安装SRA-toolkit的linux版本到Ubuntu系统，配置环境变量；输入prefetch -h，将返回的信息截图上传

一、 获取安装包

下面提供两种方法（二选一即可）

1. 通过链接下载

• 进入NCBI官网：National Center for Biotechnology Information (nih.gov)

• 点击Download

• 点击Download Tools

• 找到SRA Toolkit，点击Download

若无法访问此网页，请连接个人网络（如个人热点）后尝试

• 找到Ubuntu Linux 64 bit版本

• 右键复制链接

• 在Linux中输入以下命令

wget -P ~/Biosofts/ https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/3.0.0/sratoolkit.3.0.0-ubuntu64.tar.gz #wget的-P参数，设置下载文件保存的路径是~/Biosofts/

2. 复制共享文件夹里的压缩包

• 在Linux中输入以下命令（复制文件到指定目录可以使用cp命令）

cp /disk1/shares/sratoolkit.2.11.1-ubuntu64.tar.gz ./Biosofts/ #将文件复制到Biosofts文件夹下

二、 解压文件

解压该文件（此文件后缀为tar.gz，可使用tar命令解压）

tar zxvf ~/Biosofts/sratoolkit.2.11.1-ubuntu64.tar.gz -C ~/Biosofts/  #将该文件解压到/Biosofts目录下

注：这里以老师的文件为例，如为自己下载的文件，记得将上述命令中的文件名称改为所下载的文件名称

三、 配置环境变量

• 在Linux中输入以下命令

echo 'export PATH=~/Biosofts/sratoolkit.2.11.1-ubuntu64/bin:$PATH' >>~/.bashrc #修改环境变量
source ~/.bashrc #重新执行环境变量

四、 查看帮助

• 在Linux中输入以下命令

prefetch -h

以上内容仅供参考