单细胞靶分子--4

一介白云
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数据分析的原始代码存放在 GitHub 上 https://github.com/TheHumphreysLab/Mouse_DKD_Rx_Atlas。GitHub （github.com/TheHumphrey… 上提供了用于可视化具有复杂组设计的单细胞 RNA-seq 数据的 R 包。 image.png

Figure1

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治疗效果比较

补充图1

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Figure2

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单细胞图谱

补充图2--细胞分群

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Figure3

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根据治疗和遗传力富集对糖尿病肾病的肾脏疾病性状进行DKD疾病基因校正

补充图3--GO分析，占比，人鼠比较（原来做过人的）

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Figure4

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  1. 不同细胞类型的差异表达基因，这样作图也行，我那样作图的话就看不出不同组之间实际的差异有多少了。
  2. 这个基因表达热图我没有，这个可以有
  3. 5C无法理解，为什么这种细胞开始发信号？是因为肾小管是主要的肾脏细胞吗，就像心肌细胞一样？

补充图4

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  1. S4c，S4d在比较不同药物治疗之间的差异的时候蛮不错
  2. 差异分析+细胞互作--all

Figure5

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药物治疗对细胞表型的影响。三个基因代表肾小管的损伤

补充图5

image.png 肾小管损伤--片段的增加--用别人的数据出的图（人的样本），转录因子分析，脂肪酸

Figure6--肾小球样本

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  1. 定位于小鼠肾小球细胞类型的人肾小球DKD基因
  2. 先明确细胞类型再进行评分
  3. ❤❤配受体在细胞类型中的验证-纵坐标是细胞类型，横坐标是分组
  4. 根据细胞的交互作用，找出来和药物治疗相匹配的（趋势一致）的细胞类型，看他们之间的配受体表达--与分组治疗效应一致的。--这里没有做实验验证

补充图6

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Figure7--肾小管--药物作用的靶点位置

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  1. 根据靶向的基因将将近曲小管分为不同的部分，使Slc5a2的表达只存在于S1段
  2. 统计药物引起的差异基因，其中第二大差异基因是SRSF7，敲除基因后进行细胞普通转录组分析，发现敲除SRSF7后可以逆转药物的保护作用（通路分析，基因表达，没有用实验证实），说明这个基因确实是药物作用的靶点。

补充图7

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Effect of SGLT2i on PCT

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