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1年前
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单细胞分析|将 Seurat 与多模态数据结合使用
数据加载 同时测量同一细胞的多种数据类型的能力(称为多模态分析)代表了单细胞基因组学的一个令人兴奋的...
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1年前
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如何使用 Awk 打印文件中的字段和列
Awk 是一个功能强大的文本处理工具,可以有效地操作和从文件中提取信息,特别是处理结构化数据,例如日...
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1年前
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单细胞分析|在 Seurat 中使用 sctransform
单细胞 RNA-seq 数据的生物异质性常常受到测序深度等技术因素的影响。每个细胞中检测到的分子数量...
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1年前
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🔥 Mamba 被拒绝的 10 大原因,你中了几个?
Mamba 是一个开源的 Python 包管理工具,它可以让你更轻松地安装和管理 Python 包。...
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1年前
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3D-Genome | Hi-C互作矩阵归一化指南
Hi-C 是一种基于测序的方法,用于分析全基因组染色质互作。它已广泛应用于研究各种生物学问题,如基因...
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1年前
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Seurat 中的数据可视化方法
本文[1]将使用从 2,700 PBMC 教程计算的 Seurat 对象来演示 Seurat 中的可...
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1年前
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使用awk和正则表达式过滤文本或字符串 - 详细指南和示例
当我们在 Linux 中运行某些命令来读取或编辑字符串或文件中的文本时,我们经常尝试将输出过滤到感兴...
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1年前
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视觉Transformers中的位置嵌入 - 研究与应用指南
视觉 Transformer 中位置嵌入背后的数学和代码简介。 自从 2017 年推出《Attent...
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1年前
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单细胞Seurat - 降维与细胞标记(4)
本系列持续更新Seurat单细胞分析教程,欢迎关注! 非线形降维 Seurat 提供了几种非线性降维...
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1年前
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三维基因组|基因组结构 (2)
本系列将更新三维基因组相关内容,欢迎关注! 二维顺式元件 术语 cis 源自拉丁语词根“cis”,意...
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单细胞Seurat - 细胞聚类(3)
本系列持续更新Seurat单细胞分析教程,欢迎关注! 维度确定 为了克服 scRNA-seq 数据的...
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1年前
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10 个最佳 Linux 开源笔记软件
笔记应用程序允许您随时随地记录笔记,无论您是在课堂上、学习中、在某处阅读、在工作中还是在会议中。您可...
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1年前
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单细胞Seurat - 数据处理 (2)
本系列持续更新Seurat单细胞分析教程,欢迎关注! 标准化 从数据集中删除不需要的细胞后,下一步是...
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1年前
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NNLM - 神经网络语言模型 | 高效的单词预测工具
本系列将持续更新NLP相关模型与方法,欢迎关注! 简介 神经网络语言模型(NNLM)是一种人工智能模...
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1年前
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Seurat - 聚类教程 (1)
设置 Seurat 对象 在本教程[1]中,我们将分析 10X Genomics 免费提供的外周血单...
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1年前
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探索NLP中的N-grams:理解,应用与优化
简介 n-gram[1] 是文本文档中 n 个连续项目的集合,其中可能包括单词、数字、符号和标点符号...
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1年前
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三维基因组|分子生物学简介 (1)
本系列将更新三维基因组相关内容,欢迎关注! 分子生物学涉及生命从组成到活动的所有分子基础,包括DNA...
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1年前
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泛基因组比对教程
1. 简介 在本教程中,我们将把两个 Heliconius 蝴蝶物种的一条染色体(包含 optix ...
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1年前
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Linux|Grep 命令的 12 个实用示例
您是否曾经遇到过在文件中查找特定字符串或模式的任务,但不知道从哪里开始查找?那么,grep 命令可以...
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2年前
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机器学习降维技术全面对比评析
简介 在机器学习领域,处理高维数据带来了与计算效率、模型复杂性和过度拟合相关的挑战。降维技术提供了一...
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