阅读 2133

读取、创建和运行多个文件的3个Python技巧

作者|Khuyen Tran 编译|VK 来源|Towards Data Science

动机

将代码投入生产时,你很可能需要处理代码文件的组织。读取、创建和运行许多数据文件非常耗时。本文将向你展示如何自动

  • 循环访问目录中的文件

  • 如果不存在嵌套文件,创建它们

  • 使用bash for loop运行一个具有不同输入的文件

这些技巧为我在数据科学项目中节省了很多时间。我希望你也会发现它们有用!

循环访问目录中的文件

如果我们要像这样读取和处理多个数据:

├── data
│   ├── data1.csv
│   ├── data2.csv
│   └── data3.csv
└── main.py
复制代码

我们可以尝试一次手动读取一个文件

import pandas as pd 

def process_data(df):
   pass

df = pd.read_csv(data1.csv)
process_data(df)

df2 = pd.read_csv(data2.csv)
process_data(df2)

df3 = pd.read_csv(data3.csv)
process_data(df3)
复制代码

当我们有3个以上的数据时,这是可以的,但不是有效的。如果我们在上面的脚本中只更改了数据,为什么不使用for循环来访问每个数据呢?

下面的脚本允许我们遍历指定目录中的文件

import os
import pandas as pd
def loop_directory(directory: str):
	'''循环目录中的文件'''

	for filename in os.listdir(directory):
		if filename.endswith(".csv"):
			file_directory = os.path.join(directory, filename)
			print(file_directory)
			pd.read_csv(file_directory)
		else:
			continue
			
if __name__=='__main__':
	loop_directory('data/')
复制代码
data/data3.csv
data/data2.csv
data/data1.csv
复制代码

以下是对上述脚本的解释

  • for filename in os.listdir(directory):循环访问特定目录中的文件
  • if filename.endswith(".csv"):访问以“.csv”结尾的文件
  • file_directory = os.path.join(directory, filename):连接父目录('data')和目录中的文件。

现在我们可以访问“data”目录中的所有文件!

如果不存在嵌套文件,创建它们

有时,我们可能希望创建嵌套文件来组织代码或模型,这使得将来更容易找到它们。例如,我们可以使用“model 1”来指定特定的特征工程。

在使用模型1时,我们可能需要使用不同类型的机器学习模型来训练我们的数据(“model1/XGBoost”)。

在使用每个机器学习模型时,我们甚至可能希望保存模型的不同版本,因为模型使用的超参数不同。

因此,我们的模型目录看起来像下面这样复杂

model
├── model1
│   ├── NaiveBayes
│   └── XGBoost
│       ├── version_1
│       └── version_2
└── model2
    ├── NaiveBayes
    └── XGBoost
        ├── version_1
        └── version_2
复制代码

对于我们创建的每个模型,手动创建一个嵌套文件可能需要很多时间。有没有办法让这个过程自动化?是的,os.makedirs(datapath)

def create_path_if_not_exists(datapath):
    '''如果不存在,则创建新文件并保存数据'''

    if not os.path.exists(datapath):
        os.makedirs(datapath) 
        
if __name__=='__main__':
create_path_if_not_exists('model/model1/XGBoost/version_1')
复制代码

运行上面的文件,你应该会看到嵌套文件'model/model2/XGBoost/version_2'自动创建!

现在你可以将模型或数据保存到新目录中!

import joblib
import os 

def create_path_if_not_exists(datapath):
    '''如果不存在就创建'''

    if not os.path.exists(datapath):
        os.makedirs(datapath) 

if __name__=='__main__':

  # 创建目录
  model_path = 'model/model2/XGBoost/version_2'
  create_path_if_not_exists(model_path)
  
  # 保存
  joblib.dump(model, model_path)
复制代码

Bash for Loop:使用不同的参数运行一个文件

如果我们想用不同的参数运行一个文件呢?例如,我们可能希望使用相同的脚本来使用不同的模型来预测数据。

import joblib

# df = ...

model_path = 'model/model1/XGBoost/version_1'
model = joblib.load(model_path)
model.predict(df)
复制代码

如果一个脚本需要很长时间才能运行,而我们有多个模型要运行,那么等待脚本运行完毕然后运行下一个脚本将非常耗时。有没有一种方法可以告诉计算机用一个命令行运行1,2,3,10,然后去做其他的事情。

是的,我们可以用for bash for loop。首先,我们使用系统argv使我们能够解析命令行参数。如果要覆盖命令行上的配置文件,也可以使用hydra等工具。

import sys
import joblib

# df = ...

model_type = sys.argv[1]
model_version = sys.argv[2]
model_path = f'''model/model1/{model_type}/version_{model_version}'''
print('Loading model from', model_path, 'for training')

model = joblib.load(model_path)
mode.predict(df)
复制代码
>>> python train.py XGBoost 1
Loading model from model/model1/XGBoost/version_1 for training
复制代码

太好了!我们刚刚告诉我们的脚本使用模型XGBoost,version 1来预测命令行上的数据。现在我们可以使用bash循环遍历模型的不同版本。

如果你可以使用Python执行for循环,那么也可以在下面这样的终端上执行

$ for version in 2 3 4
> do
> python train.py XGBoost $version
> done
复制代码

键入Enter分隔行

输出:

Loading model from model/model1/XGBoost/version_1 for training
Loading model from model/model1/XGBoost/version_2 for training
Loading model from model/model1/XGBoost/version_3 for training
Loading model from model/model1/XGBoost/version_4 for training
复制代码

现在,你可以在使用不同模型运行脚本的同时执行其他操作!多方便啊!

结论

祝贺你!你刚刚学习了如何同时自动读取和创建多个文件。你还学习了如何使用不同的参数运行一个文件。手动读、写和运行文件的时间现在可以节省下来,用于更重要的任务。

如果你对文章中的某些部分感到困惑,我在这个仓库中创建了具体的例子:github.com/khuyentran1…

原文链接:towardsdatascience.com/3-python-tr…

欢迎关注磐创AI博客站: panchuang.net/

sklearn机器学习中文官方文档: sklearn123.com/

欢迎关注磐创博客资源汇总站: docs.panchuang.net/