香港公司在国内申请商标是受到法律保护的。根据搜索结果，以下是一些关键点：
- 商标地域性：商标申请具有地域性，在哪里注册就受到哪里的保护。
- 香港公司在内地注册商标的条件：香港公司属于外国人或者外国企业，需要有一个在内地的合法代理人，例如一个商标代理机构或者一个律师事务所，来代表香港公司申请商标注册。
- 法律保护：注册商标受注册方的产权保护。例如，注册大陆的商标仅受大陆的知识产权保护，注册香港的商标受香港的知识产权保护。
- 注册流程：香港公司注册内地商标的流程包括选择并委托合法代理人、设计商标图样、确定商品或服务类别、提交申请、等待审查、公告、领取商标注册证等步骤。
- 注意事项：香港公司注册内地商标需要注意遵守内地的商标法和相关规定，商标的独特性和显著性，以及商标的有效期和续展。
- 保护作用：如果香港公司想要在大陆保护其商标，最好的办法就是在香港和大陆同时注册商标，这样可以有效地对商标起到保护作用。
综上所述，香港公司在国内申请商标，只要遵循内地的商标法规和程序，其商标是受到内地法律保护的。
