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1. 测序的应用 1.1 基因组组装   当我们进行二代测序时,常常就是将待测序列打碎,然后拼接,我们回顾一些基础知识: reads：就是我们测序产生的短读序列，通常一代和三代的reads读长在几千到

1. 背景引入   本小节开始讲述转录组测序的准备工作.因为做的是有参的基因组分析,所以首先是准备参考基因组、测序数据.当数据准备完成后,接下来是比对参考基因组,表达定量,合并成表达矩阵,差异表达分析

1. 背景   在前面小节我们使用了这些软件,因为混合使用比较让人混乱,这里总结理清楚一下. 2. seqtk   功能总览如下图所示. 2.1 seq   这个功能主要是对$.fasta$和$.fa