作业1-2

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按源代码编译安装的方式安装Hisat2软件

1)软件源码下载地址:ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/infphilo/hisat2/downloads/hisat2-2.1.0-source.zip 2)安装说明:ccb.jhu.edu/software/hi…

源代码安装

一、 下载源代码

下面提供两种下载源代码的方法(二选一即可

1. 通过链接下载

  • 在Linux中输入以下命令
wget ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/infphilo/hisat2/downloads/hisat2-2.1.0-source.zip

image.png

2. 复制共享文件夹里的源代码压缩包

  • 在Linux中输入以下命令(复制文件到指定目录可以使用cp命令)
cp /disk1/shares/hisat2-2.2.0-source.zip ./

image.png

二、 解压文件

  • 在Linux中输入以下命令(解压zip文件可使用unzip命令)
unzip hisat2-2.2.0-source.zip

image.png

三、 进入安装目录

  • 在Linux中输入以下命令
cd hisat2-2.2.0

image.png

四、 编译

  • 使用make命令执行源代码的编译过程(耐心等待,大概七八分钟左右)

image.png

如下图所示即表示安装完成

image.png

可使用下面的命令查看安装的版本

hisat2 -h

image.png 这里显示所安装的版本为2.2.0

以上内容仅供参考