MyISAM 引擎： 一种非事务性的引擎，提供高速存储和检索，以及全文搜索能力，适合数据仓库等查询频繁的应用。MyISAM中，一个table实际保存为三个文件，.frm存储表定义，.MYD存储数据,.MYI存储索引。 NULL值被允许在索引的列中。该引擎下安全性较低，而且认为写操作比读操作重要，所有应用在需要大量更新和查询操作的应用时可能导致查询被一致阻塞。
InnoDB 引擎： 一种事务安全的引擎，为MySQL提供了具有事务(commit)、回滚(rollback)和崩溃修复能力(crash recovery capabilities)的事务安全(transaction-safe (ACID compliant))型表。InnoDB表格速度很快.具有比BDB还丰富的特性,因此如果需要一个事务安全的存储引擎,建议使用它.如果你的数据执行大量的INSERT或UPDATE,出于性能方面的考虑，也应该使用InnoDB表。
InnoDB 提供了行锁(locking on row level)，还提供了与 Oracle 类型一致的不加锁读取(non-locking read in SELECTs)。这些特性均提高了多用户并发操作的性能表现。
在InnoDB表中不需要扩大锁定(lock escalation)，因为 InnoDB 的列锁定(row level locks)适宜非常小的空间。
InnoDB 是 MySQL 上第一个提供外键约束(FOREIGN KEY constraints)的表引擎。InnoDB 的设计目标是处理大容量数据库系统，它的 CPU 利用率是其它基于磁盘的关系数据库引擎所不能比的。
在技术上，InnoDB 是一套放在 MySQL 后台的完整数据库系统，
InnoDB 在主内存中建立其专用的缓冲池用于高速缓冲数据和索引。 InnoDB 把数据和索引存放在表空间里，可能包含多个文件，这与其它的不一样，举例来说，在 MyISAM 中，表被存放在单独的文件中。InnoDB 表的大小只受限于操作系统的文件大小，一般为 2 GB。InnoDB所有的表都保存在同一个数据文件 ibdata1 中(也可能是多个文件，或者是独立的表空间文件),相对来说比较不好备份，免费的方案可以是拷贝数据文件、备份binlog，或者用 mysqldump。
