按源代码编译安装的方式安装Hisat2软件
1)软件源码下载地址:ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/infphilo/hisat2/downloads/hisat2-2.1.0-source.zip 2)安装说明:ccb.jhu.edu/software/hi…
源代码安装
一、 下载源代码
下面提供两种下载源代码的方法(二选一即可)
1. 通过链接下载
- 在Linux中输入以下命令
wget ftp://ftp.ccb.jhu.edu/pub/infphilo/hisat2/downloads/hisat2-2.1.0-source.zip
2. 复制共享文件夹里的源代码压缩包
- 在Linux中输入以下命令(复制文件到指定目录可以使用
cp命令)
cp /disk1/shares/hisat2-2.2.0-source.zip ./
二、 解压文件
- 在Linux中输入以下命令(解压zip文件可使用
unzip命令)
unzip hisat2-2.2.0-source.zip
三、 进入安装目录
- 在Linux中输入以下命令
cd hisat2-2.2.0
四、 编译
- 使用
make命令执行源代码的编译过程(耐心等待,大概七八分钟左右)
如下图所示即表示安装完成
可使用下面的命令查看安装的版本
hisat2 -h
这里显示所安装的版本为
2.2.0
以上内容仅供参考