SC|拟时序-monocle轨迹分析与RNA速率

513 阅读1分钟

视频:# 单细胞分析专题第一讲:单细胞分析精炼—拟时序专题

数据降维,需要关注保留两方面的信息

1.各部分的固有特性

2.各部分的相对关系

image.png

image.png

image.png

image.png 虽然剪接转录本是大多数scRNA-seq实验的主要读数,但也检测了未剪接转录本的表达

4adb43c481014aea7050127ad4efa04.jpg

235065f0b12670e54db26c42629fda2.jpg

最小生成树的生物学意义是指将选定细胞内每个基因的表达变化都拼成平滑的变化曲线。基因的表达变化是平滑的

89207003658a8ea8f7a87c963277f8b.jpg

bdf13249214d82be6323df215b18f20.jpg

第一种是选择每个细胞里面高表达基因,第二种是选择高变基因

c14480e360a2cdd88c6c89e5c41afa3.jpg

da40b4b5a419e31249af7c4ca36f137.jpg

这个图里面场向图和点向图标记反了

ddb443242ffbd890cce85384a38849f.jpg