首页
AI Coding
NEW
沸点
课程
直播
活动
AI刷题
APP
插件
搜索历史
清空
创作者中心
写文章
发沸点
写笔记
写代码
草稿箱
创作灵感
查看更多
会员
登录
注册
生信技工
掘友等级
获得徽章 0
动态
文章
专栏
沸点
收藏集
关注
作品
赞
0
文章 0
沸点 0
赞
0
返回
|
搜索文章
最新
热门
富集分析:(一)概述
介绍了富集分析和分析软件,包括在线富集分析工具KOBAS-i和GOEAST,富集分析R包topGO,clusterProfiler。
用k-mer分析进行基因组调查:(六)用KmerGenie一步实现
介绍KmerGenie,用KmerGenie做基因组调查(genome survey)的k-mer频数统计和基因组特征评估。
用k-mer分析进行基因组调查:(五)用GCE分步实现
介绍GCE,用GCE的kmerfreq做基因组调查(genome survey)的k-mer频数统计,GCE的gce做基因组特征评估。
用k-mer分析进行基因组调查:(四)用GenomeScope评估基因组特征+用Smudgeplot估计倍性
介绍GenomeScope,用GenomeScope做基因组调查(genome survey)的基因组特征评估。用GenomeScope1.0评估二倍体物种的基因组大小、杂合度、重复率等基因组特征。
用k-mer分析进行基因组调查(genome survey):(三)用KMC进行k-mer频数统计
介绍KMC,用KMC做基因组调查(genome survey)的k-mer频数统计。以及KMC分析后的数据处理建议。
用k-mer分析进行基因组调查:(二)用jellyfish进行k-mer频数统计
介绍jellyfish,用jellyfish做基因组调查(genome survey)的k-mer频数统计。
用k-mer分析进行基因组调查:(一)基本原理
基因组调查(genome survey)指基因组特征评估,一般指通过k-mer分析二代测序数据,获得基因组大小(genome size),杂合度(heterozygosity),重复序列比例,GC含量
关于生信技工
生信技工微信公众号用于记录生物信息学工具的学习心得,包括基本原理和操作步骤。出于个人兴趣,整理成文章便于日后查看和交流。
个人成就
文章被点赞
3
文章被阅读
10,068
掘力值
188
关注了
0
关注者
1
收藏集
0
关注标签
0
加入于
2022-06-12