TMT定量质谱

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TMT(Tandem Mass Tag)是一种广泛应用于定量蛋白质组学的技术。TMT是一种化学标记方法,用于定量蛋白质组学。不同样本的肽段会被不同的等同位素标签标记。这些标签在质谱中具有相同的质量,但当它们在质谱仪中被分解时,会释放不同的报告离子。通过比较这些报告离子的强度,可以确定肽段在不同样本中的相对丰度。

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图1. 基于TMT的蛋白质组学服务工作流程

1、优势:
  • 多路复用:可以同时分析多个样本,从而加速实验流程并减少实验变异性。
  • 精确度:由于使用了特定的标签,可以提高肽段的识别准确性。
  • 宽广的动态范围:适用于检测丰度差异大的蛋白质。
2、局限性:
  • 成本:与无标签方法相比,化学标记可能增加实验的成本。
  • 比率压缩:可能由于不完全的离子隔离或干扰物种的共同隔离引起。
  • 样本处理:需要更多的样本处理步骤,可能导致样本损失或引入实验偏差。
3、应用:

TMT技术广泛应用于蛋白质组学研究,特别是在需要定量比较不同条件或处理下的样本时,如疾病研究、药物作用机制研究等。

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