蛋白差异分析中的对照组是指在实验设计中用作参照的样本或条件，以便与实验组进行比较。对照组的设定对于确保实验结果的有效性和可靠性至关重要。
图1. 差异表达蛋白韦恩图
图2. 差异表达蛋白火山图
在蛋白差异分析中，对照组的具体性质取决于研究的目的和设计，常见的类型包括：
1、正常对照组：
这种类型的对照组通常包含正常或未处理的样本。例如，在研究某种疾病的蛋白质表达模式时，正常对照组可能是来自健康个体的相应组织或细胞样本。
2、空白对照组：
在某些实验中，可能需要设置一个空白对照组，其中不包含任何实验处理（如药物处理、基因敲除等）。
3、阴性对照组：
用于确保实验过程中不会产生假阳性结果。例如，在药物研究中，阴性对照组可能接受了无活性成分的处理。
4、时间点对照组：
在长期研究中，可能会设置不同时间点的对照组，以观察蛋白质表达随时间的变化。
5、实验条件对照组：
当研究的重点是某种特定实验条件对蛋白质表达的影响时，可以设置相应条件的对照组，以此为基准比较不同条件下的蛋白质表达差异。
对照组的正确选择和设计对于获得可靠、准确的蛋白差异分析结果至关重要，它们提供了必要的基准，以评估实验处理对蛋白质表达的影响。
