SWATH定量蛋白组学

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"SWATH" 是 "Sequential Window Acquisition of all Theoretical Mass Spectra" 的缩写,它是一种质谱技术,常用于蛋白质组学定量分析。今天小编就带大家一起了解一下 SWATH 定量蛋白组学的基本原理和特点:

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图1. SWATH定量蛋白组学服务技术平台

1、基本原理:

在 SWATH 分析中,质谱仪连续地和自动地扫描一系列质量窗口,覆盖所有潜在的前体离子。这样,理论上所有可能的离子都会被检测到。与定性的数据依赖扫描 (DDA) 相比,SWATH 为数据独立扫描 (DIA) 提供了更加系统的、无偏的数据收集方式。

2、定量特点:

SWATH 的特点是它可以在复杂样本中进行多成分的高通量、高重复性和高精度的定量分析。这使得它特别适合于那些需要大规模样本队列比较的研究,例如生物标志物发现。

3、数据处理:

由于 SWATH 收集的数据是非常复杂的,它通常需要特定的软件和算法进行数据提取和定量。这些软件会使用预先获取的蛋白质/肽段的质谱图库来辅助识别和定量。

4、应用领域:

SWATH 质谱技术在各种生物研究中都有应用,包括生物标志物鉴定、通路分析、蛋白质-蛋白质相互作用研究等。

5、与其他技术的比较:

与传统的数据依赖扫描 (DDA) 技术相比,SWATH 提供了更好的定量重复性和更广的动态范围。但由于其数据复杂性,数据分析可能会更加具有挑战性。

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