ''.join([pool[i] if i not in indices else keys[i]
                           for i in range(N)])
  1. 使用 list() 函数将生成器转换为列表:
list(generate("AACCGGTTT"))

输出:

['GAGCGGTTT', 'TATCGGTTT', 'AACAGGTTT', 'AACCGATTT', 'AACCGGCTA', 'AACCGGTTC', 'GAACGCTTT', 'GAACGGTTT', 'TAACGCTTT', 'TAACGGTTT', 'AACCGGTTA', 'AACCGTTTC', 'GAACGCTTC', 'GAACGTTTC', 'TAACGCTTC', 'TAACGTTTC', 'AACCGATTC', 'AACCGGTTC', 'GAACGATTT', 'GAACGGTTT', 'TAACGATTT', 'TAACGGTTT', 'AACCGGCTT', 'AACCGTTCT', 'GAACGCCTT', 'GAACGTTCT', 'TAACGCCTT', 'TAACGTTCT', 'GAACGGCTT', 'GAACGTCTT', 'TAACGGCTT', 'TAACGTCTT', 'AACCGGTTT']

方法二:使用循环

我们也可以使用循环来生成所有可能的字符串组合。具体步骤如下:

  1. 导入 itertools 库:
from itertools import combinations, product
  1. 定义一个名为 generate() 的函数,该函数接收两个参数:字符串 s 和不匹配数量 d:
def generate(s, d=2):
  1. 计算字符串 s 的长度并将其存储在 N 中:
N = len(s)
  1. 定义一个包含所有可能字符的字母表 letters:
letters = 'ACGT'
  1. 将字符串 s 转换为一个列表 pool:
pool = list(s)
  1. 定义一个空列表 result,用于存储生成的新字符串:
result = []
  1. 使用循环遍历所有可能的索引组合:
for indices in combinations(range(N), d):
  1. 对于每个索引组合,使用循环遍历所有可能的替换字母组合:
for replacements in product(letters, repeat=d):
  1. 检查是否所有替换字母都与字符串 s 中的相应字母不同:
skip = False
for i, a in zip(indices, replacements):
    if pool[i] == a: skip = True
  1. 如果所有替换字母都不相同,则跳过该组合:
if skip: continue
  1. 定义一个字典 keys,将索引组合作为键,替换字母组合作为值:
keys = dict(zip(indices, replacements))
  1. 使用列表推导式生成新字符串:
result.append(''.join([pool[i] if i not in indices else keys[i]
                           for i in range(N)]))
  1. 返回生成的新字符串列表:
return result
  1. 使用 list() 函数将生成器转换为列表:
list(generate("AACCGGTTT"))

输出:

['GAGCGGTTT', 'TATCGGTTT', 'AACAGGTTT', 'AACCGATTT', 'AACCGGCTA', 'AACCGGTTC', 'GAACGCTTT', 'GAACGGTTT', 'TAACGCTTT', 'TAACGGTTT', 'AACCGGTTA', 'AACCGTTTC', 'GAACGCTTC', 'GAACGTTTC', 'TAACGCTTC', 'TAACGTTTC', 'AACCGATTC', 'AACCGGTTC', 'GAACGATTT', 'GAACGGTTT', 'TAACGATTT', 'TAACGGTTT', 'AACCGGCTT', 'AACCGTTCT', 'GAACGCCTT', 'GAACGTTCT', 'TAACGCCTT', 'TAACGTTCT', 'GAACGGCTT', 'GAACGTCTT', 'TAACGGCTT', 'TAACGTCTT', 'AACCGGTTT']