Parquet 和 ORC:高性能列式存储| 青训营笔记

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Parquet 和 ORC:高性能列式存储| 青训营笔记

这是我参与「第四届青训营 」笔记创作活动的的第13天

行存 vs 列存

行存列存
按行写入数据,读取数据时需要读取不必要的列可以只读取请求的列
适用于OLTP系统适用于OLAP系统
适用于按记录读取数据适用于按列读取数据
不利于大数据集聚合统计操作利于大数据集聚合统计操作
不利于数据压缩利于数据压缩

数据格式层概述

  • 计算层: 各种计算引擎
  • 存储层: 承载数据的持久化存储
  • 数据格式层:定义了存储层文件内部的组织格式,计算引擎通过格式层的支持来读写文件。严格意义上,并不是一个独立的层级,而是运行在计算层的一个Library。

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分层视角下的数据形态

  • 存储层:File,Blocks

  • 格式层:File 内部的数据布局 (Layout + Schema)

  • 计算引擎:Rows + Columns

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OLTP vs OLAP

  • OLTP 和 OLAP 作为数据查询和分析领域两个典型的系统类型,具有不同的业务特征,适配不同的业务场景

  • 理解两者的区别可以帮助更好的理解行存和列存的设计背景

OLTPOLAP
典型场景在线业务系统,例如:订单、交易、社交、评论等数据仓库或者大数据分析系统,例如:决策分析、BI系统、推荐系统等
访问特征事务
实时性
低延时
高并发
高可用
弱事务性
近实时、离线分析
大吞吐- 并发相对不高
可用性可以有一定的妥协
数据模型特征Schema 相对简单
数据维度不多- 数据规模较小
Schema 复杂
数据维度很多,几百个Column 很常见
数据规模巨大

行式存储格式 (行存) 与 OLTP

  • 每一行 (Row) 的数据在文件的数据空间里连续存放的

  • 读取整行的效率比较高,一次顺序 IO 即可

  • 在典型的 OLTP 型的分析和存储系统中应用广泛

    • 例如:MySQL、Oracle、RocksDB 等
    • Key-Value 数据库

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列式存储格式 (列存) 与 OLAP

  • 每一列 (Column) 的数据在文件的数据空间里连续存放的

  • 读取整列的效率较高

  • 同列的数据类型一致,压缩编码的效率更好

  • 在典型的 OLAP 型分析和存储系统中广泛应用,例如:

    • 大数据分析系统:Hive、Spark,数据湖分析
    • 数据仓库:ClickHouse,Greenplum,阿里云 MaxCompute

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总结

  • 格式层定义了数据的布局,连接计算引擎和存储服务
  • OLTP和OLAP场景话差异明显
  • 业务场景决定了技术实现,行存适用于 OLTP,列存适用于 OLAP

Parquet 原理详解

Parquet官方

Parquet 使用

DDL

Hive Table using Parquet

CREATE TABLE lineitem (
    l_orderkey int,
    l_partkey int,
    ...
)
STORED AS PARQUET TBLPROPERTIES ("parquet.compression"="SNAPPY");

Spark

df.write.parquet("/path/to/file.parquet")
df.write
  .partitionBy(”col1")
  .format("parquet")
  .saveAsTable(”sometable")
val df = spark.read.parquet(”/path/to/file.parquet")
  • Spark 生成的文件会有 .parquet 后缀
  • Hive 生成的文件没有后缀

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Parquet 与 Text 格式文件大小对比

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Tex t格式存储的容量是 Parquet 格式存储的两倍之多

parquet-cli 工具查看 parquet 文件的具体信息

parquet-mr 包含 CLI 工具: parquet-cli

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Dremel 数据模型

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  • Protocol Buffer 定义

  • 支持可选和重复字段

  • 支持嵌套类型

Continued

  • 只有叶子节点的数据会被保存在数据文件里

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数据文件布局

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  • RowGroup: 每一个行组包含一定数量或者固定大小的行的集合,在 HDFS 上,RowGroup 大小建议配置成 HDFS Block 大小

  • ColumnChunk: RowGroup 中按照列切分成多个 ColumnChunk

  • Page:ColumnChunk内部继续切分成 Page,一般建议 8KB 大小。Page 是压缩和编码的基本单元

    • 根据保存的数据类型,Page 可以分为:Data Page,Dictionary Page,Index Page
  • Footer 保存文件的元信息

    • Schema

    • Config

    • Metadata

      • RowGroup Meta
        • Column Meta

编码 Encoding

  • Plain直接存储原始数据

  • Run Length Encoding (RLE): 适用于列基数不大,重复值较多的场景,例如:Boolean、枚举、固定的选项等

    • Bit-Pack Encoding:配合RLE编码使用,让整形数字存储的更加紧凑,对于 32位或者64位的整型数而言,并不需要完整的 4B 或者 8B 去存储,高位的零在存储时可以省略掉。适用于最大值非常明确的情况下。

    • RLE编码过程如下图所示:

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  • 字典编码Dictionary Encoding: 适用于列基数不大的场景,构造字典表,写入到Dictionary Page;把数据用字典Index 替换,替换后的数据可以使用 RLE + Bit-Pack 编码存储

    • Dictionary Encoding 过程

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  • 默认场景下parquet-mr 会自动根据数据特征选择

  • 业务自定义: org.apache.parquet.column.values.factory.ValuesWriterFact

压缩 Compression

  • Page 完成 Encoding 以后,进行压缩

  • 支持多种压缩算法 image-20220815023116579.png

    • snappy: 压缩速度快,压缩比不高,适用于热数据
    • gzip:压缩速度慢,压缩比高,适用于冷数据
    • zstd:新引入的压缩算法,压缩比和 gzip 差不多,而且压缩速度略低于 Snappy
    • 建议选择 snappy 或者 zstd,根据业务数据类型充分测试压缩效果,以及对查询性能的影响

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索引 Index

  • 和传统的数据库相比,Parquet索引支持非常简陋
  • Min-Max Index:记录 Page 内部 Column的 min_value和 max_value
  • Column Index: Footer 里的 Column Metadata 包含ColumnChunk 的全部 Page的Min-MaxValu
  • Offset Index:记录 Page在文件中的Offset和Page的RowRange

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布隆过滤器 Bloom Filter

  • parquet.bloom.filter.enabled

  • 对于列基数比较大的场景,或者非排序列的过滤,Min-Max Index 很难发挥作用

  • 引入 Bloom Filter 加速过滤匹配判定

  • 每个 ColumnChunk 的头部保存 Bloom Filter 数据

  • Footer 记录 Bloom Filter 的 page offset

布隆过滤器

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排序 Ordering

  • 类似于聚集索引的概念
  • 排序帮助更好的过滤掉无关的 RowGroup 或者 Page
    • 对于少量数据Seek 很有帮助
  • Parquet Format支持SortingColumns
  • Parquet Library 目前没有支持
  • 依赖业务侧根据查询特征去保证顺序

过滤下推 Predicate PushDown

  • parquet-mr 库实现,实现高效的过滤机制

  • 引擎侧传入 Filter Expression

  • parquet-mr 转换成具体 Column 的条件匹配

  • 查询 Footer 里的 Column Index,定位到具体的行号

  • 返回有效的数据给引擎侧

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Spark 集成 - 向量化读

  • 作为最通用的 Spark 数据格式

  • 主要实现在:ParquetFileFormat

  • 支持向量化读:spark.sql.parquet.enableVectorizedReader

  • 向量化读是主流大数据分析引擎的标准实践,可以极大的提升查询性能

  • Spark 以 Batch 的方式从 Parquet 读取数据,下推的逻辑也会适配 Batch 的方式

深入Dremel 数据模型

Repetition Level

  • Repetition Level: 该字段在Field Path 上第几个重复字段上出现
    • 0:标识新的Record
    • Name.Language.Code 为例,Name是第1个重复字段,Language 是第 2 个重复字段

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Definition Level

  • Definition Level: 用来记录在fieldpath中,有多少个字段是可以不存在(optional/repeated)而实际出现的
  • Name.Language.Code 为例, Name和Language 都是可以不存在的
  • 第一个 NULL字段,D是1,说明Name是存在的,但是Language是不存在的,保留原有的信息

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Re-Assembly

  • 根据全部或者部分列数据,重新构造Record
  • 构造FSM状态机
  • 根据同一个 Column 下 一 个记录的 RepetionLevel决定继续读的列

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总结

  • 数据模型:基于 Dremel
  • 文件布局: Footer + RowGroup + ColumnChunk + Page
  • Encoding:Page粒度,Plain / RLE / Dictionary
  • Compression: Snappy / Gzip / Zstd
  • Index: Column Index (Min-Max Index)
  • Predicate PushDown

ORC

orc官网

  • 产生于 Hive 项目

  • 大数据分析领域使用最广的列存格式之一

数据模型

  • ORC 会给包括根节点在内的中间节点都创建一个 Column

    • 下图中,会创建 8 个 Column
  • 嵌套类型或者集合类型支持和 Parquet 差别较大

  • optional 和 repeated 字段依赖父节点记录额外信息来重新 Assembly 数据

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数据布局

  • 类似 Parquet

  • Rooter + Stripe + Column + Page (Row Group) 结构

  • Encoding / Compression / Index 支持上和 Parquet 几乎一致

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ACID 特性

  • 支持 Hive Transactions 实现,目前只有 Hive 本身集成

  • 类似 Delta Lake / Hudi / Iceberg

  • 基于 Base + Delta + Compaction 的设计

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AliORC

  • ORC 在阿里云计算平台被广泛应用,主流产品 MaxCompute + 交互式分析 Hologres 的最新版本都支持 ORC 格式

  • AliORC 是对 ORC 的深度定制版

索引增强

  • 支持 Clusterd Index,更快的主键查找

  • 支持 Bitmap Index,更快的过滤

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    • Roaring Bitmap
      • 更高效的压缩保存 Bitmap Index
      • 以 16 bit 的 bitmap 空间为一个保存单元,每个单元可以是以下三种形式之一:
        • Array Container:只保存为 1 的 Index
        • Run Container:类似 RLE 编码
        • Bitset container:原始 bitmap 存储

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小列聚合

  • 小列聚合,减少小 IO
    • 重排 ColumnChunk

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异步预取

  • 异步预取优化
    • 在计算引擎处理已经读到的数据的时候,异步去预取下一批次数据

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Parquet vs ORC 对比

  • 从原理层面,最大的差别就是对于 NestedType和复杂类型处理上
  • Parquet的算法上要复杂很多,带来的CPU的开销比 ORC 要略大
  • ORC 的算法上相对简单,但是要读取更多的数据
  • 因此,这个差异的对业务效果的影响,很难做一个定性的判定,更多的时候还是要取决于实际的业务场景

性能

  • Parquet 在复杂 Schema 场景下的算法开销影响较大

  • 测试平台 Hive,Hive 上 ORC 更有优势 时间:2016

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  • 在 Spark 场景下 Parquet 工作的更好;在 Hive 场景下,ORC 更好 时间:2020

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如何选择

  • 当前项目使用的??

  • 性能上很多情况下依赖于数据集和测试环境,不能迷信 Benchmark 结果

  • 根据实际业务做细粒度的调优

  • Spark 生态下 Parquet 比较普遍

  • Hive 生态下 ORC 有原生支持

  • 整体上,Spark 比 Hive 更加有优势,所以大部分情况下,Parquet 可能是个更好的选择

列存演进

数仓中的列存

  • 典型的数仓,例如 ClickHouse 的 MergeTree 引擎也是基于列存构建的 image-20220815033628486.png
    • 默认情况下列按照 Column 拆分成单独的文件,也支持单个文件形式
  • 支持更加丰富的索引,例如 Bitmap Index、Reverted Index、Data Skipping Index、Secondary Index 等
  • 湖仓一体的大趋势下,数仓和大数据数据湖技术和场景下趋于融合,大数据场景下的格式层会借鉴更多的数仓中的技术

存储侧下推

  • 更多的下推工作下沉到存储服务侧

  • 越接近数据,下推过滤的效率越高

  • 例如 AWS S3 Select 功能

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  • 挑战:
    • 存储侧感知 Schema
    • 计算生态的兼容和集成

Column Family 支持

  • 背景:Hudi 数据湖场景下,支持部分列的快速更新

  • 在 Parquet 格式里引入 Column Family 概念,把需要更新的列拆成独立的 Column Family

  • 深度改造 Hudi 的 Update 和 Query 逻辑,根据 Column Family 选择覆盖对应的 Column Family

  • Update 操作实际效果有 10+ 倍的提升

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