医疗影像研究现状(数据集汇总)

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**(仅做个人备忘录) **

1、胰腺分割(数据集和研究相对比较多)

MICCAI胰腺分割数据集

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281个训练病例,139个测试病例,同时分割胰腺和肿瘤,测试集label是hidden的

胰腺分割数据集

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包含82个病例的胰腺数据集(4.86G)

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2、结肠癌CT数据

CT扫描诊断结肠癌。 包括没有息肉,6-9mm息肉和大于10mm息肉的患者的数据。 该系列中有825例带有XLS片的病例,提供了息肉描述及其在结肠段中的位置。

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3、眼部

用于视网膜提取的数字视网膜图像(数据少)

用于视网膜图像中血管分割的比较研究,它由40张照片组成,其中7张显示出轻度早期糖尿病性视网膜病变的迹象。

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目前最大的OCTA图像数据集OCTA-500(比较全)

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该数据集包含500只眼睛的OCT和OCTA两种模态的三维体数据、六种投影图像、四种文本标签(年龄、性别、左右眼、疾病类型)以及两种分割标签(视网膜大血管、无血管区),数据库总大小约80GB。

提出了一个新的多模态数据集,称为OCTA-500。它包含500个主题,具有两种视场(FOV)类型,包括OCT和OCTA卷,六种类型的投影,四种类型的文本标签和两种类型的像素级标签。数据集包含超过360K图像,大小约为80GB。据我们所知,它是目前最大的OCTA数据集,具有丰富的信息。

OCTA-500数据集内容汇总及组织结构

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两种视野范围的OCT三维数据和OCTA三维数据

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4、心脏类(同心脑血管疾病)

AMRG Cardiac Atlas(心脏MRI图像)

奥克兰MRI研究小组的Siemens Avanto扫描仪采集的正常患者心脏的完整带标签MRI图像集。

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先天性心脏病(CHD)图集

先天性心脏病(CHD)图集代表来自患有各种先天性心脏病的成年人和儿童的MRI数据集,生理临床数据和计算机模型。

森尼布鲁克心脏数据

Sunnybrook心脏数据(SCD)也称为2009心脏MR左心室分割挑战数据,由来自以下患者和病理混合的45幅cine-MRI图像组成:健康,肥大,伴有梗塞和心脏的心力衰竭。

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5、脑部类(脑部现有研究较多)

大脑MRI数据集

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OASIS影像研究开放获取系列(OASIS)是一个旨在向科学界免费提供大脑的MRI数据集的项目。有两个数据集:横截面和纵向集。年轻,中年,非痴呆和痴呆老年人的横断面MRI数据:此集合包括416名18至96岁的受试者的横断面集合。非痴呆和痴呆老年人的纵向MRI数据:该组纵向收集了150名年龄在60至96岁之间的受试者。两次或两次以上就诊时对每个受试者进行了扫描,相隔至少一年,共进行373次成像。

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阿尔茨海默氏病神经影像数据

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(数据集需要申请) 阿尔茨海默氏病患者和健康对照的MRI数据库。 还具有临床,基因组和生物制造商数据

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6、皮肤类

Isic Archive(黑色素瘤)

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该档案库包含分类皮肤损伤的23k图像。 它包含了恶性和良性的例子。每个示例均包含病变的图像,有关病变的元数据(包括分类和分割)以及有关患者的元数据。

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7、INbreast:数字化乳腺摄影数据库

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INbreast数据库是一个乳腺摄影数据库,其中的图像是从位于大学医院(葡萄牙波尔图的乳腺癌中心,圣若昂医院)的乳腺癌中心获取的。 INbreast共有115例(410幅图像),其中90例来自双乳女性(每例4幅图像),而25例来自乳房切除术患者(每例2幅图像)。 包括几种类型的病变(肿块,钙化,不对称和变形)。 专家还以XML格式提供了精确的轮廓。

8、前列腺癌数据集

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1、图像格式:关于数据集的某些技术方面,T2-W MRI,DCE MRI和DWI MRI,ADC将以DICOM格式交付。

2、关于MRSI数据将以RDA(西门子)或DICOM(GE)格式提供。

3、以DICOM格式提供每种形式的所有地面真实图像。

Ground Truth:

对于每种方式,都提供了一组Ground Truth。GT由四个不同类别组成:(i)前列腺,(ii)边缘区(PZ),(iii)中央腺体(CG),(iv)CaP。

9、SCR数据库(胸部X光片中的分割)

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所有胸部X光片均取自JSRT数据库,这是一个公开可用的数据库,其中包含247张PA胸片。在每幅图像中,都对肺野,心脏和锁骨进行了手动分割,以提供参考标准。

10、宫颈癌数据集

11、新冠肺炎(与肺部重合,可忽略)

论文地址:arxiv.org/abs/2003.13…

数据集地址:github.com/UCSD-AI4H/C…

蒙特利尔大学博士后Joseph Cohen:数据集地址:github.com/ieee8023/co…

Kaggle的胸部X光数据集:www.kaggle.com/paultimothy…

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