这是我参与「第四届青训营」笔记创作活动的第6天
本节课程目录:
- Shuffle 概述
- Shuffle 算子
- Shuffle 过程
- Push Shuffle
1. Shuffle 概述
1.1 MapReduce 概述
- 2004年谷歌发布了《MapReduce:Simplified Data Processing on Large Clusters》论文
- 在开源实现的 MapReduce 中,存在 Map、Shuffle、Reduce 三个阶段
1.1.1 Map 阶段
是在单机上进行的针对一小块数据的计算过程
1.1.2 Shuffle 阶段
在 map 阶段的基础上,进行数据移动,为后续的 reduce 阶段做准备
1.1.3 Reduce 阶段
对移动后的数据进行处理,依然是在单机上处理一小份数据
1.4 为什么 Shuffle 对性能非常重要
- M * R 次网络连接
- 大量的数据移动
- 数据有丢失风险
- 可能存在大量的排序操作
- 大量的数据序列化、反序列化操作
- 数据压缩
2. Shuffle 算子
2.1 Shuffle 算子分类
- repartition 重新改变分区
- ByKey 把指定 Key - Value 对聚合到一起进行计算
- join 按照某种条件把数据放到一起进行计算
- Distinct 特殊的 ByKey 操作
2.2 Spark 中对 shuffle 的抽象 - 宽依赖、窄依赖
- 窄依赖:父 RDD 中的每个分片至多被子 RDD 中的一个分片所依赖
- 宽依赖:父 RDD 中的每个分片可能被子 RDD 中的多个分片所依赖
- ShuffleDependency
- CoGroupedRDD
- Cogroup
- fullOuterJoin、rightOuterJoin、left OuterJoin
- join
- Cogroup
- ShuffledRDD
- combineByKeyWithClassTag
- combineByKey
- reduceByKey
- Coalesce
- sortByKey
- sortBy
- combineByKeyWithClassTag
- CoGroupedRDD
2.2.1 Shuffle Dependency 构造
- A single key - value pair RDD 一个kv对形式的 RDD
- Partitioner 给定 Key 所对应的分区
- Serializer 把对象映射成二进制的数据流或把二进制的数据映射成对象
- Optional Key ordering 排序 Key
- Optional Aggregator 详见下
- mapSideCombine flag which is disabled by default
Partitioner(用来将 record 映射到具体的partition的方法)
- 两个接口
- numberPartitions
- getPartition
- 经典实现
- HashPartitioner
- HashPartitioner
Aggregator(在 map 阶段合并部分 record 的函数)
- createCombiner:只有一个 value 的时候初始化的方法
- mergeValue:合并一个 value 到 Aggregator 中
- mergeCombiners:合并两个 Aggregator
3. Shuffle 过程
- Shuffle 实现的发展历程
- Spark 0.8 及以前 Hash Based Shuffle
- Spark 0.8.1 为 Hash Based Shuffle 引入 File Consolidation 机制
- Spark 0.9 引入 ExternalAppendOnlyMap
- Spark 1.1 引入 Sort Based Shuffle,但默认仍为 Hash Based Shuffle
- Spark 1.2 默认的 Shuffle 方式改为 Sort Based Shuffle
- Spark 1.4 引入 Tungsten - Sort Based Shuffle
- Spark 1.6 Tungsten - Sort Based Shuffle 并入 Sort Based Shuffle
- Spark 2.0 Hash Based Shuffle 退出历史舞台
3.1 Hash Shuffle - 写数据
- 不需要排序
- 每个 partition 会映射到一个独立的文件。
- 随着作业的规模增大,打开创建的文件数量会非常多,严重消耗资源。
- 优化后,每个 partition 会映射到一个文件片段。
- 实际上打开的文件数量与优化前相同。
3.2 Sort Shuffle - 写数据
- 需要排序
- 每个 task 生成一个包含所有 partition 数据的文件。
3.3 Shuffle - 读数据
每个 reduce task 分别获取所有 map task 生成的属于自己的片段
3.4 Shuffle 过程的触发流程
graph TD
Collect-Action --> SubmitJob
--> GetDependencies
--> RegisterShuffle
3.5 Shuffle Handle 的创建
最重要的事情是根据不同条件创建不同的 shuffle Handle
3.6 Shuffle Handle 与 Shuffle Writer 的对应关系
3.7 Writer 实现
BypassMergeShuffleWriter
- 不需要排序,节省时间
- 写操作的时候会打开大量文件
- 类似于 Hash Shuffle
UnsafeShuffleWriter
- 使用类似内存页储存序列化数据
- 数据写入后不再反序列化
- 只根据 partition 排序 Long Array
- 数据不移动
SortShuffleWriter
- 支持 combine
- 需要 combine 时,使用 PartitionedAppendOnlyMap,本质是个 HashTable
- 不需要 combine 时,使用PartitionedPairBuffer,本质是个 array
3.8 Reader 实现
网络时序图
- 使用基于 netty 的网络通信框架
- 位置信息记录在 MapOutputTracker 中
- 主要会发送两种类型的请求
- OpenBlocks 请求
- Chunk 请求或 Stream 请求
ShuffleBlockFetchIterator
- 区分 local 和 remote 节省网络消耗
- 防止 OOM
- maxBytesInFlight
- maxReqsInFlight
- maxBlocksInFlightPerAddress
- maxReqSizeShuffleToMem
- maxAttemptsOnNettyOOM
External Shuffle Service
ESS 作为一个存在于每个节点上的 agent 为所有 Shuffle Reader 提供服务,从而优化了 Spark 作业的资源利用率,MapTask 在运行结束后可以正常退出
3.9 Shuffle 优化使用的技术
Zero Copy
-
不使用 zero copy
-
使用 sendfile
-
使用 sendfile + DMA gather copy
Netty Zero Copy
- 可堆外内存,避免 JVM 堆内存到堆外内存的数据拷贝
- compositeByteBuf、Unpooled.wrappedBuffer、ByteBuf.slice,可以合并、包装、切分数组,避免发生内存拷贝
- Netty 使用 FileRegion 实现文件传输,FileRegion 底层封装了 FileChannel#transferTo() 方法,可以将文件缓冲区的数据直接传输到目标 Channel,避免内核缓冲区和用户态缓冲区之间的数据拷贝
3.10 常见问题
- 数据存储在本地磁盘,没有备份
- IO 并发:大量 RPC 请求(M*R)
- IO 吞吐:随机读、写放大(3X)
- GC 频繁,影响 NodeManager
3.11 Shuffle 优化
- 避免 shuffle
- 使用 broadcost 替代 join
- 使用可以 map-side 预聚合的算子
- 使用 broadcost 替代 join
3.12 Shuffle 参数优化
- spark.default.parallelism && spark.sql.shuffle.partitions
- spark.hadoopRDD.ignoreEmptySplits
- spark.hadoop.mapreduce.input.fileinputformat.split.minsize
- spark.sql.file.maxPartitionBytes
- spark.sql.adaptive.enabled && spark.sql.adaptive.shuffle.targetPostShuffleInputSize
- spark.reducer.maxSizeInFlight
- spark.reducer.maxReqsInFlight
- spark.reducer.maxBlocksInFlightPerAddress
3.13 Shuffle 倾斜优化
-
倾斜影响
- 作业运行时间变长
- Task OOM 导致作业失败
-
解决办法
- 提高并行度
- 优点:足够简单
- 缺点:只缓解,不根治
- 提高并行度
-
Spark AQE Skew Join
AQE 根据 shuffle 文件统计数据自动检测倾斜数据,将那些倾斜的分区打散成小的子分区,然后各自进行 join
3.14 案例 - 参数优化
- ad_show
- number of files read:840,042
- number of total tasker:5,553
- size of files read:203.3 TB
- number of output rows:128,676,054,598
3.15 参数调整
- spark.sql.adaptive.shuffle.targetPostShuffleInputSize: 64M -> 512M
- spark.sql.files.maxPartitionBytes: 1G -> 40G
- 通过参数调整增大了 Chunk Size,减小了 Shuffle 过程中IOPS,避免了长时间的 Blocked Time
- 在增大 Map Task 的数据处理量后,由于该算子在 Map Side Aggregation,反而减少了整体的 Shuffle 数据量
4. Push Shuffle
4.1 为什么需要 Push Shuffle
- Avg IO size 太小,造成了大量的随机 IO,严重影响磁盘的吞吐
- M * R 次读请求,造成大量的网络连接,影响稳定性
4.2 Push Shuffle 的实现
- Facebook: cosco
- LinkedIn:magnet
- Uber:Zeus
- Alibaba: RSS
- Tencent: FireStorm
- Bytedance: Cloud Shuffle Service
- Spark3.2: push based shuffle
4.3 Magnet 实现原理
- Spark driver 组件用来协调整体的 shuffle 操作
- Map task 的 shuffle writer 过程完成后,增加了一个额外的操作 push - merge,将数据复制一份推到远程 shuffle 服务上
- magnet shuffle service 是一个 ESS 的 plus版。将隶属于同一个 shuffle partition 的 block,会在远程传输到 magent 后被 merge 到一个文件中
- reduce 任务从 magnet shuffle service 接收合并好的 shuffle 数据
- bitmap:存储已 merge 的 mapper id,防止重复 merge
- position offset:如果本次 block 没有正常 merge,可以恢复到上一个 block 的位置
- currentMapId:标识当前正在 append 的 block,保证不同 mapper 的 block 能依次 append
4.4 Magnet 可靠性
- 如果 Map task 输出的 block 没有成功 Push 到 magnet 上,并且反复重试仍然失败,则 reduce task 直接从 ESS 上拉取原始数据
- 如果 magnet 上的 block 因为重复或者冲突等,没有正常完成 merge 的过程,则 reduce task 直接拉取未完成 merge 的 block
- 如果 reduce 拉取已经 merge 好的 block 失败,则会直接拉取 merge 前的 原始 block
- 本质上,magnet 中维护了两份 shuffle 数据的副本
4.5 Cloud Shuffle Service 思想
4.6 Cloud Shuffle Service 架构
- Zookeeper WorkerList [服务发现]
- CSS Worker [Partitions / Disk | Hdfs]
- Spark Driver [集成启动 CSS Master]
- CSS Master [Shuffle 规划 / 统计]
- CSS ShuffleClient [Write / Read]
- Spark Executor [Mapper + Reducer]
4.6.1 Cloud Shuffle Service 写入流程(图左)
4.6.2 Cloud Shuffle Service 读取流程(图右)
4.6.3 Cloud Shuffle Service AQE
一个 Partition 会最终对应到多个 Epoch file,每个 Epoch 目前设置是 512 MB
- 在聚合文件时主动将文件切分为若干块,当触发AQE时,按照已经切分好的文件块进行拆分