阿尔茨海默病是一种退行性脑部疾病,影响着全世界数百万人。它是一种进行性疾病,会导致记忆力减退、认知能力下降,并最终导致无法执行基本任务。早期诊断和干预可以改善受疾病影响的人的生活质量。在本教程中,我们将使用深度学习技术从 MRI 脑部扫描中识别阿尔茨海默病。
数据预处理
我们将在本教程中使用阿尔茨海默病神经影像学倡议 (ADNI) 数据集。该数据集包含阿尔茨海默病患者和健康个体的 MRI 脑部扫描。我们将使用 T1 加权 MRI 图像进行分析。
首先,我们将加载数据集并将其拆分为训练集和测试集。我们还将通过调整图像大小和归一化像素值来预处理数据。
# 导入必要的库
import os
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.model_selection import train_test_split
from tensorflow.keras.preprocessing.image import load_img, img_to_array
from tensorflow.keras.utils import to_categorical
from tensorflow. keras.applications.mobilenet_v2 import preprocess_input
#加载元数据文件
metadata = pd.read_csv( 'ADNI_Metadata.csv')
# 创建列表来存储图像和标签 images
= []
labels = []
# 遍历元数据文件并
为i, row in metadata.iterrows() 加载图像和标签:
# 加载图像并将其调整为 224x224
img = load_img(row[ 'Image' ], target_size=( 224 , 224 ))
img_array = img_to_array(img)
# 预处理图像
img_array = preprocess_input(img_array)
images.append(img_array)
# 添加标签到列表
label =行[ '标签' ]
如果标签== 'CN':
labels.append( 0 )
elif label == 'AD' :
labels.append( 1 )
# 将数据转换为数组
images = np.array(images)
labels = np.array(labels)
# 将数据拆分为训练和测试设置
train_images, test_images, train_labels, test_labels = train_test_split(images, labels, test_size= 0.2 , random_state= 42 )
建立模型
我们将使用迁移学习来构建我们的模型。我们将使用已在 ImageNet 数据集上预训练的 MobileNetV2 架构。我们将添加一个 GlobalAveragePooling2D 层来降低输出的维度,并添加一个具有 S 形激活函数的密集层来将图像分类为阿尔茨海默病或健康。
from tensorflow.keras.applications.mobilenet_v2 import MobileNetV2
from tensorflow.keras.models import Model
from tensorflow.keras.layers import GlobalAveragePooling2D, Dense
#加载预训练的MobileNetV2模型
base_model = MobileNetV2(weights= 'imagenet' , include_top= False , input_shape=( 224 , 224 , 3 ))
# 添加一个 GlobalAveragePooling2D 层
x = base_model.output
x = GlobalAveragePooling2D()(x)
# 添加一个带有 sigmoid 激活函数的 Dense 层
output = Dense( 1, activation= 'sigmoid' )(x)
# 创建模型
model = Model(inputs=base_model.input , outputs=output)
# 冻结预训练模型的层
for layer in base_model.layers:
layer.trainable = False
# 编译模型
模型。编译(优化器= 'adam',损失= 'binary_crossentropy',指标=[ 'accuracy' ])
训练模型
我们将使用训练数据训练模型并在测试数据上对其进行评估。我们将使用二元交叉熵损失函数和 Adam 优化器。
# 训练模型
history = model.fit(train_images, train_labels, epochs=10, batch_size=32, validation_data=(test_images, test_labels)) # 在
测试数据上评估模型 test_loss
, test_acc = model.evaluate(test_images, test_labels)
print ( '测试准确度:' , test_acc)
预测阿尔茨海默病
我们现在可以使用经过训练的模型通过 MRI 脑部扫描来预测阿尔茨海默病。我们将加载样本图像并在进行预测之前对其进行预处理。
# 加载样本图像
img_path = 'sample_image.jpg'
img = load_img(img_path, target_size=(224, 224))
img_array = img_to_array(img)
img_array = preprocess_input(img_array)
img_array = np.expand_dims(img_array, axis=0)
# 进行预测
prediction = model.predict(img_array)
# Print the prediction
if prediction[0] < 0.5:
print('The image is classified as healthy.')
else:
print('The image is classified as Alzheimer's疾病。')
在本教程中,我们学习了如何使用深度学习技术从 MRI 脑部扫描中识别阿尔茨海默病。我们将迁移学习与 MobileNetV2 架构结合使用,并在测试数据上取得了良好的准确性。该技术可应用于其他医学影像数据集,以帮助疾病的早期检测和诊断。