28丨EM聚类(上):如何将一份菜等分给两个人?
今天我来带你学习 EM 聚类。EM 的英文是 Expectation Maximization,所以 EM 算法也叫最大期望算法。
我们先看一个简单的场景:假设你炒了一份菜,想要把它平均分到两个碟子里,该怎么分?很少有人用称对菜进行称重,再计算一半的分量进行平分。大部分人的方法是先分一部分到碟子 A 中,然后再把剩余的分到碟子 B 中,再来观察碟子 A 和 B 里的菜是否一样多,哪个多就匀一些到少的那个碟子里,然后再观察碟子 A 和 B 里的是否一样多……整个过程一直重复下去,直到份量不发生变化为止。
你能从这个例子中看到三个主要的步骤:初始化参数、观察预期、重新估计。首先是先给每个碟子初始化一些菜量,然后再观察预期,这两个步骤实际上就是期望步骤(Expectation)。如果结果存在偏差就需要重新估计参数,这个就是最大化步骤(Maximization)。这两个步骤加起来也就是 EM 算法的过程。
EM 算法的工作原理
说到 EM 算法,我们先来看一个概念“最大似然”,英文是 Maximum Likelihood,Likelihood 代表可能性,所以最大似然也就是最大可能性的意思。什么是最大似然呢?举个例子,有一男一女两个同学,现在要对他俩进行身高的比较,谁会更高呢?根据我们的经验,相同年龄下男性的平均身高比女性的高一些,所以男同学高的可能性会很大。这里运用的就是最大似然的概念。最大似然估计是什么呢?它指的就是一件事情已经发生了,然后反推更有可能是什么因素造成的。还是用一男一女比较身高为例,假设有一个人比另一个人高,反推他可能是男性。最大似然估计是一种通过已知结果,估计参数的方法。那么 EM 算法是什么?它和最大似然估计又有什么关系呢?EM 算法是一种求解最大似然估计的方法,通过观测样本,来找出样本的模型参数。再回过来看下开头我给你举的分菜的这个例子,实际上最终我们想要的是碟子 A 和碟子 B 中菜的份量,你可以把它们理解为想要求得的模型参数。然后我们通过 EM 算法中的 E 步来进行观察,然后通过 M 步来进行调整 A 和 B 的参数,最后让碟子 A 和碟子 B 的参数不再发生变化为止。
EM 聚类的工作原理
上面你能看到 EM 算法最直接的应用就是求参数估计。如果我们把潜在类别当做隐藏变量,样本看做观察值,就可以把聚类问题转化为参数估计问题。这也就是 EM 聚类的原理。相比于 K-Means 算法,EM 聚类更加灵活,比如下面这两种情况,K-Means 会得到下面的聚类结果。
因为 K-Means 是通过距离来区分样本之间的差别的,且每个样本在计算的时候只能属于一个分类,称之为是硬聚类算法。而 EM 聚类在求解的过程中,实际上每个样本都有一定的概率和每个聚类相关,叫做软聚类算法。你可以把 EM 算法理解成为是一个框架,在这个框架中可以采用不同的模型来用 EM 进行求解。常用的 EM 聚类有 GMM 高斯混合模型和 HMM 隐马尔科夫模型。GMM(高斯混合模型)聚类就是 EM 聚类的一种。比如上面这两个图,可以采用 GMM 来进行聚类。和 K-Means 一样,我们事先知道聚类的个数,但是不知道每个样本分别属于哪一类。通常,我们可以假设样本是符合高斯分布的(也就是正态分布)。每个高斯分布都属于这个模型的组成部分(component),要分成 K 类就相当于是 K 个组成部分。这样我们可以先初始化每个组成部分的高斯分布的参数,然后再看来每个样本是属于哪个组成部分。这也就是 E 步骤。再通过得到的这些隐含变量结果,反过来求每个组成部分高斯分布的参数,即 M 步骤。反复 EM 步骤,直到每个组成部分的高斯分布参数不变为止。这样也就相当于将样本按照 GMM 模型进行了 EM 聚类。
总结EM 算法相当于一个框架,你可以采用不同的模型来进行聚类,比如 GMM(高斯混合模型),或者 HMM(隐马尔科夫模型)来进行聚类。GMM 是通过概率密度来进行聚类,聚成的类符合高斯分布(正态分布)。而 HMM 用到了马尔可夫过程,在这个过程中,我们通过状态转移矩阵来计算状态转移的概率。HMM 在自然语言处理和语音识别领域中有广泛的应用。在 EM 这个框架中,E 步骤相当于是通过初始化的参数来估计隐含变量。M 步骤就是通过隐含变量反推来优化参数。最后通过 EM 步骤的迭代得到模型参数。在这个过程里用到的一些数学公式这节课不进行展开。你需要重点理解 EM 算法的原理。通过上面举的炒菜的例子,你可以知道 EM 算法是一个不断观察和调整的过程。通过求硬币正面概率的例子,你可以理解如何通过初始化参数来求隐含数据的过程,以及再通过求得的隐含数据来优化参数。通过上面 GMM 图像聚类的例子,你可以知道很多 K-Means 解决不了的问题,EM 聚类是可以解决的。在 EM 框架中,我们将潜在类别当做隐藏变量,样本看做观察值,把聚类问题转化为参数估计问题,最终把样本进行聚类。
29丨EM聚类(下):用EM算法对王者荣耀英雄进行划分
今天我们进行 EM 算法的实战,你需要思考的是:如何使用 EM 算法工具完成聚类?什么情况下使用聚类算法?我们用聚类算法的任务目标是什么?面对王者荣耀的英雄数据,EM 算法能帮助我们分析出什么?
如何使用 EM 工具包
我们看下如何在 sklearn 中创建 GMM 聚类。
首先我们使用 gmm = GaussianMixture(n_components=1, covariance_type=‘full’, max_iter=100) 来创建 GMM 聚类,其中有几个比较主要的参数(GMM 类的构造参数比较多,我筛选了一些主要的进行讲解),我分别来讲解下:1.n_components:即高斯混合模型的个数,也就是我们要聚类的个数,默认值为 1。如果你不指定 n_components,最终的聚类结果都会为同一个值。2.covariance_type:代表协方差类型。一个高斯混合模型的分布是由均值向量和协方差矩阵决定的,所以协方差的类型也代表了不同的高斯混合模型的特征。协方差类型有 4 种取值:covariance_type=full,代表完全协方差,也就是元素都不为 0;covariance_type=tied,代表相同的完全协方差;covariance_type=diag,代表对角协方差,也就是对角不为 0,其余为 0;covariance_type=spherical,代表球面协方差,非对角为 0,对角完全相同,呈现球面的特性。3.max_iter:代表最大迭代次数,EM 算法是由 E 步和 M 步迭代求得最终的模型参数,这里可以指定最大迭代次数,默认值为 100。创建完 GMM 聚类器之后,我们就可以传入数据让它进行迭代拟合。我们使用 fit 函数,传入样本特征矩阵,模型会自动生成聚类器,然后使用 prediction=gmm.predict(data) 来对数据进行聚类,传入你想进行聚类的数据,可以得到聚类结果 prediction。你能看出来拟合训练和预测可以传入相同的特征矩阵,这是因为聚类是无监督学习,你不需要事先指定聚类的结果,也无法基于先验的结果经验来进行学习。只要在训练过程中传入特征值矩阵,机器就会按照特征值矩阵生成聚类器,然后就可以使用这个聚类器进行聚类了。
如何用 EM 算法对王者荣耀数据进行聚类
具体的数据集你可以在 GitHub 上下载GitHub - cystanford/EM_data: EM聚类数据-王者荣耀英雄数据
流程
1首先我们需要加载数据源;2在准备阶段,我们需要对数据进行探索,包括采用数据可视化技术,让我们对英雄属性以及这些属性之间的关系理解更加深刻,然后对数据质量进行评估,是否进行数据清洗,最后进行特征选择方便后续的聚类算法;3聚类阶段:选择适合的聚类模型,这里我们采用 GMM 高斯混合模型进行聚类,并输出聚类结果,对结果进行分析。
`
-- coding: utf-8 --
import pandas as pd import csv import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns from sklearn.mixture import GaussianMixture from sklearn.preprocessing import StandardScaler
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data_ori = pd.read_csv('./heros7.csv', encoding = 'gb18030') features = [u'最大生命',u'生命成长',u'初始生命',u'最大法力', u'法力成长',u'初始法力',u'最高物攻',u'物攻成长',u'初始物攻',u'最大物防',u'物防成长',u'初始物防', u'最大每5秒回血', u'每5秒回血成长', u'初始每5秒回血', u'最大每5秒回蓝', u'每5秒回蓝成长', u'初始每5秒回蓝', u'最大攻速', u'攻击范围'] data = data_ori[features]
对英雄属性之间的关系进行可视化分析
设置plt正确显示中文
plt.rcParams['font.sans-serif']=['SimHei'] #用来正常显示中文标签 plt.rcParams['axes.unicode_minus']=False #用来正常显示负号
用热力图呈现features_mean字段之间的相关性
corr = data[features].corr() plt.figure(figsize=(14,14))
annot=True显示每个方格的数据
sns.heatmap(corr, annot=True) plt.show()
相关性大的属性保留一个,因此可以对属性进行降维
features_remain = [u'最大生命', u'初始生命', u'最大法力', u'最高物攻', u'初始物攻', u'最大物防', u'初始物防', u'最大每5秒回血', u'最大每5秒回蓝', u'初始每5秒回蓝', u'最大攻速', u'攻击范围'] data = data_ori[features_remain] data[u'最大攻速'] = data[u'最大攻速'].apply(lambda x: float(x.strip('%'))/100) data[u'攻击范围']=data[u'攻击范围'].map({'远程':1,'近战':0})
采用Z-Score规范化数据,保证每个特征维度的数据均值为0,方差为1
ss = StandardScaler() data = ss.fit_transform(data)
构造GMM聚类
gmm = GaussianMixture(n_components=30, covariance_type='full') gmm.fit(data)
训练数据
prediction = gmm.predict(data) print(prediction)
将分组结果输出到CSV文件中
data_ori.insert(0, '分组', prediction) data_ori.to_csv('./hero_out.csv', index=False, sep=',')`
关于引用包首先我们会用 DataFrame 数据结构来保存读取的数据,最后的聚类结果会写入到 CSV 文件中,因此会用到 pandas 和 CSV 工具包。另外我们需要对数据进行可视化,采用热力图展现属性之间的相关性,这里会用到 matplotlib.pyplot 和 seaborn 工具包。在数据规范化中我们使用到了 Z-Score 规范化,用到了 StandardScaler 类,最后我们还会用到 sklearn 中的 GaussianMixture 类进行聚类。
数据可视化的探索你能看到我们将 20 个英雄属性之间的关系用热力图呈现了出来,中间的数字代表两个属性之间的关系系数,最大值为 1,代表完全正相关,关系系数越大代表相关性越大。从图中你能看出来“最大生命”“生命成长”和“初始生命”这三个属性的相关性大,我们只需要保留一个属性即可。同理我们也可以对其他相关性大的属性进行筛选,保留一个。你在代码中可以看到,我用 features_remain 数组保留了特征选择的属性,这样就将原本的 20 个属性降维到了 13 个属性。
关于数据规范化我们能看到“最大攻速”这个属性值是百分数,不适合做矩阵运算,因此我们需要将百分数转化为小数。我们也看到“攻击范围”这个字段的取值为远程或者近战,也不适合矩阵运算,我们将取值做个映射,用 1 代表远程,0 代表近战。然后采用 Z-Score 规范化,对特征矩阵进行规范化。
在聚类阶段我们采用了 GMM 高斯混合模型,并将结果输出到 CSV 文件中。这里我将输出的结果截取了一段(设置聚类个数为 30):
第一列代表的是分组(簇),我们能看到张飞、程咬金分到了一组,牛魔、白起是一组,老夫子自己是一组,达摩、典韦是一组。聚类的特点是相同类别之间的属性值相近,不同类别的属性值差异大。因此如果你擅长用典韦这个英雄,不防试试达摩这个英雄。同样你也可以在张飞和程咬金中进行切换。这样就算你的英雄被别人选中了,你依然可以有备选的英雄可以使用。
总结今天我带你一起做了 EM 聚类的实战,具体使用的是 GMM 高斯混合模型。从整个流程中可以看出,我们需要经过数据加载、数据探索、数据可视化、特征选择、GMM 聚类和结果分析等环节。聚类和分类不一样,聚类是无监督的学习方式,也就是我们没有实际的结果可以进行比对,所以聚类的结果评估不像分类准确率一样直观,那么有没有聚类结果的评估方式呢?这里我们可以采用 Calinski-Harabaz 指标,代码如下:
指标分数越高,代表聚类效果越好,也就是相同类中的差异性小,不同类之间的差异性大。当然具体聚类的结果含义,我们需要人工来分析,也就是当这些数据被分成不同的类别之后,具体每个类表代表的含义。另外聚类算法也可以作为其他数据挖掘算法的预处理阶段,这样我们就可以将数据进行降维了。