Jupyter Notebook 中同时使用 Python 和 R

在 Jupyter Notebook 中同时使用 Python 和 R

可以通过 rpy2 库实现 Python 和 R 的混合编程。以下是具体步骤：

1. 安装 rpy2

如果还没有安装 rpy2，在终端中运行以下命令：

pip install rpy2

2. 安装 R 包

在 R 环境中安装所需的包。打开 R 或 RStudio，运行以下命令：

install.packages("neurobase")
install.packages("WhiteStripe")

3. 安装依赖包

在终端中安装 numpy 和 pandas：

pip install numpy pandas

4. 在 Jupyter Notebook 中使用

加载 rpy2 扩展

在 Jupyter Notebook 中运行：

%load_ext rpy2.ipython

导入 R 包

运行以下代码加载 R 库：

from rpy2.robjects.packages import importr

# 加载 R 库
neurobase = importr('neurobase')
whitestripe = importr('WhiteStripe')

使用 R 函数

调用 R 包中的函数：

# 示例：调用 neurobase 中的某个函数
result = neurobase.some_function()  # 替换成实际的函数

注意事项

• 确保在运行 Python 代码之前，已安装所需的 R 包。
• 在 Jupyter Notebook 中使用 R 和 Python 代码时，注意切换代码单元的语言环境。rpy2 允许在同一 Notebook 中混合使用两种语言，增强数据分析和可视化能力。