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生物信息学
尖尖家的大宝贝
创建于2022-01-11
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生信过程中一些学习记录
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创建于2022-01-11
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生信3--使用python搭建生信流程之python交互式运行本地化blastn
最近正好用python重新搭建流程,就展示一下python和Linux系统的互动 os是operating system(操作系统)的缩写,所以Python的os模块封装了常见的文件和目录操作。 os
生信2--利用Biopython解析genebank格式文件
Ncbi下载的文件很多是注释完的Genebank格式文件,如果只有一个菌株的全基因组注释还能人工通过查删改,如果是一个文件含有大量的菌株,就要自动化解析了。 如果只有一条记录就用Bio.SeqIO.r
生信1--从fasta文件中根据bed文件位置信息大量提取指定区域的片段
作为生信工程师,终于掌握了python面对对象编程的思路,开始磨刀霍霍使用屠龙之术。但是在此之前还是好好从简单的代码出发 好记性不如烂笔头,所以尝试记录一下成长历程 同时发布一些简单生信脚本,从简单到