这是我参与「第四届青训营 」笔记创作活动的第 10 天!
行存 vs 列存
数据格式层概述
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计算层:各种计算引擎
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存储层:承载数据的持久化存储
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数据格式层:定义了存储层文件内部的组织格式,计算引擎通过格式层的支持来读写文件(严格意义上不是一个独立的层级,而是运行在计算层的library)
分层视角下的数据形态
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存储层:File,Blocks
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格式层:File 内部的数据布局 (Layout + Schema)
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计算引擎:Rows + Columns
OLTP vs OLAP
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OLTP 和 OLAP 作为数据查询和分析领域两个典型的系统类型,具有不同的业务特征,适配不同的业务场景
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理解两者的区别可以帮助更好的理解行存和列存的设计背景
| OLTP | OLAP | |
|---|---|---|
| 典型场景 | 在线业务系统,例如:订单、交易、社交、评论等 | 数据仓库或者大数据分析系统,例如:决策分析、BI系统、推荐系统等 |
| 访问特征 | - 事务- 实时性- 低延时- 高并发- 高可用 | - 弱事务性- 近实时、离线分析- 大吞吐- 并发相对不高- 可用性可以有一定的妥协 |
| 数据模型特征 | - Schema 相对简单- 数据维度不多- 数据规模较小 | - Schema 复杂- 数据维度很多,几百个Column 很常见- 数据规模巨大 |
行式存储格式 (行存) 与 OLTP
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每一行 (Row) 的数据在文件的数据空间里连续存放的
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读取整行的效率比较高,一次顺序 IO 即可
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在典型的 OLTP 型的分析和存储系统中应用广泛,例如:MySQL、Oracle、RocksDB 等
列式存储格式 (列存) 与 OLAP
- 每一列 (Column) 的数据在文件的数据空间里连续存放的
- 同列的数据类型一致,压缩编码的效率更好
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在典型的 OLAP 型分析和存储系统中广泛应用,例如:
1.大数据分析系统:Hive、Spark,数据湖分析
2.数据仓库:ClickHouse,Greenplum,阿里云 MaxCompute
总结
1.格式层定义了数据的布局,连接计算引擎和存储服务
2.OLTP和OLAP场景话差异明显
3.业务场景决定了技术实现,行存适用于OLTP,列存适用于OLAP
Parquet 详解
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Dremel 数据格式的社区实现
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大数据分析领域使用最广的列存格式
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Spark 推荐存储格式
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Github
- paretvormat :格式定义
- parquet-mr: Java实现
使用 Parquet
# Spark
df.write.parquet("/path/to/file.parquet")
df.write
.partitionBy(”col1")
.format("parquet")
.saveAsTable(”sometable")
val df = spark.read.parquet(”/path/to/file.parquet")
# Hive DDL
CREATE TABLE table_name (x INT, y STRING) STORED AS PARQUET;
Dremel数据模型
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Protocol Buffer 定义
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支持可选和重复字段
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支持嵌套类型
Dremel数据模型一Continued
- 构建出如下的语法树
嵌套类型只保存叶子节点数据
数据布局
- RowGroup: 每一个行组包含一定数量或者固定大小的行的集合,在 HDFS 上,RowGroup 大小建议配置成 HDFS Block 大小
- ColumnChunk: RowGroup 中按照列切分成多个 ColumnChunk
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Page:ColumnChunk内部继续切分成 Page,一般建议 8KB 大小。Page 是压缩和编码的基本单元
- 根据保存的数据类型,Page 可以分为:Data Page,Dictionary Page,Index Page
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Footer 保存文件的元信息
- Schema
- Config
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Metadata
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RowGroup Meta
- Column Meta
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编码Encoding
▪️ Plain直接存储原始数据
▪️ Run Length Encoding (RLE):适用于列基数不大,重复值较多的场景,例如: Boolean、 枚举、固定的选项等
1)Bit- Pack Encoding:配合RLE编码使用,让整形数字存储的更加紧凑
▪️ 字典编码Dictionary Encoding:适用于列基数不大的场景,构造字典表,写入到Dictionary Page;把数据用字典Index替换,然后用RLE编码
编码 Encoding
1)默认场景下parquet-mr会自动根据数据特征选择
2)业务自定义:
org.apache.parquet.column.values.factory.ValuesWriterFactory
2.5 压缩Compression
● Page完成Encoding以后,进行压缩
● 支持多种压缩算法
● snappy:压缩速度快,压缩比不高,适用于热数据
● gzip:压缩速度慢,压缩比高,适用于冷数据
● zstd:新引入的压缩算法,压缩比和gzip差不多,而且压缩速度比肩Snappy
● 建议选择snappy或者zstd,根据业务数据类型充分测试压缩效果,以及对查询性能的影响
2.5.1 压缩 Compression - 对比
2.6 索引Index
▪️ 和传统的数据库相比,索引支持非常简陋
▪️ Min-Max Index:记录Page内部Column的min_ value 和max_ value
▪️ Column Index:
1)Footer里的Column Metadata包含ColumnChunk的全部Page的Min-Max Value
▪️ Offset Index: 记录Page在文件中的Offset和Page的Row Range
2.6.1 索引Index - Bloom Filter
1)parquet.bloom.filter. enabled
2)对于列基数比较大的场景,或者非排序列的过滤,Min-Max Index很难发挥作用
3)引入Bloom Filter 加速过滤匹配判定
4)每个ColumnChunk的头部保存Bloom Filter 数据
5)Footer记录Bloom Filter的page offset
2.6.2 排序Ordering
1)类似于聚集索引的概念
2)排序帮助更好的过滤掉无关的RowGroup或者Page
(1)对于少量数据Seek很有帮助
3)Parquet Format支持SortingColumns
4)Parquet Library目前没有支持
5)依赖业务侧根据查询特征去保证顺序
2.7 过滤下推Predicate PushDown
1)parquet-mr库实现,实现高效的过滤机制
2)引擎侧传入 Filter Expression
3)parquet-mr转换成具体Column的条件匹配
4)查询Footer里的Column Index,定位到具体的行号
5)返回有效的数据给引擎侧
Spark 3.2.0 x1
issues.apache.org/jira/browse… 26345
https://issues apache.org/jira/browse/PARQUET-1201
2.8 Spark集成 - 向量化读
▪️ ParquetFileFormat类
▪️ 向量化读开关:spark.sql.parquet.enableVectorizedReader
▪️ 向量化读是主流大数据分析引擎的标准实践,可以极大的提升查询性能
▪️ Spark以Batch的方式从Parquet读取数据,下推的逻辑也会适配Batch的方式
2.9 深入Dremel数据模型- Repetition Level
▪️ Repetition L evel:该字段在Field Path上第几个重复字段上出现
1)0:标识新的Record
2)Name.L .anguage.Code为例,Name是第1个重复字段,Language是第2 个重复字段
2.9.1 深入Dremel数据模型一Definition Level
● Definition L evel:用来记录在field path中,有多少个字段是可以不存在 (optional/repeated)而实际出现的
● Name.Language.Code为例,Name和Language都是可以不存在的
● 第一个NULL字段,D是1说明Name是存在的,但是Language是不存在的,保留原有的信息
2.9.2 深入Dremel数据模型- Re-Assembly
● 根据全部或者部分列数据,重新构造Record
● 构造FSM状态机
● 根据同一个Column下一个记录的RepetionLevel决定继续读的列
2.10 Parquet小结
1)数据模型:基于Dremel
2)文件布局: Footer + RowGroup + ColumnChunk + Page
3)Encoding: Page粒度,Plain / RLE / Dictionary
4)Compression: Snappy / Gzip / Zstd
5)Index: Column Index ( Min-Max Index )
6)Predicate PushDown
ORC 详解
- 产生于 Hive 项目
- 大数据分析领域使用最广的列存格式之一
数据模型
- ORC 会给包括根节点在内的中间节点都创建一个 Column
- 下图中,会创建 8 个 Column
- 嵌套类型或者集合类型支持和 Parquet 差别较大
- optional 和 repeated 字段依赖父节点记录额外信息来重新 Assembly 数据
图片来源: orc.apache.org
数据布局
- 类似 Parquet
- Rooter + Stripe + Column + Page (Row Group) 结构
- Encoding / Compression / Index 支持上和 Parquet 几乎一致
图片来源: orc.apache.org
ACID 特性
- 支持 Hive Transactions 实现,目前只有 Hive 本身集成
- 类似 Delta Lake / Hudi / Iceberg
- 基于 Base + Delta + Compaction 的设计
AliORC
- ORC 在阿里云计算平台被广泛应用,主流产品 MaxCompute + 交互式分析 Hologres 的最新版本都支持 ORC 格式
- AliORC 是对 ORC 的深度定制版
索引增强
- 支持 Clusterd Index,更快的主键查找
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支持 Bitmap Index,更快的过滤
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Roaring Bitmap
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更高效的压缩保存 Bitmap Index
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以 16 bit 的 bitmap 空间为一个保存单元,每个单元可以是以下三种形式之一:
- Array Container:只保存为 1 的 Index
- Run Container:类似 RLE 编码
- Bitset container:原始 bitmap 存储
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图片来源: Roaring Bitmaps: Implementation of an Optimized Software Library
其他优化
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小列聚合,减少小 IO
- 重排 ColumnChunk
图片来源:www.alibabacloud.com/blog/aliorc…
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异步预取优化
- 在计算引擎处理已经读到的数据的时候,异步去预取下一批次数据
图片来源:www.alibabacloud.com/blog/aliorc…
Parquet vs ORC 对比
- 从原理层面,最大的差别就是对于 NestedType 和复杂类型处理上
- Parquet 的算法上要复杂很多,带来的 CPU 的开销比 ORC 要略大
- ORC 的算法上相对加单,但是要读取更多的数据
- 因此,这个差异的对业务效果的影响,很难做一个定性的判定,更多的时候还是要取决于实际的业务场景
性能对比 1
- Parquet 在复杂 Schema 场景下的算法开销影响较大
- 测试平台 Hive,Hive 上 ORC 更有优势
- 2016年
简单 Schema 复杂 Schema
来源:www.slideshare.net/HadoopSummi…
性能对比 2
- 在 Spark 场景下 Parquet 工作的更好;在 Hive 场景下,ORC 更好
来源:onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10…
如何选择
- 当前项目使用的??
- 性能上很多情况下依赖于数据集和测试环境,不能迷信 Benchmark 结果
- 根据实际业务做细粒度的调优
- Spark 生态下 Parquet 比较普遍
- Hive 生态下 ORC 有原生支持
- 整体上,Spark 比 Hive 更加有优势,所以大部分情况下,Parquet 可能是个更好的选择
问题:在 Nested Type 的处理上,Parquet 和 ORC 实现机制的不同对于最终性能有什么影响?
列存演进
数仓中的列存
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典型的数仓,例如 ClickHouse 的 MergeTree 引擎也是基于列存构建的
- 默认情况下列按照 Column 拆分成单独的文件,也支持单个文件形式
图片来源:www.jianshu.com/p/4a86a4f5b…
- 支持更加丰富的索引,例如 Bitmap Index、Reverted Index、Data Skipping Index、Secondary Index 等
- 湖仓一体的大趋势下,数仓和大数据数据湖技术和场景下趋于融合,大数据场景下的格式层会借鉴更多的数仓中的技术
存储侧下推
- 更多的下推工作下沉到存储服务侧
- 越接近数据,下推过滤的效率越高
- 例如 AWS S3 Select 功能
图片来源: aws.amazon.com/blogs/aws/s…
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挑战:
- 存储侧感知 Schema
- 计算生态的兼容和集成
Column Family 支持
- 背景:Hudi 数据湖场景下,支持部分列的快速更新
- 在 Parquet 格式里引入 Column Family 概念,把需要更新的列拆成独立的 Column Family
- 深度改造 Hudi 的 Update 和 Query 逻辑,根据 Column Family 选择覆盖对应的 Column Family
- Update 操作实际效果有 10+ 倍的提升
课后
- 实操 TPCH 数据集,Parquet 和 ORC 两种格式的数据导入和Query
- 阅读 Dremel 论文,理解 Column 编码和重新装配细节
第二节:实操课-简易列式存储
前置克隆项目地址: github.com/theMYang/da… ,开课前1天完成项目运行,有问题可以记录一下,直播课跟着讲师节奏走,或者积极在弹幕区提问哈。
背景知识
行存 VS 列存
| 行存 | 列存 |
|---|---|
| 按行写入数据,读取数据时需要读取不必要的列 | 可以只读取请求的列 |
| 适用于OLTP系统 | 适用于OLAP系统 |
| 适用于按记录读取数据 | 适用于按列读取数据 |
| 不利于大数据集聚合统计操作 | 利于大数据集聚合统计操作 |
| 不利于数据压缩 | 利于数据压缩 |
Parquet 数据布局
项目目标
- 理解列存数据排布
- 代码设计 - 了解主要实现类的行为和功能
- 代码实现 - 以列存格式写入数据并正确读出
- 优化现有代码
项目设计
写入过程
示例表结构
| a_field (int) | b_field (long) |
|---|---|
| a1 | b1 |
| a2 | b2 |
| ... | ... |
| a100 | b100 |
写入流程
- 将一行行数据的字段拆分,分别存储在各字段对应的ChunkWriter中
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当写入的数据达到一个块的长度,或是数据已经写完,此时会持久化数据,以及生成块的元数据
- 持久化数据至输出流中
- 生成元数据,包括每个字段的元信息以及该块已写数据量
- 当整个文件写完,将文件元信息写至输出流,并在文件最后记录元数据占用字节数。
最终文件组织示例
文件
读取流程
- 读取元数据
- 根据元数据,获取每个block中各个列信息
- 根据请求列,读取对应列数据
- 将读取到的数据拼成Record返回
代码流程图
写入流程
读取流程
项目仓库
代码结果
代码仓库: github.com/theMYang/da… 利用cloc工具进行代码统计:
编译
mvn clean install -DskipTests
复制代码
代码优化
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支持复杂类型读写
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增加列基本统计值,增加filter过滤不需要读取的数据
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支持数据压缩、编码
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预读取优化
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拆列优化
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对接Spark或Hive等计算引擎